cluster # 2872

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Schistosoma mansoni
cluster # 2872 cluster # 2872 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2872#0 length = 670 sequences # 2

consensusID : consensus_2872#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 670
fasta sequence

                              [AGATAAGAAGTTACAAAGTCCCGTAGATGAATTCTTCTCGAAATTAGACAATCAAAGAGATGTAGTACATTCAGCGAATGCTATTACTTCATCAATTATTAATTCTTCGTCTACACTATCATTGTCCCGTATATCTGTTCTATCATTATCAACTCGTCATGCAACATACCTTACTCGTAGTTTACTTATTGTTTATATAATTGGTAAAACATTTGGTGATGTTGGTGATGTGAGTGTATCATTTATTGCACCAGTATTTGGAACTGAATTAGCCTTAAGTTCTACCATAATCAACTGAGCTATAGCTGTTGCTGGTATCGGTGATTTAATCACACGTGTAGGAGTTGGTTGGCTAACAGATAGACCAGCATGTGTCGGTCGTCGTGGCTTATTATTAGCTATTGTATGGATCGTAGAAGGTTTAAATGCTTTTTTATTTGCTGAACTTAGCCGATTATATGGAAATTATACTACTATAACTGATGTTAATGGTGATATTGTTGACAGTAATGATAAAACAGTACTGATAGCATTNTACTTTATATGCTCTGCTATTCATGGTATATGTAGTGGAACTGCAATGACTCAAATGGTTGTAGTTTTATGCGATTGGGTTGGCTCATCACAATTAGCACAATCTTTAGCAATAACTATGGTTATTTTAGGATTT]

[+] EMBL CD096195             [AGATAAGAAGTTACAAAGTCCCGTAGATGAATTCTTCTCGAAATTAGACAATCAAAGAGATGTAGTACATTCAGCGAATGCTATTACTTCATCAATTATTAATTCTTCGTCTACACTATCATTGTCCCGTATATCTGTTCTATCATTATCAACTCGTCATGCAACATACCTTACTCGTAGTTTACTTATTGTTTATATAATTGGTAAAACATTTGGTGATGTTGGTGATGTGAGTGTATCATTTATTGCACCAGTATTTGGAACTGAATTAGCCTTAAGTTCTACCATAATCAACTGAGCTATAGCTGTTGCTGGTATCGGTGATTTAATCACACGTGTAGGAGTTGGTTGGCTAACAGATAGACCAGCATGTGTCGGTCGTCGTGGCTTATTATTAGCTATTGTATGGATCGTAGAAGGTTTAAATGCTTTTTTATTTGCTGAACTTAGCCGATTATATGGAAATTATACTACTATAACTGATGTTAATGGTGATATTGTTGACAGTAATGATAAAACAGTACTGATAGCATTNTACTTTATATGCTCTGCTATTCATGGTATATGTAGTGGAACTGCAATGAC                                                                                     ]
[-] EMBL CD133680             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCGTAGAAGGTTTAAATGCTTCTTTATTTGCTGAACTTAGCCGATTATATGGAAATTATACTACTATAACTGATGTTAATGGTGATATTGTTGACAGTAATGATAAAACAGTACTGATAGCATTTTACTTTATATGCTCTGCTATTCATGGTATATGTAGTGGAACTGCAATGACTCAAATGGTTGTAGTTTTATGCGATTGGGTTGGCTCATCACAATTAGCACAATCTTTAGCAATAACTATGGTTATTTTAGGATTT]




>consensus_2872#0
AGATAAGAAGTTACAAAGTCCCGTAGATGAATTCTTCTCGAAATTAGACAATCAAAGAGA
TGTAGTACATTCAGCGAATGCTATTACTTCATCAATTATTAATTCTTCGTCTACACTATC
ATTGTCCCGTATATCTGTTCTATCATTATCAACTCGTCATGCAACATACCTTACTCGTAG
TTTACTTATTGTTTATATAATTGGTAAAACATTTGGTGATGTTGGTGATGTGAGTGTATC
ATTTATTGCACCAGTATTTGGAACTGAATTAGCCTTAAGTTCTACCATAATCAACTGAGC
TATAGCTGTTGCTGGTATCGGTGATTTAATCACACGTGTAGGAGTTGGTTGGCTAACAGA
TAGACCAGCATGTGTCGGTCGTCGTGGCTTATTATTAGCTATTGTATGGATCGTAGAAGG
TTTAAATGCTTTTTTATTTGCTGAACTTAGCCGATTATATGGAAATTATACTACTATAAC
TGATGTTAATGGTGATATTGTTGACAGTAATGATAAAACAGTACTGATAGCATTNTACTT
TATATGCTCTGCTATTCATGGTATATGTAGTGGAACTGCAATGACTCAAATGGTTGTAGT
TTTATGCGATTGGGTTGGCTCATCACAATTAGCACAATCTTTAGCAATAACTATGGTTAT
TTTAGGATTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case