cluster # 1213

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Schistosoma mansoni
cluster # 1213 cluster # 1213 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1213#0 length = 569 sequences # 2

consensusID : consensus_1213#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 569
fasta sequence

                              [AATTACA-TTTTTGAAAAAAAGATGA-TTGCTACATAAACATGTAGCAATTTACAATTCTCAAAAAATAATAATAATTAAGTAATATGAGTCAAATGTCATTTCTGTCCCTCACATACATTATATATTACATACAAATGAAGTTATCATAAACAAATTATCACAAACGCGCTAGTTGTCTGTTCCATAAAAAAAATTACATTTATTCCATTCACTTAAAATAATTGACAATTTAGTCCAGTTCAGAATCTTCAGTTTCCTCGATTACAGATTGCCAACCACCACGTTTATACACCCAATCTGCATACCAACGTGTAAAAAACGTAATTGTATAATCTTTGATTCGGCCTATATTTGCTCGACATTGACCAGTATCACGAATTATTGTTTCATATGTTGAATTCGATGGATATAAATTACTTTGAGGTAATTTACTTGATGAATGATAAATATGACTTCCTGATGACTGTAAATAACTTTCATCAATTTCCTCACTATCTGAATTGATATTTATCGATTGACGTAATATTGATGAACCTGAAGTTGACTCTTGTAATGTTTCCAACTTTTCT]

[+] EMBL CD076225             [AATTACA TTTTTGAAAAAAAGATGA TTGCTACATAAACATGTAGCAATTTACAATTCTCAAAAAATAATAATAATTAAGTAATATGAGTCAAATGTCATTTCTGTCCCTCACATACATTATATATTACATACAAATGAAGTTATCATAAACAAATTATCACAAACGCGCTAGTTGTCTGTTCCATAAAAAAAATTACATTTATTCCATTCACTTAAAATAATTGACAATTTAGTCCAGTTCAGAATCTTCAGTTTCCTCGATTACAGATTGCCAACCACCACGTTTATACACCCAATCTGCATACCAACGTGTAAAAAACGTAATTGTATAATCTTTGATTCGGCCTATATTTGCTCGACATTGACCAGTATCACGAATTATTGTTTCATATGTTGAATTCGATGGATATAAATTACTTTGAGGTAATTTACTTGATGAATGATAAATATGACTTCCTGATGACTGTAAATAACTTTCATCAATTTCCTCACTATCTGAATTGATATTTATCGATTGACGTAATATTGATGAACCTGAAGTTGACTCTTGTAATGTTTCCAACTTTTCT]
[+] EMBL CD076224             [AATTACATTTTTTGAAAAAAATA GATTTGCT CATAAACATGTAGCAATTTACAATTCTCAAAAAA AATAATAATTAAGTGATATGAGTCAAATGTCATTTCTGTCCCTCACATGCATTATATTTTACATACAAATGAAGATATAATAAACAAATTATCGCAAACGCGCTATTTGTCTGTTCCATAAAAAAAATTACATTTATTCCATTCACTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]




>consensus_1213#0
AATTACATTTTTGAAAAAAAGATGATTGCTACATAAACATGTAGCAATTTACAATTCTCA
AAAAATAATAATAATTAAGTAATATGAGTCAAATGTCATTTCTGTCCCTCACATACATTA
TATATTACATACAAATGAAGTTATCATAAACAAATTATCACAAACGCGCTAGTTGTCTGT
TCCATAAAAAAAATTACATTTATTCCATTCACTTAAAATAATTGACAATTTAGTCCAGTT
CAGAATCTTCAGTTTCCTCGATTACAGATTGCCAACCACCACGTTTATACACCCAATCTG
CATACCAACGTGTAAAAAACGTAATTGTATAATCTTTGATTCGGCCTATATTTGCTCGAC
ATTGACCAGTATCACGAATTATTGTTTCATATGTTGAATTCGATGGATATAAATTACTTT
GAGGTAATTTACTTGATGAATGATAAATATGACTTCCTGATGACTGTAAATAACTTTCAT
CAATTTCCTCACTATCTGAATTGATATTTATCGATTGACGTAATATTGATGAACCTGAAG
TTGACTCTTGTAATGTTTCCAACTTTTCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case