cluster # 2780

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Schistosoma mansoni
cluster # 2780 cluster # 2780 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2780#0 length = 768 sequences # 2

consensusID : consensus_2780#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 768
fasta sequence

                              [CAATGCCAGTTTTCACGTTGATTATAATTGACTCATAATTAAGAACGACGTTTTACTTGACTTTCCGGATTTCAGTTAAACATTCCTGTTTTTTTGTCTTTACAAAACTTTGATTTTTCGTAGAGTTATCTGTATGTTGATCAGTTAGTGTTTATTAAATTATAAACACCAATATAATGTGCTAAATGGTGTTTTTTCCTGTATGCTTAAATTTTCACCAATTTTTAATAATGTTAATTCCGATTTTTTTGGTAATCACTAGGTTTTTTTTCTTTTTTTTATGTATACATACATTTTAGGCTCTAGACGCAATGAAACTTATTTCATTCAATTAAAATCGTTTCCTTACGACTATTATTATGATTATAATAGTCGACTTTCGACATTAATTAATTTTATATTCAGAATGTACAAAAAGAAACACACTGATTTTCAATTATCCCTTTACTATAAGTTTATGAAAGTAAACTTGTTTATACTTTCAAATTTCGCTGGAGATTTTTTTCAAATTGTATCCCACTTATCATTCATGACAGTTATTTGTGTGAAGCAGATTTCTCCGTTTTCTTTCTTCTGCTCCTTCAGTTAAATATCTTTTCATGCACATATACAGTTTAATTGATATTTGCAATTATCAATCATCTTGTCAACTTCATCGCAAATCTCCATAAAATATACAACCGTACAGAAAAAAATAGATGCAAAACCCATTGATGGGTCCAATTTCCTACTCCTTCGTTGCATTATATCCTTTTTAACACTATATTA]

[+] EMBL CD131981             [CAATGCCAGTTTTCACGTTGATTATAATTGACTCATAATTAAGAACGACGTTTTACTTGACTTTCCGGATTTCAGTTAAACATTCCTGTTTTTTTGTCTTTACAAAACTTTGATTTTTCGTAGAGTTATCTGTATGTTGATCAGTTAGTGTTTATTAAATTATAAACACCAATATAATGTGCTAAATGGTGTTTTTTCCTGTATGCTTAAATTTTCACCAATTTTTAATAATGTTAATTCCGATTTTTTTGGTAATCACTAGGTTTTTTTTCTTTTTTTTATGTATACATACATTTTAGGCTCTAGACGCAATGAAACTTATTTCATTCAATTAAAATCGTTTCCTTACGACTATTATTATGATTATAATAGTCGACTTTCGACATTAATTAATTTTATATTCAGAATGTACAAAAAGAAACACACTGATTTTCAATTATCCCTTTACTATAAGTTTATGAAAGTAAACTTGTTTATACTTTCAAATTTCGCTGGAGATTTTTTTCAAATT                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD093563             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTATCCCTTTACTATAAGTTTATGAAAGTAAACTTGTTTATACTTTCAAATTTCGCTGGAGATTTTTTTCAAATTGTATCCCACTTATCATTCATGACAGTTATTTGTGTGAAGCAGATTTCTCCGTTTTCTTTCTTCTGCTCCTTCAGTTAAATATCTTTTCATGCACATATACAGTTTAATTGATATTTGCAATTATCAATCATCTTGTCAACTTCATCGCAAATCTCCATAAAATATACAACCGTACAGAAAAAAATAGATGCAAAACCCATTGATGGGTCCAATTTCCTACTCCTTCGTTGCATTATATCCTTTTTAACACTATATTA]




>consensus_2780#0
CAATGCCAGTTTTCACGTTGATTATAATTGACTCATAATTAAGAACGACGTTTTACTTGA
CTTTCCGGATTTCAGTTAAACATTCCTGTTTTTTTGTCTTTACAAAACTTTGATTTTTCG
TAGAGTTATCTGTATGTTGATCAGTTAGTGTTTATTAAATTATAAACACCAATATAATGT
GCTAAATGGTGTTTTTTCCTGTATGCTTAAATTTTCACCAATTTTTAATAATGTTAATTC
CGATTTTTTTGGTAATCACTAGGTTTTTTTTCTTTTTTTTATGTATACATACATTTTAGG
CTCTAGACGCAATGAAACTTATTTCATTCAATTAAAATCGTTTCCTTACGACTATTATTA
TGATTATAATAGTCGACTTTCGACATTAATTAATTTTATATTCAGAATGTACAAAAAGAA
ACACACTGATTTTCAATTATCCCTTTACTATAAGTTTATGAAAGTAAACTTGTTTATACT
TTCAAATTTCGCTGGAGATTTTTTTCAAATTGTATCCCACTTATCATTCATGACAGTTAT
TTGTGTGAAGCAGATTTCTCCGTTTTCTTTCTTCTGCTCCTTCAGTTAAATATCTTTTCA
TGCACATATACAGTTTAATTGATATTTGCAATTATCAATCATCTTGTCAACTTCATCGCA
AATCTCCATAAAATATACAACCGTACAGAAAAAAATAGATGCAAAACCCATTGATGGGTC
CAATTTCCTACTCCTTCGTTGCATTATATCCTTTTTAACACTATATTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case