cluster # 2402

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Schistosoma mansoni
cluster # 2402 cluster # 2402 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2402#0 length = 530 sequences # 2

consensusID : consensus_2402#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 530
fasta sequence

                              [GTATGAAACTTATTGCA-TGAAACTTCTACGCTTTCACTATGAAGTTGTAAAAATGTCAACGACTGACTTATTTCATCTGAAGAAACCTTTTTCTCAGTTGATAATTTGTTGATTTCAAGATCAGTGGATGGTTTTTCACTATCATTTGACATTTCTTTAGTTA-GTTGATCAAAATCATATTTCCTATTCGATGAATTATCTATCTTATTGGTAAGCTCACTTGATAATGCTAATGTCCAATTTCGACGTGAATTATCCAACAAATAATCGTCCAAGTTTCGTGTGTTACTCAAATCTGATTTCAAGTATAATGGTTTCATATCTTCATGTGATGTTTCCGTATTTGATGAGGAGATTTGTTTCACTTGGGTCGAAGGCACTGATTGATTATTCTCTAATTGATCACTGACGGACCCATTAGGTGAACCGACACTCAATCGTTCATCTATGCGTACATCATGTGCATGATCGGGAGTAATTAATGGATCCCTCTTTTGTTGCTTGAATAATGTAAAAGCTTGAGTGGAAGA]

[+] EMBL CD116261             [GTATGAAACTTATTGCA TGAAACTTCTACGCTTTCACTATGAAGTTGTAAAAATGTCAACGACTGACTTATTTCATCTGAAGAAACCTTTTTCTCAGTTGATAATTTGTTGATTTCAAGATCAGTGGATGGTTTTTCACTATCATTTGACATTTCTTTAGTTA GTTGATCAAAATCATATTTCCTATTCGATGAATTATCTATCTTATTGGTAAGCTCACTTGATAATGCTAATGTCCAATTTCGACGTGAATTATCCAACAAATAATCGTCCAAGTTTCGTGTGTTACTCAAATCTGATTTCAAGTATAATGGTTTCATATCTTCATGTGATGTTTCCGTATTTGATGAGGAGATTTGTTTCACTTGGGTCGAAGGCACTGATTGATTATTCTCTAATTGATCACTGACGGACCCATTAGGTGAACCGACACTCAATCGTTCATCTATGCGTACATCATGTGCATGATCGGGAGTAATTAATGGATCCCTCTTTTGTTGCTTGAATAATGTAAAAGCTTGAGTGGAAGA]
[+] EMBL CD065375             [   TGAAACTTATTGCACCGAAACTTCTACGCTTTCACTATGAAGTTGTAAAAATGTCAACGACTGACTTATTTCATCTGAAGAAACCTTTTTCTCAGNTGATAATTTGTTGATTTCAAGATCAGTGGATGGTTTTTCACTATCATTCGACATTTCTTTAGTTACGTTGATCAAAATCATATTTCCTTTTCGATGAATTATCTATCTTATTGGTAAGCTCACTTGATAATGCTAATGCCCAATTTCGACGTGAATTATCCAACAAATAATCGTCCAAGTTTCGCGTGTTAC                                                                                                                                                                                                                                                 ]




>consensus_2402#0
GTATGAAACTTATTGCATGAAACTTCTACGCTTTCACTATGAAGTTGTAAAAATGTCAAC
GACTGACTTATTTCATCTGAAGAAACCTTTTTCTCAGTTGATAATTTGTTGATTTCAAGA
TCAGTGGATGGTTTTTCACTATCATTTGACATTTCTTTAGTTAGTTGATCAAAATCATAT
TTCCTATTCGATGAATTATCTATCTTATTGGTAAGCTCACTTGATAATGCTAATGTCCAA
TTTCGACGTGAATTATCCAACAAATAATCGTCCAAGTTTCGTGTGTTACTCAAATCTGAT
TTCAAGTATAATGGTTTCATATCTTCATGTGATGTTTCCGTATTTGATGAGGAGATTTGT
TTCACTTGGGTCGAAGGCACTGATTGATTATTCTCTAATTGATCACTGACGGACCCATTA
GGTGAACCGACACTCAATCGTTCATCTATGCGTACATCATGTGCATGATCGGGAGTAATT
AATGGATCCCTCTTTTGTTGCTTGAATAATGTAAAAGCTTGAGTGGAAGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case