cluster # 3792

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Schistosoma mansoni
cluster # 3792 cluster # 3792 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3792#0 length = 1052 sequences # 2

consensusID : consensus_3792#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1052
fasta sequence

                              [GGTTACTCTTTTTATAATACACTACTACTACTACTACTACTACCACTACCACTACCACTACTACTACTAATAATAATAATAATAATAATCATTGAATTATGCTTATAGTACATGTTGCATTACCTACATTTATTTGTGTAGAACAATTTATTATAACTAAATTATATTTTAAAAGATCTATTCATACTATTACATATGATAATCTTATTACAAAATTATGTGAATATACTAAAACAAAAAAAGGAAAATTTTATATATCATGGCATGATGGAACTGAATATTGTGTGTCGAATTCATCTAATCTGAGAGAAGCAATTGTACGAATGATATATGATCGTGAAGATAATACACCTTTATTATTTGCTGCCCCAGTACTTCACTTAAATGAAACGAAATTACCTTCATTCTATGGTGGATGTAGACCAGAGAATTTACCAAGTGATTTTCGTGAACGTGCATCAAGAGCTGTATTTAATAAAGAAATCGATTACAAAGAACCTGAATTACCTGTTATCATTGAATTAATATGTAACATATGTAATANAAACAATTGGTGTGGTGATCGATTCACATGTGTTATATGTCCTAGAGTTGTATTATGCCCTGATTGTTTTAAAAAAAAACCATCACTCAGAACATCCAATGTTGATTACTAGAGATAATGCAGAATTTCCATGTCCAGTATTACAAGCAGTTAAAATTGTCGCTTCAGATGTTATTGTAGAAGATTTTACTGATGAAGAAGATGAACAATCAGATTTATCTGATCCTAGAACATCATCATCTACCACTACAAATGATTCTGATGATATTCACAAAACAATTGATGCACTTCGTGAAATGGGTTTTAAACAGAAAACTAGTGAATTAGTTGAATTAGTCATAAAAGAACGTGGTAATTTACAGACAATTGTTGAAAAGTTAGCTAATTAAAAATGAGTGTTCTCAATGTTTTCCAGAGTCACCAATCATCAATTCCCGTTTCGGTAGATATCATTGATTATTATGGTTCTACCAAAATTGGTCTATATAATAACAAATTAAATGATGTT]

[+] EMBL CD078922             [GGTTACTCTTTTTATAATACACTACTACTACTACTACTACTACCACTACCACTACCACTACTACTACTAATAATAATAATAATAATAATCATTGAATTATGCTTATAGTACATGTTGCATTACCTACATTTATTTGTGTAGAACAATTTATTATAACTAAATTATATTTTAAAAGATCTATTCATACTATTACATATGATAATCTTATTACAAAATTATGTGAATATACTAAAACAAAAAAAGGAAAATTTTATATATCATGGCATGATGGAACTGAATATTGTGTGTCGAATTCATCTAATCTGAGAGAAGCAATTGTACGAATGATATATGATCGTGAAGATAATACACCTTTATTATTTGCTGCCCCAGTACTTCACTTAAATGAAACGAAATTACCTTCATTCTATGGTGGATGTAGACCAGAGAATTTACCAAGTGATTTTCGTGAACGTGCATCAAGAGCTGTATTTAATAAAGAAATCGATTACAAAGAACCTGAATTACCTGTTATCATTGAATTAATATGTAACATATGTAATANAAACAATTGGTGTGGTGATCGATTCACATGTGTTATATGTCCTAGAGTTGTATTATGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD073379             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAGAAATCGATTACAAAGAACCTGAATTACCTGTTATCATTGAATTAATATGTAACATATGTAATAAAAACAATTGGTGTGGTGATCGATTCACATGTGTTATATGTCCTAGAGTTGTATTATGCCCTGATTGTTTTAAAAAAAAACCATCACTCAGAACATCCAATGTTGATTACTAGAGATAATGCAGAATTTCCATGTCCAGTATTACAAGCAGTTAAAATTGTCGCTTCAGATGTTATTGTAGAAGATTTTACTGATGAAGAAGATGAACAATCAGATTTATCTGATCCTAGAACATCATCATCTACCACTACAAATGATTCTGATGATATTCACAAAACAATTGATGCACTTCGTGAAATGGGTTTTAAACAGAAAACTAGTGAATTAGTTGAATTAGTCATAAAAGAACGTGGTAATTTACAGACAATTGTTGAAAAGTTAGCTAATTAAAAATGAGTGTTCTCAATGTTTTCCAGAGTCACCAATCATCAATTCCCGTTTCGGTAGATATCATTGATTATTATGGTTCTACCAAAATTGGTCTATATAATAACAAATTAAATGATGTT]




>consensus_3792#0
GGTTACTCTTTTTATAATACACTACTACTACTACTACTACTACCACTACCACTACCACTA
CTACTACTAATAATAATAATAATAATAATCATTGAATTATGCTTATAGTACATGTTGCAT
TACCTACATTTATTTGTGTAGAACAATTTATTATAACTAAATTATATTTTAAAAGATCTA
TTCATACTATTACATATGATAATCTTATTACAAAATTATGTGAATATACTAAAACAAAAA
AAGGAAAATTTTATATATCATGGCATGATGGAACTGAATATTGTGTGTCGAATTCATCTA
ATCTGAGAGAAGCAATTGTACGAATGATATATGATCGTGAAGATAATACACCTTTATTAT
TTGCTGCCCCAGTACTTCACTTAAATGAAACGAAATTACCTTCATTCTATGGTGGATGTA
GACCAGAGAATTTACCAAGTGATTTTCGTGAACGTGCATCAAGAGCTGTATTTAATAAAG
AAATCGATTACAAAGAACCTGAATTACCTGTTATCATTGAATTAATATGTAACATATGTA
ATANAAACAATTGGTGTGGTGATCGATTCACATGTGTTATATGTCCTAGAGTTGTATTAT
GCCCTGATTGTTTTAAAAAAAAACCATCACTCAGAACATCCAATGTTGATTACTAGAGAT
AATGCAGAATTTCCATGTCCAGTATTACAAGCAGTTAAAATTGTCGCTTCAGATGTTATT
GTAGAAGATTTTACTGATGAAGAAGATGAACAATCAGATTTATCTGATCCTAGAACATCA
TCATCTACCACTACAAATGATTCTGATGATATTCACAAAACAATTGATGCACTTCGTGAA
ATGGGTTTTAAACAGAAAACTAGTGAATTAGTTGAATTAGTCATAAAAGAACGTGGTAAT
TTACAGACAATTGTTGAAAAGTTAGCTAATTAAAAATGAGTGTTCTCAATGTTTTCCAGA
GTCACCAATCATCAATTCCCGTTTCGGTAGATATCATTGATTATTATGGTTCTACCAAAA
TTGGTCTATATAATAACAAATTAAATGATGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case