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Schistosoma mansoni
cluster # 293 cluster # 293       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_293#0 length = 1018 sequences # 2  

consensusID : consensus_293#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1018
fasta sequence
                              [ATATTCGGCACGAGGACACAGATGGTTTGTATCGTGATTTATGTCGGTCATTCAGGGAAACGAGACACTTAACGAGTTCTTCATTTCATAATAGTTTTATTGAGGGGTGACCTGGAGTTATGATTACGAACTTTAGATAATGAACTGTGGAAATTATCTTCATTTTCTACTTGTTATCTCATTGTGCCATACTGTAATGAATCAGCTATACTGTCACCAAAACTCATGTGAAATGCCTTCAGTGGAATATGTCGTTAGAGTCGATGGAACGTTCTCAGATGCTAAGGCAGTCGCTCGACTGCACGACTTGAAGCTAGTTGATGAAATGATTGGATTTAAAGGAATGTACATAATGCACTCAAAAGTTAGCGCATTCAAAAGGCGCAAGCGTCGGGCTGTGGTGTTCATAAGAGGTCCAGGGGTCAAGTGGTTTATTAAACAAGAATTTCTTAAACGTACTAAGCGTTCCAGTGTGCCGACCGTATTTTGGGATGATCCGCTGTATCCTGATATGTGGTACCTGAGGAACTTCGGTTTTATATGTTTTCAAACCCCATCTCGAATTGTGCAGAAATAGCANACTGATTGTTCAGTGGGATCATCATCAGGATTTCAGAGGTGGTTCATTCATATTANACAGCANAATTCTCATGTTGATCCTCCAGATATCTGGATGAACGAAATTATTCATCAATAGGAACAACTAAAGGAATCATTTAAAATATACTTTTTCTGTATCATTAGTTCCAAGGTGGATATCAAGTTTTCTTTATAAAGAATCAGCTGAAGTATCATTAATATCTCATCCAAATATCAATTTAAATATCCTAACCCAAGAAAAGTACTTATATCTTTGTATCTTATGCACATATATTCCCCATATTTGGAACTACAGCTTTCTCCTATTTACCCATAATGCTTCGGTTTTATTTATTAACGGACTTTGACTTACTTAAAATGAGTTCAGTTGTTAAGTTATGCCAGTACGATTATGTTGTTGATATCCCGACAATATTTC]

[+] EMBL CD080717             [ATATTCGGCACGAGGACACAGATGGTTTGTATCGTGATTTATGTCGGTCATTCAGGGAAACGAGACACTTAACGAGTTCTTCATTTCATAATAGTTTTATTGAGGGGTGACCTGGAGTTATGATTACGAACTTTAGATAATGAACTGTGGAAATTATCTTCATTTTCTACTTGTTATCTCATTGTGCCATACTGTAATGAATCAGCTATACTGTCACCAAAACTCATGTGAAATGCCTTCAGTGGAATATGTCGTTAGAGTCGATGGAACGTTCTCAGATGCTAAGGCAGTCGCTCGACTGCACGACTTGAAGCTAGTTGATGAAATGATTGGATTTAAAGGAATGTACATAATGCACTCAAAAGTTAGCGCATTCAAAAGGCGCAAGCGTCGGGCTGTGGTGTTCATAAGAGGTCCAGGGGTCAAGTGGTTTATTAAACAAGAATTTCTTAAACGTACTAAGCGTTCCAGTGTGCCGACCGTATTTTGGGATGATCCGCTGTATCCTGATATGTGGTACCTGAGGAACTTCGGTTTTATATGTTTTCAAACCCCATCTCGAATTGTGCAGAAATAGCANACTGATTGTTCAGTGGGATCATCATCAGGATTTCAGAGGTGGTTCATTCATATTANACAGCANAATTCTCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD074642             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGAGGTCCAGGGGTCAAGTGGTTTATTAAACAAGAATTTCTTAAACGTACTAAGCGTTCCAGTGTGCCGACCGTATTTTGGGATGATCCGCTGTATCCTGATATGTGGTACCTGAGGAACTTCGGTTTTATATGTTTTCAAACCCCATCTCGAATTGTGCAGAAATAGCAAACTGATTGTTCAGTGGGATCATCATCAGGATTTCAGAGGTGGTTCATTCATATTAAACAGCAAAATTCTCATGTTGATCCTCCAGATATCTGGATGAACGAAATTATTCATCAATAGGAACAACTAAAGGAATCATTTAAAATATACTTTTTCTGTATCATTAGTTCCAAGGTGGATATCAAGTTTTCTTTATAAAGAATCAGCTGAAGTATCATTAATATCTCATCCAAATATCAATTTAAATATCCTAACCCAAGAAAAGTACTTATATCTTTGTATCTTATGCACATATATTCCCCATATTTGGAACTACAGCTTTCTCCTATTTACCCATAATGCTTCGGTTTTATTTATTAACGGACTTTGACTTACTTAAAATGAGTTCAGTTGTTAAGTTATGCCAGTACGATTATGTTGTTGATATCCCGACAATATTTC]


>consensus_293#0 ATATTCGGCACGAGGACACAGATGGTTTGTATCGTGATTTATGTCGGTCATTCAGGGAAA CGAGACACTTAACGAGTTCTTCATTTCATAATAGTTTTATTGAGGGGTGACCTGGAGTTA TGATTACGAACTTTAGATAATGAACTGTGGAAATTATCTTCATTTTCTACTTGTTATCTC ATTGTGCCATACTGTAATGAATCAGCTATACTGTCACCAAAACTCATGTGAAATGCCTTC AGTGGAATATGTCGTTAGAGTCGATGGAACGTTCTCAGATGCTAAGGCAGTCGCTCGACT GCACGACTTGAAGCTAGTTGATGAAATGATTGGATTTAAAGGAATGTACATAATGCACTC AAAAGTTAGCGCATTCAAAAGGCGCAAGCGTCGGGCTGTGGTGTTCATAAGAGGTCCAGG GGTCAAGTGGTTTATTAAACAAGAATTTCTTAAACGTACTAAGCGTTCCAGTGTGCCGAC CGTATTTTGGGATGATCCGCTGTATCCTGATATGTGGTACCTGAGGAACTTCGGTTTTAT ATGTTTTCAAACCCCATCTCGAATTGTGCAGAAATAGCANACTGATTGTTCAGTGGGATC ATCATCAGGATTTCAGAGGTGGTTCATTCATATTANACAGCANAATTCTCATGTTGATCC TCCAGATATCTGGATGAACGAAATTATTCATCAATAGGAACAACTAAAGGAATCATTTAA AATATACTTTTTCTGTATCATTAGTTCCAAGGTGGATATCAAGTTTTCTTTATAAAGAAT CAGCTGAAGTATCATTAATATCTCATCCAAATATCAATTTAAATATCCTAACCCAAGAAA AGTACTTATATCTTTGTATCTTATGCACATATATTCCCCATATTTGGAACTACAGCTTTC TCCTATTTACCCATAATGCTTCGGTTTTATTTATTAACGGACTTTGACTTACTTAAAATG AGTTCAGTTGTTAAGTTATGCCAGTACGATTATGTTGTTGATATCCCGACAATATTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)