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Schistosoma mansoni
cluster # 2134 cluster # 2134       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2134#0 length = 643 sequences # 2  

consensusID : consensus_2134#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 643
fasta sequence
                              [TTGAAGACCAATTTAGCCAATTTTGTACCTTCTATATTTTAACTTTTATTACTCCTGTTTATCTTAAGATACTAATAAAGAGGTTCTCAATTAATTGATCTACCTTAAAAATCTATCTGTCAAATTTCTCACTTATGTGCAATAACCAGTTTTTTTCGTTTGGTTATTTTTTTGTTTTGTTTGGTTTTTTATACCAATAAATTTAAGCCAATTTTTATTTTTAGCTGTCACTGCCTATTTATTCTTTATTAATTAACGCTGATTACGTATGCGGTTTCTATCGTTTTGGTCTTTGTTTTTTCTACGGATTTTTCATCTGTTTCAGTCACGCTACTCAGCTATTTTTATATCAGTTGATTTACTATATATACATATAAGACTAAAAAAATATTTTTCTTTATTACTACTAGTGTAAGTACTATTACTACTACTTATCTCGTTATTATAATTACCATTCGTGAACATTATCACAAATGTTCGTAGTCTGCATTCGGGCGTTCCTAGGTCATATTTGTAACTGTTGGCGTTTTTATTCCAATTTATTTATTCATTCAATTTCCTCTTCTAGTTNTGATTGACTATCCTCTTTTTGGTTTTGTATTGTTATTGCTGTCGTTCCTGACATCTTCACTTATTGTTGTTG]

[+] EMBL CD082955             [TTGAAGACCAATTTAGCCAATTTTGTACCTTCTATATTTTAACTTTTATTACTCCTGTTTATCTTAAGATACTAATAAAGAGGTTCTCAATTAATTGATCTACCTTAAAAATCTATCTGTCAAATTTCTCACTTATGTGCAATAACCAGTTTTTTTCGTTTGGTTATTTTTTTGTTTTGTTTGGTTTTTTATACCAATAAATTTAAGCCAATTTTTATTTTTAGCTGTCACTGCCTATTTATTCTTTATTAATTAACGCTGATTACGTATGCGGTTTCTATCGTTTTGGTCTTTGTTTTTTCTACGGATTTTTCATCTGTTTCAGTCACGCTACTCAGCTATTTTTATATCAGTTGATTTACTATATATACATATAAGACTAAAAAAATATTTTTCTTTATTACTACTAGTGTAAGTACTATTACTACTACTTATCTCGTTATTATAATTACCATTCGTGAACATTATCACAAATGTTCGTAGTCTGCATTCGGGCGTTCCTAGGTCATATTTGTAACTGTTGGCGTTTTTATTCCAATTTATTTATTCATTCAATTTCCTCTTCTAGTTNTGATTGACTATCCTCT                                                        ]
[-] EMBL CD091473             [                                                                                                                                                                                                                                                          AATTAACGCTGATTACGTATGCGGTTTCTATCGTTTTGGTCTTTGTTTTTTCTACGGATTTTTCATCTGTTTCAGTCACGCTACTCAGCTATTTTTATATCAGTTGATTTACTATATATACATATAAGACTAAAAAAATATTTTTCTTTATTACTACTAGTGTAAGTACTATTACTACTACTTATCTCGTTATTATAATTACCATTCGTGAACATTATCACAAATGTTCGTAGTCTGCATTCGGGCGTTCCTAGGTCATATTTGTAACTGTTGGCGTTTTTATTCCAATTTATTTATTCATTCAATTTCCTCTTCTAGTTTTGATTGACTATCCTCTTTTTGGTTTTGTATTGTTATTGCTGTCGTTCCTGACATCTTCACTTATTGTTGTTG]


>consensus_2134#0 TTGAAGACCAATTTAGCCAATTTTGTACCTTCTATATTTTAACTTTTATTACTCCTGTTT ATCTTAAGATACTAATAAAGAGGTTCTCAATTAATTGATCTACCTTAAAAATCTATCTGT CAAATTTCTCACTTATGTGCAATAACCAGTTTTTTTCGTTTGGTTATTTTTTTGTTTTGT TTGGTTTTTTATACCAATAAATTTAAGCCAATTTTTATTTTTAGCTGTCACTGCCTATTT ATTCTTTATTAATTAACGCTGATTACGTATGCGGTTTCTATCGTTTTGGTCTTTGTTTTT TCTACGGATTTTTCATCTGTTTCAGTCACGCTACTCAGCTATTTTTATATCAGTTGATTT ACTATATATACATATAAGACTAAAAAAATATTTTTCTTTATTACTACTAGTGTAAGTACT ATTACTACTACTTATCTCGTTATTATAATTACCATTCGTGAACATTATCACAAATGTTCG TAGTCTGCATTCGGGCGTTCCTAGGTCATATTTGTAACTGTTGGCGTTTTTATTCCAATT TATTTATTCATTCAATTTCCTCTTCTAGTTNTGATTGACTATCCTCTTTTTGGTTTTGTA TTGTTATTGCTGTCGTTCCTGACATCTTCACTTATTGTTGTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)