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Schistosoma mansoni
cluster # 1366 cluster # 1366       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1366#0 length = 617 sequences # 2  

consensusID : consensus_1366#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 617
fasta sequence
                              [ACCTAACAGAAAATGGTAAACAGTTAATCACACTATAGGATGGGATAGAAAAATCTTAAAGCGAATGTATGC-C-T-ACTTATTTAATTAGTGAATAAGAGATTATGAATTAATTACTCTATCAAGCTACTACTTTCACTTAGTCTTTTAATAACAATGTACATAAATACCGAATGGCTTAAATTTGATTTCA-TTGAAATCATGAGTCGATCACAGTTAAACGACCATTGAAAAATTGGAAGCACTGGGCGGTCGTTTAGTTTTAGTATGAGACTAATTGTAATAATTCCTTATTATTGTTAAATGAGTCACTATGTTACATCTCAGCCTTATATCGATGATATTAGTGCAAATTAGTGTACTTAAAGTGTGAAAGCAATTTTGTCATCAGATGATCAAGTAAACTGTTCAATAGATAACAAACGCATGATTTGAAGATAACCATTCCCTCTCAGTGTTCAGTAAAAGTACAATATCTAGTACTTTCGATCGTTTTTCCATTCATTTAGTGCGTCAGTGTGACATGTAAGAGTGTAATTTACACTGAGGGCCTCATTNTAATCATATAGAGCTGTCTCTTTATATCTTCTGGTTACACGCTACTGTATCGCATTCCAACT]

[+] EMBL CD131416             [ACCTAACAGAAAATGGTAAACAGTTAATCACACTATAGGATGGGATAGAAAAATCTTAAAGCGAATGTATGC C T ACTTATTTAATTAGTGAATAAGAGATTATGAATTAATTACTCTATCAAGCTACTACTTTCACTTAGTCTTTTAATAACAATGTACATAAATACCGAATGGCTTAAATTTGATTTCA TTGAAATCATGAGTCGATCACAGTTAAACGACCATTGAAAAATTGGAAGCACTGGGCGGTCGTTTAGTTTTAGTATGAGACTAATTGTAATAATTCCTTATTATTGTTAAATGAGTCACTATGTTACATCTCAGCCTTATATCGATGATATTAGTGCAAATTAGTGTACTTAAAGTGTGAAAGCAATTTTGTCATCAGATGATCAAGTAAACTGTTCAATAGATAACAAACGCATGATTTGAAGATAACCATTCCCTCTCAGTGTTCAGTAAAAGTACAATATCTAGTACTTTCGATCGTTTTTCCATTCATTTAGTGCGTCAGTGTGACATGTAAGAGTGTAATTTACACTGAGGGCCTCATTNTAATCATATAGAGCTGTCTCTTTATATCTTCTGGTTACACGCTACTGTATCGCATTCCAACT]
[+] EMBL CD131250             [ACCTAACAGAAAATGGTAAACAGTTAATCACACTATAGGATGGGATAGAAAAATCTTAAAGCGAATGTATGCGCGTGACTTATTTAATTAGTGAATAAGAGATTATGAATTAATTACTCTATCAAGCTACTACTTTCACTTAGTCTTTTAATAACAATGTACATAAATACCGAATGGCTTAAATTTGATTTCACTAGAAATCATGAGTCGATCACAGTTAAACGACCATTGAAAAATTGGAAGCACTGGGCGGTCGTTTAGTTTTAGTATGAGACTAATTGTAATAATTCCTTATTATTGTTAAATGAGTTACTATGTTACATCTCAGCCTTATATCGATGATATTAGTGCAAATTAGTGTACTTAAAGTGTGAAAGCAATTTTGTCATCAGATGATCAAGTAAACTGTTCAATAGATAACAAACGCATGATTTGAAGATAACCATTCCCTCTCAGTGTTCAGTAAAAGTACAATATCTAGTACTTTCGATCGTTTTTCCATTCATTTAGTGCGTCAGTGTGACATGTAAGAGTGTAATTTACACTGAGGGCCTCATTTTAATCATATAGAGCTGTCTC TTATATCTTCT GTTACACGCTACTGTATCGCATTCCA   ]


>consensus_1366#0 ACCTAACAGAAAATGGTAAACAGTTAATCACACTATAGGATGGGATAGAAAAATCTTAAA GCGAATGTATGCCTACTTATTTAATTAGTGAATAAGAGATTATGAATTAATTACTCTATC AAGCTACTACTTTCACTTAGTCTTTTAATAACAATGTACATAAATACCGAATGGCTTAAA TTTGATTTCATTGAAATCATGAGTCGATCACAGTTAAACGACCATTGAAAAATTGGAAGC ACTGGGCGGTCGTTTAGTTTTAGTATGAGACTAATTGTAATAATTCCTTATTATTGTTAA ATGAGTCACTATGTTACATCTCAGCCTTATATCGATGATATTAGTGCAAATTAGTGTACT TAAAGTGTGAAAGCAATTTTGTCATCAGATGATCAAGTAAACTGTTCAATAGATAACAAA CGCATGATTTGAAGATAACCATTCCCTCTCAGTGTTCAGTAAAAGTACAATATCTAGTAC TTTCGATCGTTTTTCCATTCATTTAGTGCGTCAGTGTGACATGTAAGAGTGTAATTTACA CTGAGGGCCTCATTNTAATCATATAGAGCTGTCTCTTTATATCTTCTGGTTACACGCTAC TGTATCGCATTCCAACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)