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Schistosoma mansoni
cluster # 1276 cluster # 1276       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1276#0 length = 770 sequences # 2  

consensusID : consensus_1276#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 770
fasta sequence
                              [GAAGACAGAGTGACTACTAACCACACAGAACGTGATTTCTTACAACCGTTAATTCACCTAAGTGATTTATCCAATGCTATTTATGACTTGCCAGGATTGTCCTAGAAAATTGGAGGTCGAACGCTACATTAAAGATCTTATTATTGATGAAATGCTTCAGAACTTGGCCTCTTCGTTGTTCTATCAAATGCCAGCTTTCTAACCAAGGCTATAGTCACATTGGTGGAGTGGATATGGCTAGTCTACTGGGTCCATTCCTGGCAGATATCTTCATGGTAAACCTAGAACAAACAGTGGTGAAATCAGTAATGAATGATGCAACGTTGTACGTCAGAAAATCCAAAACAATATTTAATTGAACAATTACAATTATTAAAAGCTTCACGAGATGAATTCGCAGAACCGCCAACATTGTTTACTGAAAATAATGCCGAGACAATATTCAACATGCTTGATCCATGTAAAAAGAATTCAATTCCTTCAGATCGATATCAACATGCTTTGGAAACATTGAGGGTACTTCAATGTGGTAAAGTGCTAGACAGCAAGGATGAATTCATAAGTAAAGATATGTATATGAATGTCGTTAAAACAGGTTTGAAACAAATGGCATCAACTTATAAACCAATTGGATAAGTCGCGGGAAAAAGAAAGTGGTAACAAAGAAGATTCACATTTGAATTGATGATGATAATAATGTATTGTATAACAATAAAGTAACGGTGTGTAATGTGACTTAAATAAAAAATTGATGTAAATTAAACTTTTCT]

[+] EMBL CD082794             [GAAGACAGAGTGACTACTAACCACACAGAACGTGATTTCTTACAACCGTTAATTCACCTAAGTGATTTATCCAATGCTATTTATGACTTGCCAGGATTGTCCTAGAAAATTGGAGGTCGAACGCTACATTAAAGATCTTATTATTGATGAAATGCTTCAGAACTTGGCCTCTTCGTTGTTCTATCAAATGCCAGCTTTCTAACCAAGGCTATAGTCACATTGGTGGAGTGGATATGGCTAGTCTACTGGGTCCATTCCTGGCAGATATCTTCATGGTAAACCTAGAACAAACAGTGGTGAAATCAGTAATGAATGATGCAACGTTGTACGTCAGAAAATCCAAAACAATATTTAATTGAACAATTACAATTATTAAAAGCTTCACGAGATGAATTCGCAGAACCGCCAACATTGTTTACTGAAAATAATGCCGAGACAATATTCAACATGCTTGATCCATGTAAAAAGAATTCAATTCCTTCAGATCGATATCAACATGCTTTGGAAACATTGAGGGTACTTCAATGTGGTAAAGTGCTAGACAG                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD076387             [                                                                                                                                                                                                                                                                                      AACCTAGAACAAACAGTGGTGAAATCAGTAATGAATGATGCAACGTTGTACGTCAGAAAATCCAAACCAATATTTAATTGAACAATTACAATTATTAAAAGCTTCACGAGATGAATTCGCAGAACCGCCAACATTGTTTACTGAAAATAATGCCGAGACAATATTCAACATGCTTGATCCATGTAAAAAGAATTCAATTCCTTCAGATCGATATCAACATGCTTTGGAAACATTGGGGGTACTTCAATGTGGTAAGGTGCTAGACAGCAAGGATGAATTCATAAGTAAAGATATGTATATGAATGTCGTTAAAACAGGTTTGAAACAAATGGCATCAACTTATAAACCAATTGGATAAGTCGCGGGAAAAAGAAAGTGGTAACAAAGAAGATTCACATTTGAATTGATGATGATAATAATGTATTGTATAACAATAAAGTAACGGTGTGTAATGTGACTTAAATAAAAAATTGATGTAAATTAAACTTTTCT]


>consensus_1276#0 GAAGACAGAGTGACTACTAACCACACAGAACGTGATTTCTTACAACCGTTAATTCACCTA AGTGATTTATCCAATGCTATTTATGACTTGCCAGGATTGTCCTAGAAAATTGGAGGTCGA ACGCTACATTAAAGATCTTATTATTGATGAAATGCTTCAGAACTTGGCCTCTTCGTTGTT CTATCAAATGCCAGCTTTCTAACCAAGGCTATAGTCACATTGGTGGAGTGGATATGGCTA GTCTACTGGGTCCATTCCTGGCAGATATCTTCATGGTAAACCTAGAACAAACAGTGGTGA AATCAGTAATGAATGATGCAACGTTGTACGTCAGAAAATCCAAAACAATATTTAATTGAA CAATTACAATTATTAAAAGCTTCACGAGATGAATTCGCAGAACCGCCAACATTGTTTACT GAAAATAATGCCGAGACAATATTCAACATGCTTGATCCATGTAAAAAGAATTCAATTCCT TCAGATCGATATCAACATGCTTTGGAAACATTGAGGGTACTTCAATGTGGTAAAGTGCTA GACAGCAAGGATGAATTCATAAGTAAAGATATGTATATGAATGTCGTTAAAACAGGTTTG AAACAAATGGCATCAACTTATAAACCAATTGGATAAGTCGCGGGAAAAAGAAAGTGGTAA CAAAGAAGATTCACATTTGAATTGATGATGATAATAATGTATTGTATAACAATAAAGTAA CGGTGTGTAATGTGACTTAAATAAAAAATTGATGTAAATTAAACTTTTCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)