Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4041 cluster # 4041       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4041#0 length = 613 sequences # 2  

consensusID : consensus_4041#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 613
fasta sequence
                              [GCCTTCATAAAACTATTAGTCATTTAACTATAATTCAATTCCACAGCATTGCATTAAAAATATCCAATTTGTGTGTCTATTAATTTCTAGGAATTATGATCCGTTGTAGTCTGATATTCTAATAATACAGTCAAGTAAATTATATTTCAGAGTAAAAGACCGTTTATTATATTAACAGGAGGTTGGAGGTGTTAATATGATCGATATATTGATTGCGTAACGGATATACCAGACAAGTTGACAGGTTTGTTGTTTTAAGAGGAAGAAAATTAAAATTTCACAAATGCAATGATTCATTCTCTTTTTTTACGCACTTTGACCACTGAACTTTTTCTTCCTTTAACCTATTTTGAATGGCTACCGTCTGCACGTCATTTACCATATCATATCTTTATGCTTCACATATAGACTTAATGACATATTGAACAATCCTGTAAACATCGAATGAAATCGTATGGCCAATTGGTAAGTGAGACATCCAAATCTGAGTGAATGTATTAAGTAGATCGTGTACGTAGTCGGGGTTACTGCACCATGTTCACATCAGGATCACTCGATTAACCGAAATATGTTGACAAGCATTTGAATATATAGCTTCTTTACGGACTTATTG]

[+] EMBL CD120398             [GCCTTCATAAAACTATTAGTCATTTAACTATAATTCAATTCCACAGCATTGCATTAAAAATATCCAATTTGTGTGTCTATTAATTTCTAGGAATTATGATCCGTTGTAGTCTGATATTCTAATAATACAGTCAAGTAAATTATATTTCAGAGTAAAAGACCGTTTATTATATTAACAGGAGGTTGGAGGTGTTAATATGATCGATATATTGATTGCGTAACGGATATACCAGACAAGTTGACAGGTTTGTTGTTTTAAGAGGAAGAAAATTAAAATTTCACAAATGCAATGATTCATTCTCTTTTTTTACGCACTTTGACCACTGAACTTTTTCTTCCTTTAACCTATTTTGAATGGCTACCGTCTGCACGTCATTTACCATATCATATCTTTATGCTTCACATATAGACTTAATGACATATTGAACAATCCTGTAAACATCGAATGAAATCGTATGGCCAATTGGTAAGTGAGACATCCAAATCTGAGTGAATGTATTAAGTAGATCGTGTACGTAGTCGGGGTTACTGCACCATGTTCACATCAGGATCACTCGATTAACCGAAATATGTTGACAAGCATTTGAATATATAGCTTCTTTACGGACTTAT  ]
[-] EMBL CD120099             [                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATTAAAATTTCACAAATGCAATGATTCATTCTCTTTTTTTACGCACTTTAACCACTGAACTTTTTCTTCCTTTAACCTATTTTGAATGGCTACCGTCTGCACGTCATTTACCATATCATATCTTTATGCTTCACATATAGACTTAATGACATATTGAACAATCCTGTAAACATCGAATGAAATCGTATGGCCAATTGGTAAGTGAGACATCCAAATCTGAGTGAATGTATTAAGTAGATCGTGTACGTAGTCGGGG TACTGCACCATGTTCACATCAGGATCACTCGATTAACCGAAATATGTTGACAAGCATTTGAATATATAGCTTC TTACGGACTTtatg]


>consensus_4041#0 GCCTTCATAAAACTATTAGTCATTTAACTATAATTCAATTCCACAGCATTGCATTAAAAA TATCCAATTTGTGTGTCTATTAATTTCTAGGAATTATGATCCGTTGTAGTCTGATATTCT AATAATACAGTCAAGTAAATTATATTTCAGAGTAAAAGACCGTTTATTATATTAACAGGA GGTTGGAGGTGTTAATATGATCGATATATTGATTGCGTAACGGATATACCAGACAAGTTG ACAGGTTTGTTGTTTTAAGAGGAAGAAAATTAAAATTTCACAAATGCAATGATTCATTCT CTTTTTTTACGCACTTTGACCACTGAACTTTTTCTTCCTTTAACCTATTTTGAATGGCTA CCGTCTGCACGTCATTTACCATATCATATCTTTATGCTTCACATATAGACTTAATGACAT ATTGAACAATCCTGTAAACATCGAATGAAATCGTATGGCCAATTGGTAAGTGAGACATCC AAATCTGAGTGAATGTATTAAGTAGATCGTGTACGTAGTCGGGGTTACTGCACCATGTTC ACATCAGGATCACTCGATTAACCGAAATATGTTGACAAGCATTTGAATATATAGCTTCTT TACGGACTTATTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)