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Schistosoma mansoni
cluster # 305 cluster # 305       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_305#0 length = 1309 sequences # 2  

consensusID : consensus_305#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1309
fasta sequence
                              [CGGCTCGAGGACGATAGTGGTCGAAATTGGCAACCAATTTTATTGAGTCTTGTACAGATAATATTATCTGCAGAGAATAGAACAATTCTTGGATTTGAAAATTTAATTGAACAAGAATGGATTCGTTATGGTTATCCATTTGTCCCTGATCCAATTGATTGGCATGATGATTCAATTAGTTGTGATTATGATGATGGTGTATGTTTCGCATTATTCATTGATTGTGTTCATCAATTATTGATTCAATTTCCTACAGAATTTGCATTTACAGAGGATTATCTGGTCTTGTTGTTAGACAGTGCATTAAGTCGTGGTGGTGGAACTCCACCATTCACTATAGAATTTTCATGTTCATGTGAAGCAGCAAGGCATGTTAAAACAAAATCTATGACACAAGAACAAATTATTGAAAAATCAAATTATTTTCATAATATTGGTGCATGGCGTTCATTTCATAATTGGAATGATATATTAACTAATAATGGTTATCAACTACTATTTAACTGGTTATATTATTGGCAATATAATTCAGATCCTATAAATAATACATCAGATTATGCTAAACTTATACAAACTATAGATCAATCTACACGACGAATACTTACTCCAATTCTATCACCATTATATTATCCACGATTTTGGATTCATGCATGGTATCGATGGAATCGTTCAACTCGTTTAACTAATGGTGGTGGTTATGCATTCAATGCTGCTTATTATAGAAATCTACTAAGATCAACTATTAGCAATGATCATCATCATCATCAATCAATTATACCTCGTACAAGTACTAGTCCTTATACTGGTTGGTTATCCGATGAATCTATTATGAATGCTTTAAATCGAATTGTTTTACCAGCACCATTTGATAATTTTTATAAAACCTTGTATGAAATAGCAAATTTATGGGATAATGAATATTGGGATACACAACTTGTTGATTGTGAATAAAGAACGATTATAGAATATGTAAACCTATATATGTATGAATAATCTCATTCCCCTTTGCTACTACTATTATTATTTATTTTCTTTATTTGTTCTCAGATGATGATATATGAACTGTTTGCCTATGTTTTTTATTTTTAAAAAACCGCCAAGCAATCTCATAATTTTTGTTTTAATTATTTATGACTTAAACAAAAGGGATTAATCCAGCATTATTGATCTGAACCAGTTTTTATTTCCATAGTGACTTTCTTTTTGATCTTTTTCAATTTTGTACTCCTTTTTTTATTGCTTATTTACCAGTAATTTATTGACTTGTGTTTGTAAATCTAATTTTTTTTAAATAATGCAATAGATCATT]

[+] EMBL CD080736             [CGGCTCGAGGACGATAGTGGTCGAAATTGGCAACCAATTTTATTGAGTCTTGTACAGATAATATTATCTGCAGAGAATAGAACAATTCTTGGATTTGAAAATTTAATTGAACAAGAATGGATTCGTTATGGTTATCCATTTGTCCCTGATCCAATTGATTGGCATGATGATTCAATTAGTTGTGATTATGATGATGGTGTATGTTTCGCATTATTCATTGATTGTGTTCATCAATTATTGATTCAATTTCCTACAGAATTTGCATTTACAGAGGATTATCTGGTCTTGTTGTTAGACAGTGCATTAAGTCGTGGTGGTGGAACTCCACCATTCACTATAGAATTTTCATGTTCATGTGAAGCAGCAAGGCATGTTAAAACAAAATCTATGACACAAGAACAAATTATTGAAAAATCAAATTATTTTCATAATATTGGTGCATGGCGTTCATTTCATAATTGGAATGATATATTAACTAATAATGGTTATCAACTACTATTTAACTGGTTATATTATTGGCAATATAATTCAGATCCTATAAATAATACATCAGATTATGCTAAACTTATACAAACTATAGATCAATCTACACGACGAATACTTACTCCAATTCTATCACCATTATATTATCCACGATTTTGGATTCATGCATGGTATCGATGGAATCGTTCAACTCGTTTAACTAATGGTGGTGGTTATGCATTCAATGCTGCTTATTATAGAAATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD074659             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACTCGTTTAACTAATGGTGGTGGTTATGCATTCAATGCTGCTTATTATAGAAATCTACTAAGATCAACTATTAGCAATGATCATCATCATCATCAATCAATTATACCTCGTACAAGTACTAGTCCTTATACTGGTTGGTTATCCGATGAATCTATTATGAATGCTTTAAATCGAATTGTTTTACCAGCACCATTTGATAATTTTTATAAAACCTTGTATGAAATAGCAAATTTATGGGATAATGAATATTGGGATACACAACTTGTTGATTGTGAATAAAGAACGATTATAGAATATGTAAACCTATATATGTATGAATAATCTCATTCCCCTTTGCTACTACTATTATTATTTATTTTCTTTATTTGTTCTCAGATGATGATATATGAACTGTTTGCCTATGTTTTTTATTTTTAAAAAACCGCCAAGCAATCTCATAATTTTTGTTTTAATTATTTATGACTTAAACAAAAGGGATTAATCCAGCATTATTGATCTGAACCAGTTTTTATTTCCATAGTGACTTTCTTTTTGATCTTTTTCAATTTTGTACTCCTTTTTTTATTGCTTATTTACCAGTAATTTATTGACTTGTGTTTGTAAATCTAATTTTTTTTAAATAATGCAATAGATCATT]


>consensus_305#0 CGGCTCGAGGACGATAGTGGTCGAAATTGGCAACCAATTTTATTGAGTCTTGTACAGATA ATATTATCTGCAGAGAATAGAACAATTCTTGGATTTGAAAATTTAATTGAACAAGAATGG ATTCGTTATGGTTATCCATTTGTCCCTGATCCAATTGATTGGCATGATGATTCAATTAGT TGTGATTATGATGATGGTGTATGTTTCGCATTATTCATTGATTGTGTTCATCAATTATTG ATTCAATTTCCTACAGAATTTGCATTTACAGAGGATTATCTGGTCTTGTTGTTAGACAGT GCATTAAGTCGTGGTGGTGGAACTCCACCATTCACTATAGAATTTTCATGTTCATGTGAA GCAGCAAGGCATGTTAAAACAAAATCTATGACACAAGAACAAATTATTGAAAAATCAAAT TATTTTCATAATATTGGTGCATGGCGTTCATTTCATAATTGGAATGATATATTAACTAAT AATGGTTATCAACTACTATTTAACTGGTTATATTATTGGCAATATAATTCAGATCCTATA AATAATACATCAGATTATGCTAAACTTATACAAACTATAGATCAATCTACACGACGAATA CTTACTCCAATTCTATCACCATTATATTATCCACGATTTTGGATTCATGCATGGTATCGA TGGAATCGTTCAACTCGTTTAACTAATGGTGGTGGTTATGCATTCAATGCTGCTTATTAT AGAAATCTACTAAGATCAACTATTAGCAATGATCATCATCATCATCAATCAATTATACCT CGTACAAGTACTAGTCCTTATACTGGTTGGTTATCCGATGAATCTATTATGAATGCTTTA AATCGAATTGTTTTACCAGCACCATTTGATAATTTTTATAAAACCTTGTATGAAATAGCA AATTTATGGGATAATGAATATTGGGATACACAACTTGTTGATTGTGAATAAAGAACGATT ATAGAATATGTAAACCTATATATGTATGAATAATCTCATTCCCCTTTGCTACTACTATTA TTATTTATTTTCTTTATTTGTTCTCAGATGATGATATATGAACTGTTTGCCTATGTTTTT TATTTTTAAAAAACCGCCAAGCAATCTCATAATTTTTGTTTTAATTATTTATGACTTAAA CAAAAGGGATTAATCCAGCATTATTGATCTGAACCAGTTTTTATTTCCATAGTGACTTTC TTTTTGATCTTTTTCAATTTTGTACTCCTTTTTTTATTGCTTATTTACCAGTAATTTATT GACTTGTGTTTGTAAATCTAATTTTTTTTAAATAATGCAATAGATCATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)