Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 2885 cluster # 2885       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2885#0 length = 850 sequences # 2  

consensusID : consensus_2885#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 850
fasta sequence
                              [TTCATTCCTGACTTCCCCTTTTCCCATTTATAACCAACATACTTCTCGTTTATCTTTAGTCACTGACACTATTCCAGTGCTTTACTCTTCATTATATTCGATTCGTTCTGTGGTTTTTTTCTTCTTATGAAAGACTTAGAAATGGTCATTTTAATCCCTTGTGTCCAGAACGTACGGAGTTCTTGCTCTAGTTGTTTAGTTTGCCTTGTCATTGTATATGGCTATTCATCAATCATTGTTGCAATTTCTGGATCATCTTGTGCTTGGCGAATTTTCTAGAGTTGGAACCACTATGATTAAAGTACTACATTTGTGACAGATGGGACGTTCTTGTTTTGGTATGGATATTGCCGACTTTATTTAATGTCTTCAATATTAATAACTTGAAGTTGTGTATATAAACGTATATTTTGCCTTAAGTGAAACGCTATATATCGATTTATCAAACAACACCGAACGAACTATATGGAAATACATCAAATATGTTTGATGACTGTATTGTTTTATACTTCAAGCTTGCTAGGACTTAGCAATTAGATTTTAGCCAAACGCTTTATTGGGCTACGTATGATACTACCACTGCACGATTTGAACCACCGACTCAAACCACCCAATACGCAACAACATTGATTCGCATTACTTTCGGTGAACAGAACTTATACTCGGAAGTTATTTCCCGTTGTATATTACATTGATCACCTGTAGTTATTTAAAGAAATAATCAGGGTGTCGTACAGAATCAGTAGCCGTAAATGCAAGTGTCAAGGACGGATACACATAGTTTATTCGCGAGTTTTAAGAGCTATTTTTTCAAATGGTGATTTTATTCGAAAGTAGAATTTCTCAACAT]

[+] EMBL CD117652             [TTCATTCCTGACTTCCCCTTTTCCCATTTATAACCAACATACTTCTCGTTTATCTTTAGTCACTGACACTATTCCAGTGCTTTACTCTTCATTATATTCGATTCGTTCTGTGGTTTTTTTCTTCTTATGAAAGACTTAGAAATGGTCATTTTAATCCCTTGTGTCCAGAACGTACGGAGTTCTTGCTCTAGTTGTTTAGTTTGCCTTGTCATTGTATATGGCTATTCATCAATCATTGTTGCAATTTCTGGATCATCTTGTGCTTGGCGAATTTTCTAGAGTTGGAACCACTATGATTAAAGTACTACATTTGTGACAGATGGGACGTTCTTGTTTTGGTATGGATATTGCCGACTTTATTTAATGTCTTCAATATTAATAACTTGAAGTTGTGTATATAAACGTATATTTTGCCTTAAGTGAAACGCTATATATCGATTTATCAAACAACACCGAACGAACTATATGGAAATACATCAAATATGTTTGATGACTGTATTGTTTTATACTTCAAGCTTGCTAGGACTTAGCAATTAGATTTTAGCCAAACGCTTTATTGGGCTACGTATGATACTACCACTGCACGATTTGAACCACC                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD096441             [                                                                                                                                                                                                                                                                              ATTTTCTAGAGTTGGAAACACTATGATTAAAGTACTACATTTGTGACAGTTGGGACGTTCTTGTTTTGGTATGGATATTGCCGACTTTATTTAATGTCTTCAATATTAATAACTTGAAGTTGTGTATATAAACGTATATTTTGCCTTAAGTGAAACGCTATATATCGATTTATCAAACAACACCGAACGAACTATATGGAAATACATCAAATATGTTTGATGACTGTATTGTTTTATACTTCAAGCTTGCTAGGACTTAGCAATTAGATTTTAGCCAAACGCTTTATTGGGCTACGTATGATACTACCACTGCACGATTTGAACCACCGACTCAAACCACCCAATACGCAACAACATTGATTCGCATTACTTTCGGTGAACAGAACTTATACTCGGAAGTTATTTCCCGTTGTATATTACATTGATCACCTGTAGTTATTTAAAGAAATAATCAGGGTGTCGTACAGAATCAGTAGCCGTAAATGCAAGTGTCAAGGACGGATACACATAGTTTATTCGCGAGTTTTAAGAGCTATTTTTTCAAATGGTGATTTTATTCGAAAGTAGAATTTCTCAACAT]


>consensus_2885#0 TTCATTCCTGACTTCCCCTTTTCCCATTTATAACCAACATACTTCTCGTTTATCTTTAGT CACTGACACTATTCCAGTGCTTTACTCTTCATTATATTCGATTCGTTCTGTGGTTTTTTT CTTCTTATGAAAGACTTAGAAATGGTCATTTTAATCCCTTGTGTCCAGAACGTACGGAGT TCTTGCTCTAGTTGTTTAGTTTGCCTTGTCATTGTATATGGCTATTCATCAATCATTGTT GCAATTTCTGGATCATCTTGTGCTTGGCGAATTTTCTAGAGTTGGAACCACTATGATTAA AGTACTACATTTGTGACAGATGGGACGTTCTTGTTTTGGTATGGATATTGCCGACTTTAT TTAATGTCTTCAATATTAATAACTTGAAGTTGTGTATATAAACGTATATTTTGCCTTAAG TGAAACGCTATATATCGATTTATCAAACAACACCGAACGAACTATATGGAAATACATCAA ATATGTTTGATGACTGTATTGTTTTATACTTCAAGCTTGCTAGGACTTAGCAATTAGATT TTAGCCAAACGCTTTATTGGGCTACGTATGATACTACCACTGCACGATTTGAACCACCGA CTCAAACCACCCAATACGCAACAACATTGATTCGCATTACTTTCGGTGAACAGAACTTAT ACTCGGAAGTTATTTCCCGTTGTATATTACATTGATCACCTGTAGTTATTTAAAGAAATA ATCAGGGTGTCGTACAGAATCAGTAGCCGTAAATGCAAGTGTCAAGGACGGATACACATA GTTTATTCGCGAGTTTTAAGAGCTATTTTTTCAAATGGTGATTTTATTCGAAAGTAGAAT TTCTCAACAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)