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Schistosoma mansoni
cluster # 1954 cluster # 1954       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1954#0 length = 855 sequences # 2  

consensusID : consensus_1954#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 855
fasta sequence
                              [TATTTTTGATGGGTCAAATTACGATGAAGGTTAATGCAATACACCGTATGGATAGGTCATTAAATTCAGATGCCTCAAGAGTTACTTGCTCTTAATCTGGAAGTTTGTTTCCATGAGATTTCTGAATTCGTGAGAGAACTAAATCCACCAGAATGGCTGGTGCATAACATTTTTTCTGATACTTAAGAAGCGACGCGAATAGATGTCATAACATGAATGGGATACCACCTTGCATGAAAAGTGGACTCTTGTTATGTTCGTCTGTTCATAAGTCTAGTGAGATCAGGAATCGTCAAGTAGTTAGCTGAGAACTTAGTTTTAATGGTTAGACAATAATAGTTGATAGTATATATCCTACCTCAAAGTAACTGAGTGATAAATTTATTGAAGAATATATTAAATTTTAGAGAAAAGCTCATTGACGTCTGATATTATGGAATTTTAATAAGTTTTGAACAGATCCAACAGATCTACTGAATTATTTTAAGAAGCGACGCTTCTACACCAATGTAAAAGAACAAAAACCGATCACATCACAGCGTTTCTGTTCCAGTATAATTCAGGTTTGTAATTTCTAGAGAAATGAAGACGTGTGCTTGATGCTGCAGCCACGAATTCCACTGCAGCATGGCGGTAAATGGATATGTAAGAGTATTTTACTGAAAAATAGCAGTTGTTGCACTGGTTTCTGCGATGCAGTTCATAACGGCGCGCGACTGAATATAATGGATTCTTGTGTGGAGTACCATTAAAAGTGCACTACAGTAGATGAATGACCTACCAATTTTAAAACTATGATTCGGATGCTAAGTATAATTTGAGGATGCCTATAATTTAGCAACTATACTATAATGA]

[+] EMBL CD080423             [TATTTTTGATGGGTCAAATTACGATGAAGGTTAATGCAATACACCGTATGGATAGGTCATTAAATTCAGATGCCTCAAGAGTTACTTGCTCTTAATCTGGAAGTTTGTTTCCATGAGATTTCTGAATTCGTGAGAGAACTAAATCCACCAGAATGGCTGGTGCATAACATTTTTTCTGATACTTAAGAAGCGACGCGAATAGATGTCATAACATGAATGGGATACCACCTTGCATGAAAAGTGGACTCTTGTTATGTTCGTCTGTTCATAAGTCTAGTGAGATCAGGAATCGTCAAGTAGTTAGCTGAGAACTTAGTTTTAATGGTTAGACAATAATAGTTGATAGTATATATCCTACCTCAAAGTAACTGAGTGATAAATTTATTGAAGAATATATTAAATTTTAGAGAAAAGCTCATTGACGTCTGATATTATGGAATTTTAATAAGTTTTGAACAGATCCAACAGATCTACTGAATTATTTTAAGAAGCGACGCTTCTACACCAATGTAAAAGAACAAAAACCGATCACATCACAGCGTTTCTGTTCCAGTATAATTCAGGTTTGTAATTTCTAGAGAAATGAAGACGTGTGCTTGATGCTGCAGCCACGAATTCCACTGCAGCATGGCGGTAAATGGATATGTAAGAGTATTTTACTGAAAAATAGCAGTTGTTGCACTGGTTTCTGC                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD197370             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTAAAAGAACAAAAACCGATCACATCACAGCG TTCTGTTCCAGTATAATTCAGGTTTGTAATTTCTAGAGAAATGAAGACGTGTGCTTGATGCTGCAGCCACGAATTCCACTGCAGCATGGCGGTAAATGGATATGTAAGAGTATTTTACTGAAAAATAGCAGTTGTTGCACTGTTTTCTGCGATGCAGTTCATAACGGCGCGCGACTGAATATAATGGATTCTTGTGTGGAGTACCATTAAAAGTGCACTACAGTAGATGAATGACCTACCAATTTTAAAACTATGATTCGGATGCTAAGTATAATTTGAGGATGCCTATAATTTAGCAACTATACTATAATGA]


>consensus_1954#0 TATTTTTGATGGGTCAAATTACGATGAAGGTTAATGCAATACACCGTATGGATAGGTCAT TAAATTCAGATGCCTCAAGAGTTACTTGCTCTTAATCTGGAAGTTTGTTTCCATGAGATT TCTGAATTCGTGAGAGAACTAAATCCACCAGAATGGCTGGTGCATAACATTTTTTCTGAT ACTTAAGAAGCGACGCGAATAGATGTCATAACATGAATGGGATACCACCTTGCATGAAAA GTGGACTCTTGTTATGTTCGTCTGTTCATAAGTCTAGTGAGATCAGGAATCGTCAAGTAG TTAGCTGAGAACTTAGTTTTAATGGTTAGACAATAATAGTTGATAGTATATATCCTACCT CAAAGTAACTGAGTGATAAATTTATTGAAGAATATATTAAATTTTAGAGAAAAGCTCATT GACGTCTGATATTATGGAATTTTAATAAGTTTTGAACAGATCCAACAGATCTACTGAATT ATTTTAAGAAGCGACGCTTCTACACCAATGTAAAAGAACAAAAACCGATCACATCACAGC GTTTCTGTTCCAGTATAATTCAGGTTTGTAATTTCTAGAGAAATGAAGACGTGTGCTTGA TGCTGCAGCCACGAATTCCACTGCAGCATGGCGGTAAATGGATATGTAAGAGTATTTTAC TGAAAAATAGCAGTTGTTGCACTGGTTTCTGCGATGCAGTTCATAACGGCGCGCGACTGA ATATAATGGATTCTTGTGTGGAGTACCATTAAAAGTGCACTACAGTAGATGAATGACCTA CCAATTTTAAAACTATGATTCGGATGCTAAGTATAATTTGAGGATGCCTATAATTTAGCA ACTATACTATAATGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)