These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_3666#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 768 fasta sequence [TGCAATTTGGAAAGTTAACTAATTCCTATCAATCCAGCCGGCAGTGTGGTGATTAAGATAATTGATCTGACATGAAAATATATCTGTATGCTTTAATGAAGCTAATACATATCGATTTAAGATATCTTTTTTTAAACAAACACTATTTCTATTTCGTTAACGAGAATATCACCACTGTGACACCTGATAAAACTTATCAGAATTAAAAAAAACTTCTTCAGAGTTAAAGGTAATCGGGTTTTTATCTCATAAATCTGCTTCAAAAAAGATTATAAAACCTACATACTTGGTATTCATAATCTTGCGTCTTCACCTTCCTTCCTCTTCTGGATGAACGAAATGCTACACTTGCTGCGCGCGCTGCTGATGCTCGTCTCATTGCACTACTACCACGACGTGGTGCTTTATCATTACCTAAATTATCCAA-TTCTGTCTTTGAAAATAAATCCATCGGTACATTTCTTTCAACTCGTACAGTATGACATAATGAAAGTAGAAGCAGTAGGGGTTTGTACACTATTTA-CCGTAGGTGATTGACTAGAGGAGTCGGGTATTGTTCTTATTGTACAGCTTCTGAAAATTCATCCAACTCTTCTTGATTCTCTCGACTGAACTGGAGTTCTGACAGCTTCTCTGTCCGTACCGTATCACTCAAAGGTGAATCTGTGTACGAAACAACCATTATTTTCAAAGTGAAAAACACCCTAGATGTGGCTAGTCGACGAAATGCATTGAATTCTCTGTTAATGTACCNAGTTTTGTCAGTGA] [+] EMBL CD127170 [TGCAATTTGGAAAGTTAACTAATTCCTATCAATCCAGCCGGCAGTGTGGTGATTAAGATAATTGATCTGACATGAAAATATATCTGTATGCTTTAATGAAGCTAATACATATCGATTTAAGATATCTTTTTTTAAACAAACACTATTTCTATTTCGTTAACGAGAATATCACCACTGTGACACCTGATAAAACTTATCAGAATTAAAAAAAACTTCTTCAGAGTTAAAGGTAATCGGGTTTTTATCTCATAAATCTGCTTCAAAAAAGATTATAAAACCTACATACTTGGTATTCATAATCTTGCGTCTTCACCTTCCTTCCTCTTCTGGATGAACGAAATGCTACACTTGCTGCGCGCGCTGCTGATGCTCGTCTCATTGCACTACTACCACGACGTGGTGCTTTATCATTACCTAAATTATCCAA TTCTGTCTTTGAAAATAAATCCATCGGTACATTTCTTTCAACTCGTACAGTATGACATAATGAAAGTAGAAGCAGTAGGGGTTTGTACACTATTTA CCGTAGGTGATTGACTAGAGGAGTCGGGTATTGTTCTTATTGTACAGCTTCTGAAAATTCATCCAACTCTTCTTGATTCTCTCGACTGAACTGGAGTTCTGACAGCTTCTCTGTCCGTACCGTATCACTCAAAGGTGAATCTGTGTACGAAACAACCATTATTTTCAAAGTGAAAAACACCCTAGATGTGGCTAGTCGACGAAATGCATTGAATTCTCTGTTAATGTACCNAGTTTTGTCAGTGA] [+] EMBL CD127215 [TGCAATTTGGAAAGTTAACTAATTCCTATCAATCCAGCCGGCAGTGTGGTGATTAAGATAATTGATCTGACATGAAAATATATCTGTATGCTTTAATGAAGCTAATACATATCGATTTAAGATATCTTTTTTTAAACAAACACTATTTCTATTTCGTTAACGAGAATATCACCACTGTGACACCTGATAAAACTTATCAGAATTAAAAAAAACTTCTTCAGAGTTAAAGGTAATCGGGTTTTTATCTCATAAATCTGCTTCAAAAAAGATTATAAAACCTACATACTTGGTATTCATAATCTTGCGTCTTCACCTTCCTTCCTCTTCTGGATGAACGAAATGCTACACTTGCTGCGCGCGCTGCTGATGCTCGTCTCATTGCACTACTACCACGACGTGGTGCTTTATCATTACCTAAATTATCCAATTTCTGTCTTTGAAAATAAATCCATCGGTACATTTCTTTCAACTCGTACAGTATGACATAATGAAAGTAGAAGCAGTAGGGGTTTGTACACTATTTACCCGTAGGTGATTGACTAGAGGAGTCGGTTATTGGTCTTAATGGACAGCTTCTG AAATTCATCC ACTCTTCTTGA TCTCTCGACTG ACTGGAG TCTGA AGCTT TCTGTCCGTACCG ATCACTC AAGGTGAATCTGTGTACG AACAACCA TATTTTC AAGTG AAACACCCTATATGTGGCT GTCGACAAATTGCATTG ATTCT TG TAATGTACC AG TTTGGCAGTG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||