cluster # 1180

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Schistosoma mansoni
cluster # 1180 cluster # 1180 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1180#0 length = 455 sequences # 2

consensusID : consensus_1180#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 455
fasta sequence

                              [CACAAAATATTTATTAATAGAAATAAACCGAATGAAGAACATGAAGGAGGAAGTCACAATTTATTAAGACTTTTAAGGATTCTTCTTTTTTTCGACTTTTAATAAGAATATGGTCACTTCAGTGGTTTCTAAATTTCAAATTTTCGATAATTCTTTAAGTAGTAAAG-GTTTAATATATGGTACGTT-TAATTTATTGGTACTTTTATTCAACTG-ATCATTTGATATAGACATAATAGACGGATCTTCATTCGACGTATGCAGCTGAGCTAAACTAGCTGAACGTCCATAAGATTTTAACGGATTATTTATAGATTGAATATTTGGTCCAGGTGTACTTGCTTTTCTTTTGAATGGTAGTTTAAACAAAGATTGAATACCTTTGGTTGTGGTGAATTTGTTTGAATTACTCTCGGAAACATTAAATTCTCTGGATGTATTCAAATAAACTGTATGTG]

[+] EMBL CD140849             [CACAAAATATTTATTAATAGAAATAAACCGAATGAAGAACATGAAGGAGGAAGTCACAATTTATTAAGACTTTTAAGGATTCTTCTTTTTTTCGACTTTTAATAAGAATATGGTCACTTCAGTGGTTTCTAAATTTCAAATTTTCGATAATTCTTTAAGTAGTAAAG GTTTAATATATGGTACGTT TAATTTATTGGTACTTTTATTCAACTG ATCATTTGATATAGACATAATAGACGGATCTTCATTCGACGTATGCAGCTGAGCTAAACTAGCTGAACGTCCATAAGATTTTAACGGATTATTTATAGATTGAATATTTGGTCCAGGTGTACTTGCTTTTCTTTTGAATGGTAGTTTAAACAAAGATTGAATACCTTTGGTTGTGGTGAATTTGTTTGAATTACTCTCGGAAACATTAAATTCTCTGGATGTATTCAAATAAACTGTATGTG]
[+] EMBL CD140776             [CACAAAATATTTATTAATAGAAATAAACCGAATGAAGAACATGAAGGAGGAAGTCACAATTTATTAAGATTTTTAAGGATTCTTCTTTTATTCGACTTTTAATAAAAATATGGTCACTTCAGTGGTTTCTAAATTTCAAATTTTCGATAATTCTTTAAGTAGTAAAGCGTTTAATATATGGTACGTTCTAATTTATTGGTACTTTTATTCAACTGCATCATTTGATATAGACATAATAGACGGATTTTCATTCGACGTATGCAGCTGAGCTAAACTTGCTGAACGTCCATAAGATTTTAACGGATTATTTATAGATTGAATATTTGGTCCAGGTGT                                                                                                                          ]




>consensus_1180#0
CACAAAATATTTATTAATAGAAATAAACCGAATGAAGAACATGAAGGAGGAAGTCACAAT
TTATTAAGACTTTTAAGGATTCTTCTTTTTTTCGACTTTTAATAAGAATATGGTCACTTC
AGTGGTTTCTAAATTTCAAATTTTCGATAATTCTTTAAGTAGTAAAGGTTTAATATATGG
TACGTTTAATTTATTGGTACTTTTATTCAACTGATCATTTGATATAGACATAATAGACGG
ATCTTCATTCGACGTATGCAGCTGAGCTAAACTAGCTGAACGTCCATAAGATTTTAACGG
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AAACAAAGATTGAATACCTTTGGTTGTGGTGAATTTGTTTGAATTACTCTCGGAAACATT
AAATTCTCTGGATGTATTCAAATAAACTGTATGTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case