Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 2153 cluster # 2153       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2153#0 length = 443 sequences # 2  
consensusID : consensus_2153#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 443
fasta sequence 
                              [TCGACTTTANAGGATCCCCGAC-AGTTGACCGAATATCGAATGGTGATTGTTAGTGGGGTGTTGACAGGTGAATCACAATGACAAAGCTCACCATGGTTATGGTGATCATGAACTGCTCAGCCATGTCTATCCATGACAAATGCGAATTGATCGTGAATGAGTGAATGAATGTTCATCGATGGCGACCAGCGTGTTGTTGACTCGGACTCGACAGAGAATGTGTGTTCATAGGACGTGTTGATGAGAAGACTATAGTGAATGTGAATGACTGTGTGCATTGGTCACATCCAGTCAGTATAGTTGGTTGTGTTTGTCGTGGGAGTTGCACGTTGCGGAGTAATTTGTGCGTGCACGTCCACCCCGACGTGAATGATGTTGCGGTGATACGTGCGTATTTTCGGATGGGATGATGAATGACGGTGTTATTGTGATAGTGTAGGTCA]

[+] EMBL CD166282             [TCGACTTTANAGGATCCCCGAC AGTTGACCGAATATCGAATGGTGATTGTTAGTGGGGTGTTGACAGGTGAATCACAATGACAAAGCTCACCATGGTTATGGTGATCATGAACTGCTCAGCCATGTCTATCCATGACAAATGCGAATTGATCGTGAATGAGTGAATGAATGTTCATCGATGGCGACCAGCGTGTTGTTGACTCGGACTCGACAGAGAATGTGTGTTCATAGGACGTGTTGATGAGAAGACTATAGTGAATGTGAATGACTGTGTGCATTGGTCACATCCAGTCAGTATAGTTGGTTGTGTTTGTCGTGGGAGTTGCACGTTGCGGAGTAATTTGTGCGTGCACGTCCACCCCGACGTGAATGATGTTGCGGTGATACGTGCGTATTTTCGGATGGGATGATGAATGACGGTGTTATTGTGATAGTGTAGGTCA]
[+] EMBL CD166283             [              TCCCCGACAACTTGACCGAATATCGAATGGTGATTGGAAGTGGGGTGTTGACAGGTGAATCACAATGACAAAGCTCACCATGGTTATGGTGATCATGAACTGCTCAGCCATGTCTATCCATGACAAATGCGAATTGATCGTGAATGAGTGAATGAATGTTCATCGATGGCGACCAGCGTGTTGTTGACTCGGACTCGACAGAGAATGTGTGTTCATAGGACGTGTTGATGAAAAAACTATAGTGAATGTGAATGACTGTGTGCATTGGTCACATCCAGTCAGTATAGTTGGTTGTGTTTGTCGTGGGAGTTGCACGTTGCGGAGTAATTTGTGCGTGCACGTCCACCCCGACGTGAATGATGTTGCGGTGATACGTGCGTATTTTCGGATGGGATGATGAATGACGGTGTTATTGTGATAGTGTAGGTCA]




>consensus_2153#0
TCGACTTTANAGGATCCCCGACAGTTGACCGAATATCGAATGGTGATTGTTAGTGGGGTG
TTGACAGGTGAATCACAATGACAAAGCTCACCATGGTTATGGTGATCATGAACTGCTCAG
CCATGTCTATCCATGACAAATGCGAATTGATCGTGAATGAGTGAATGAATGTTCATCGAT
GGCGACCAGCGTGTTGTTGACTCGGACTCGACAGAGAATGTGTGTTCATAGGACGTGTTG
ATGAGAAGACTATAGTGAATGTGAATGACTGTGTGCATTGGTCACATCCAGTCAGTATAG
TTGGTTGTGTTTGTCGTGGGAGTTGCACGTTGCGGAGTAATTTGTGCGTGCACGTCCACC
CCGACGTGAATGATGTTGCGGTGATACGTGCGTATTTTCGGATGGGATGATGAATGACGG
TGTTATTGTGATAGTGTAGGTCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)