Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 2045 cluster # 2045       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2045#0 length = 529 sequences # 2  
consensusID : consensus_2045#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 529
fasta sequence 
                              [TATATTTAAAACCTACACAATAAACTTGTTTTTTGTCTAAGTATCTACTAAGTATGACAATATCGATTCCGAAAATTCCAAATAGTTAATTCATTTCATACTTCAAATCGTTATTATTAGCATTGACTACATAATTGGATAATTTAATATTGAATATTGCCAATGAAATACAGATAAATGCGATGAGGAAGCTATGTGACTCCTCATCAGTGCTTATCCACCACCCAATATCTGGGAAACAAACTCGGTACCTTAGGTGTTCCAGGTGAATGCTAGATGTCTAGACAACTGAATCAACGGGGTAGTATCATCAGACTTAAAATGTGACTCATAACCAACTACCTGATGAATGAGTTAATTAAAATTAATTAATTTAATTGGATAAGCAAGTCCTAAGGTACAATGTGACTTCCTTTATCTACTTAATCCGTTCGATGTTGTTATATCACAATACCGTTTTCTTTTTTGTTTACAGCAATTTTTGTGAAAAATTAAGTTTTGGAAATTTCTCTTAATTTCTTGTTATTTC]

[+] EMBL CD165676             [TATATTTAAAACCTACACAATAAACTTGTTTTTTGTCTAAGTATCTACTAAGTATGACAATATCGATTCCGAAAATTCCAAATAGTTAATTCATTTCATACTTCAAATCGTTATTATTAGCATTGACTACATAATTGGATAATTTAATATTGAATATTGCCAATGAAATACAGATAAATGCGATGAGGAAGCTATGTGACTCCTCATCAGTGCTTATCCACCACCCAATATCTGGGAAACAAACTCGGTACCTTAGGTGTTCCAGGTGAATGCTAGATGTCTAGACAACTGAATCAACGGGGTAGTATCATCAGACTTAAAATGTGACTCATAACCAACTACCTGATGAATGAGTTAATTAAAATTAATTAATTTAATTGGATAAGCAAGTCCTAAGGTACAATGTGACTTCCTTTATCTACTTAATCCGTTCGATGTTGTTATATCACAATACCGTTTTCTTTTTTGTTTACAGCAATTTTTGTGAAAAATTAAGTTTTGGAAATTTCTCTTAATTTCTTGTTATTTC]
[+] EMBL CD165603             [TATATTTAAAACCTACACAATAAACTTGTTTTTTGTCTAAGTATCTACTAAGTATGACAATATCGATTCCGAAAATTCCAAATAGTTAATTCATTTCATACTTCAAATCGTTATTATTAGCATTGACTACATAATTGGATAATTTAATATTGAATATTGCCAATGAAATTCAGATAAATGCGATGAGGAAGCTATGTGACTCCTCATCAGTGCTTATCCACCACCCAATATCTGGGAAACAAACTCGGTACCTTAGGTGTTCCAGGTGAATGCTAGATGTCTAGACAACTGAATCAACGGGGTAGTATCATCAGACTTAAAATGTGACTCATAACCAACTACCTGATGAATGAGTCAATTAAAATTAATTAATTTAATTGGATAAGCAAGTCCTAAGGTACAATGTGACTTCCTTTATCTACTTAATCCGTTCGATGTTGTTATATCACAATACCGTTTTCTTTTTTGTTTACAGCAATTTTTGTGAAAAATTAAGTTTTGGGAAATTCTCTTAATTTCTTGTTATTTC]




>consensus_2045#0
TATATTTAAAACCTACACAATAAACTTGTTTTTTGTCTAAGTATCTACTAAGTATGACAA
TATCGATTCCGAAAATTCCAAATAGTTAATTCATTTCATACTTCAAATCGTTATTATTAG
CATTGACTACATAATTGGATAATTTAATATTGAATATTGCCAATGAAATACAGATAAATG
CGATGAGGAAGCTATGTGACTCCTCATCAGTGCTTATCCACCACCCAATATCTGGGAAAC
AAACTCGGTACCTTAGGTGTTCCAGGTGAATGCTAGATGTCTAGACAACTGAATCAACGG
GGTAGTATCATCAGACTTAAAATGTGACTCATAACCAACTACCTGATGAATGAGTTAATT
AAAATTAATTAATTTAATTGGATAAGCAAGTCCTAAGGTACAATGTGACTTCCTTTATCT
ACTTAATCCGTTCGATGTTGTTATATCACAATACCGTTTTCTTTTTTGTTTACAGCAATT
TTTGTGAAAAATTAAGTTTTGGAAATTTCTCTTAATTTCTTGTTATTTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)