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Schistosoma mansoni
cluster # 3666 cluster # 3666       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3666#0 length = 768 sequences # 2  

consensusID : consensus_3666#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 768
fasta sequence
                              [TGCAATTTGGAAAGTTAACTAATTCCTATCAATCCAGCCGGCAGTGTGGTGATTAAGATAATTGATCTGACATGAAAATATATCTGTATGCTTTAATGAAGCTAATACATATCGATTTAAGATATCTTTTTTTAAACAAACACTATTTCTATTTCGTTAACGAGAATATCACCACTGTGACACCTGATAAAACTTATCAGAATTAAAAAAAACTTCTTCAGAGTTAAAGGTAATCGGGTTTTTATCTCATAAATCTGCTTCAAAAAAGATTATAAAACCTACATACTTGGTATTCATAATCTTGCGTCTTCACCTTCCTTCCTCTTCTGGATGAACGAAATGCTACACTTGCTGCGCGCGCTGCTGATGCTCGTCTCATTGCACTACTACCACGACGTGGTGCTTTATCATTACCTAAATTATCCAA-TTCTGTCTTTGAAAATAAATCCATCGGTACATTTCTTTCAACTCGTACAGTATGACATAATGAAAGTAGAAGCAGTAGGGGTTTGTACACTATTTA-CCGTAGGTGATTGACTAGAGGAGTCGGGTATTGTTCTTATTGTACAGCTTCTGAAAATTCATCCAACTCTTCTTGATTCTCTCGACTGAACTGGAGTTCTGACAGCTTCTCTGTCCGTACCGTATCACTCAAAGGTGAATCTGTGTACGAAACAACCATTATTTTCAAAGTGAAAAACACCCTAGATGTGGCTAGTCGACGAAATGCATTGAATTCTCTGTTAATGTACCNAGTTTTGTCAGTGA]

[+] EMBL CD127170             [TGCAATTTGGAAAGTTAACTAATTCCTATCAATCCAGCCGGCAGTGTGGTGATTAAGATAATTGATCTGACATGAAAATATATCTGTATGCTTTAATGAAGCTAATACATATCGATTTAAGATATCTTTTTTTAAACAAACACTATTTCTATTTCGTTAACGAGAATATCACCACTGTGACACCTGATAAAACTTATCAGAATTAAAAAAAACTTCTTCAGAGTTAAAGGTAATCGGGTTTTTATCTCATAAATCTGCTTCAAAAAAGATTATAAAACCTACATACTTGGTATTCATAATCTTGCGTCTTCACCTTCCTTCCTCTTCTGGATGAACGAAATGCTACACTTGCTGCGCGCGCTGCTGATGCTCGTCTCATTGCACTACTACCACGACGTGGTGCTTTATCATTACCTAAATTATCCAA TTCTGTCTTTGAAAATAAATCCATCGGTACATTTCTTTCAACTCGTACAGTATGACATAATGAAAGTAGAAGCAGTAGGGGTTTGTACACTATTTA CCGTAGGTGATTGACTAGAGGAGTCGGGTATTGTTCTTATTGTACAGCTTCTGAAAATTCATCCAACTCTTCTTGATTCTCTCGACTGAACTGGAGTTCTGACAGCTTCTCTGTCCGTACCGTATCACTCAAAGGTGAATCTGTGTACGAAACAACCATTATTTTCAAAGTGAAAAACACCCTAGATGTGGCTAGTCGACGAAATGCATTGAATTCTCTGTTAATGTACCNAGTTTTGTCAGTGA]
[+] EMBL CD127215             [TGCAATTTGGAAAGTTAACTAATTCCTATCAATCCAGCCGGCAGTGTGGTGATTAAGATAATTGATCTGACATGAAAATATATCTGTATGCTTTAATGAAGCTAATACATATCGATTTAAGATATCTTTTTTTAAACAAACACTATTTCTATTTCGTTAACGAGAATATCACCACTGTGACACCTGATAAAACTTATCAGAATTAAAAAAAACTTCTTCAGAGTTAAAGGTAATCGGGTTTTTATCTCATAAATCTGCTTCAAAAAAGATTATAAAACCTACATACTTGGTATTCATAATCTTGCGTCTTCACCTTCCTTCCTCTTCTGGATGAACGAAATGCTACACTTGCTGCGCGCGCTGCTGATGCTCGTCTCATTGCACTACTACCACGACGTGGTGCTTTATCATTACCTAAATTATCCAATTTCTGTCTTTGAAAATAAATCCATCGGTACATTTCTTTCAACTCGTACAGTATGACATAATGAAAGTAGAAGCAGTAGGGGTTTGTACACTATTTACCCGTAGGTGATTGACTAGAGGAGTCGGTTATTGGTCTTAATGGACAGCTTCTG AAATTCATCC ACTCTTCTTGA TCTCTCGACTG ACTGGAG TCTGA AGCTT TCTGTCCGTACCG ATCACTC AAGGTGAATCTGTGTACG AACAACCA TATTTTC AAGTG  AAACACCCTATATGTGGCT GTCGACAAATTGCATTG ATTCT TG TAATGTACC AG TTTGGCAGTG ]


>consensus_3666#0 TGCAATTTGGAAAGTTAACTAATTCCTATCAATCCAGCCGGCAGTGTGGTGATTAAGATA ATTGATCTGACATGAAAATATATCTGTATGCTTTAATGAAGCTAATACATATCGATTTAA GATATCTTTTTTTAAACAAACACTATTTCTATTTCGTTAACGAGAATATCACCACTGTGA CACCTGATAAAACTTATCAGAATTAAAAAAAACTTCTTCAGAGTTAAAGGTAATCGGGTT TTTATCTCATAAATCTGCTTCAAAAAAGATTATAAAACCTACATACTTGGTATTCATAAT CTTGCGTCTTCACCTTCCTTCCTCTTCTGGATGAACGAAATGCTACACTTGCTGCGCGCG CTGCTGATGCTCGTCTCATTGCACTACTACCACGACGTGGTGCTTTATCATTACCTAAAT TATCCAATTCTGTCTTTGAAAATAAATCCATCGGTACATTTCTTTCAACTCGTACAGTAT GACATAATGAAAGTAGAAGCAGTAGGGGTTTGTACACTATTTACCGTAGGTGATTGACTA GAGGAGTCGGGTATTGTTCTTATTGTACAGCTTCTGAAAATTCATCCAACTCTTCTTGAT TCTCTCGACTGAACTGGAGTTCTGACAGCTTCTCTGTCCGTACCGTATCACTCAAAGGTG AATCTGTGTACGAAACAACCATTATTTTCAAAGTGAAAAACACCCTAGATGTGGCTAGTC GACGAAATGCATTGAATTCTCTGTTAATGTACCNAGTTTTGTCAGTGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)