cluster # 27

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Schistosoma mansoni
cluster # 27 cluster # 27 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_27#0 length = 786 sequences # 2

consensusID : consensus_27#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 786
fasta sequence

                              [CTCCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGTTCATTAATGTATGTCTTATTTTGGCCTTCGTAAAATGTCATAATTATGGATTTATAACCGCAAAGCCTGATGAAGTTATTGAAAAACATTATTCGCTCAAATGGTTCGCAGATGTTTTATTTACATATTAACACATTTCCATTCAAGTTTCATCACAATTTCGGTGGGGCTTCATTCCCTGTGCTAGATGGTCAAATCATGGAGCTTTTATTGGTTTTTTGATTAACATCACCATCACAAACTTCAGGTAGGGGTGATGTATTTAATTTTTTCCACATATGACTAACAACTAATTTTGTCGACATCGAGCTTGATTGGTTCTTGTCGCCTTTTAAACTGTCATTACTTGACTTTTTATTCTGGTTCTATCTCCATCTGATCTGATTTTTGGTTCTTTATTTGTCCATGGTTTTTTGACTGGTTGATAAATTGGATTAATTTCTATGTGGCTGCTAATTGCTGATTGACCTGAGTGTCAAGCTTCTAAAAATTATTTGCTGTTCTTTCTGTCTAAGATATGAACATTCTTCCAGTTGAGTGTATGTCCACAATTGACCACATGTACTGAGCTCTGGTCCATATATCTCAATCACCTTTGTCAAGATTACCAAACCTTCTGATATGAATATTTTCTCTAGCTTCCTCTTTTGGTCGTCCGTGATGTGTTGGTATTTGCTTGCTATTTTGCTCAGTATTTCCTCATCCCCGTGAGCCACTTGTGCATGCATGCATCATTAAAAATATTGGGTATNNTAATGA]

[+] EMBL CD079889             [CTCCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGTTCATTAATGTATGTCTTATTTTGGCCTTCGTAAAATGTCATAATTATGGATTTATAACCGCAAAGCCTGATGAAGTTATTGAAAAACATTATTCGCTCAAATGGTTCGCAGATGTTTTATTTACATATTAACACATTTCCATTCAAGTTTCATCACAATTTCGGTGGGGCTTCATTCCCTGTGCTAGATGGTCAAATCATGGAGCTTTTATTGGTTTTTTGATTAACATCACCATCACAAACTTCAGGTAGGGGTGATGTATTTAATTTTTTCCACATATGACTAACAACTAATTTTGTCGACATCGAGCTTGATTGGTTCTTGTCGCCTTTTAAACTGTCATTACTTGACTTTTTATTCTGGTTCTATCTCCATCTGATCTGATTTTTGGTTCTTTATTTGTCCATGGTTTTTTGACTGGTTGATAAATTGGATTAATTTCTATGTGGCTGCTAATTGCTGATTGACCTGAGTGTCAAGCTTCTAAAAATTATTTGCTGTTCTTTCTGTCTAAGATATGAACATTCTTCCAGTTGAGTGTATGTCCACAATTGACCACATGTACTGAGCTCTGGTCCATATATCTCAATCACCTTTGTCAAGATTACCAAACCTTCTGATATGAATATTTTCTCTAGCTTCCTCTTTTGGTCGTCCGTGATGTGTTGGTATTTGCTTGCTATTTTGCTCAGTATTTCCTCATCCCCGTGAGCCACTTGTGCATGCATGCATCATTAAAAATATTGGGTATNNTAATG ]
[-] EMBL CD074087             [                                                                                                                    TATTCGCTCAAATGGTTCGCAGATGTTTTATTTACATATTAACACATTTCCATTCAAGTTTCATCACAATTTCGGTGGGGCTTCATTCCCTGTGCTAGATGGTCAAATCATGGAGCTTTTATTGGTTTTTTGATTAACATCACCATCACAAACTTCAGGTAGGGGTGATGTATTTAATTTTTTCCACATATGACTAACAACTAATTTTGTCGACATCGAGCTTGATTGGTTCTTGTCGCCTTTTAAACTGTCATTACTTGACTTTTTATTCTGGTTCTATCTCCATCTGATCTGATTTTTGGTTCTTTATTTGTCCATGGTTTTTTGACTGGTTGATAAATTGGATTAATTTCTATGTGGCTGCTAATTGCTGATTGACCTGAGTGTCAAGCTTCTAAAAATTATTTGCTGTTCTTTCTGTCTAAGATATGAACATTCTTCCAGTTGAGTGTATGTCCACAATTGACCACATGTACTGAGCTCTGGTCCATATATCTCAATCACCTTTGTCAAGATTACCAAACCTTCTGATATGAATATTTTCTCTAGCTTCCTCTTTTGGTCGTCCGTGATGTGTTGGTATTTGCTTGCTATTTTGCTCAGTATTTCCTCATCCCGTTGAGCCACTTGTGCATGCATGCATCATTAAAAATATTGGTAATTTTAATGA]




>consensus_27#0
CTCCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGTTCATTAATGTATGTCTTATTTTGGCCTTCGTAA
AATGTCATAATTATGGATTTATAACCGCAAAGCCTGATGAAGTTATTGAAAAACATTATT
CGCTCAAATGGTTCGCAGATGTTTTATTTACATATTAACACATTTCCATTCAAGTTTCAT
CACAATTTCGGTGGGGCTTCATTCCCTGTGCTAGATGGTCAAATCATGGAGCTTTTATTG
GTTTTTTGATTAACATCACCATCACAAACTTCAGGTAGGGGTGATGTATTTAATTTTTTC
CACATATGACTAACAACTAATTTTGTCGACATCGAGCTTGATTGGTTCTTGTCGCCTTTT
AAACTGTCATTACTTGACTTTTTATTCTGGTTCTATCTCCATCTGATCTGATTTTTGGTT
CTTTATTTGTCCATGGTTTTTTGACTGGTTGATAAATTGGATTAATTTCTATGTGGCTGC
TAATTGCTGATTGACCTGAGTGTCAAGCTTCTAAAAATTATTTGCTGTTCTTTCTGTCTA
AGATATGAACATTCTTCCAGTTGAGTGTATGTCCACAATTGACCACATGTACTGAGCTCT
GGTCCATATATCTCAATCACCTTTGTCAAGATTACCAAACCTTCTGATATGAATATTTTC
TCTAGCTTCCTCTTTTGGTCGTCCGTGATGTGTTGGTATTTGCTTGCTATTTTGCTCAGT
ATTTCCTCATCCCCGTGAGCCACTTGTGCATGCATGCATCATTAAAAATATTGGGTATNN
TAATGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case