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Schistosoma mansoni
cluster # 3100 cluster # 3100       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3100#0 length = 459 sequences # 2  

consensusID : consensus_3100#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 459
fasta sequence
                              [TTAGTGTGACCATTGAAGTCAGTCAAACGTAGTGACTCTAAACGATTTATTCATGTAACCGCATTTGATTACAACAGGGATGTTTGTTCTCAATTCACTGAAGTCTGAATCTTTGTTAGCTTTAATTTATCTCATTGTTGATACTACTTTGTTTGACTATGCACTCCGTTTTTGTGATAAATTTTGCACTCTGGATTTAAACCAAGGATATTTTTGCTTAACACATTTCTTCCCCCGTTGTTGTTGTCGTCGTCCCATTGACTCACACGAATTGATATTTATGTAATATATTTCTCACACCTTCACAAATAGCTTGGTCACTTACTCATAATTACCTATGGTAATTTGTATGAATATATACACAGCTATTGTGATTTGAAGAGTGTCTATGTGTATTAGCAGTAAGTGTCCTTGTCTGTTTAAGTCTGTCTCACTATCTGTTATATACATTTCTGCAGT]

[+] EMBL CD069106             [TTAGTGTGACCATTGAAGTCAGTCAAACGTAGTGACTCTAAACGATTTATTCATGTAACCGCATTTGATTACAACAGGGATGTTTGTTCTCAATTCACTGAAGTCTGAATCTTTGTTAGCTTTAATTTATCTCATTGTTGATACTACTTTGTTTGACTATGCACTCCGTTTTTGTGATAAATTTTGCACTCTGGATTTAAACCAAGGATATTTTTGCTTAACACATTTCTTCCCCCGTTGTTGTTGTCGTCGTCCCATTGACTCACACGAATTGATATTTATGTAATATATTTCTCACACCTTCACAAATAGCTTGGTCACTTACTCATAATTACCTATGGTAATTTGTATGAATATATACACAGCTATTGTGATTTGAAGAGTGTCTATGTGTATTAGCAGTAAGTGTCCTTGTCTGTTTAAGTCTGTCTCACTATCTGTTATATACATTTCTGCAGT]
[+] EMBL CD069383             [                AGTCAAACTAACGTAGTGACTCTAAACGATTTATTCATGTAACCGCATTTGATTACAACAGGGATGTTTGTTCTCAATTCACTGAAGTCTGAATCTTTGTTAGCTTTAATTTATCTCATTGTTGATACTACTTTGTTTGACTATGCACTCCGTTTTTGTGATAAATTTTGCACTCTGGATTTATTCCAAGGATATTTTTGCTTAACACATTTCTTCCCCCGTTGTTGTTGTCGTCGTCCCATTGACTCACACGAATTGATATTTATGTAATATATTTCTCACACCTTCACAAATAGCTTGGTCACTTACTCATAATTACCTATGGTAATTTGTATGAATATATACACAGCTATTGTGATTTGAAGAGTGTCTATGTGTATTAGCAGTAAGTGTCCTTGTCTGTTTAAGTCTGTCTCACTATCTGTTATATACATTTCTGCA  ]


>consensus_3100#0 TTAGTGTGACCATTGAAGTCAGTCAAACGTAGTGACTCTAAACGATTTATTCATGTAACC GCATTTGATTACAACAGGGATGTTTGTTCTCAATTCACTGAAGTCTGAATCTTTGTTAGC TTTAATTTATCTCATTGTTGATACTACTTTGTTTGACTATGCACTCCGTTTTTGTGATAA ATTTTGCACTCTGGATTTAAACCAAGGATATTTTTGCTTAACACATTTCTTCCCCCGTTG TTGTTGTCGTCGTCCCATTGACTCACACGAATTGATATTTATGTAATATATTTCTCACAC CTTCACAAATAGCTTGGTCACTTACTCATAATTACCTATGGTAATTTGTATGAATATATA CACAGCTATTGTGATTTGAAGAGTGTCTATGTGTATTAGCAGTAAGTGTCCTTGTCTGTT TAAGTCTGTCTCACTATCTGTTATATACATTTCTGCAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)