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Schistosoma mansoni
cluster # 4119 cluster # 4119       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4119#0 length = 597 sequences # 3  

consensusID : consensus_4119#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 597
fasta sequence
                              [GCTGATGTCGCTTCGTGGTGAAAACAGTAAATCTAATTCCTAACCCTAATATTCAACTGTAAATCCTAGTCTTAGTTTCCCACACTAATATATAGCCCTCATTTGACCCTGGTAAGTACGTGGGCATTTCAAGGTCATTTTAGCGTTGCTCATAGGTTGTCCATAAATTACGGTCTTACCAAAGTGTTCTCTGAGTATTAATTGTATGTGGGAAAACCGCCAAGTGAGTGATGTTAAAGTTAAATGTTAAGTTTATGGTGAATGACGTTGTTGTTCTTCGTGCTTGCGCCATATGTTACGCGTATCCAATCAATATGCTATGTTGCATAGCTTATGAGTAGCATTGAAAAGTGAGTGGTATATAAGCTGTCGCTGCATAAGTCACTGACTACTAGTGCGAAATCAGTGGCAGTGGTTCAGCCTCAATCGCTTTTCATATTCATCTTAACTTTAAATCACTATCATTCCACACTTTAATTTCCTTCGATCCCATTCGTGTTTATGGAAATGTTTCTTACCCTTAATCTTAN-ATACAATGCATATTACTATCACCTCTTCTCTGATTTTGGTGTTGACGACTTTCTTGCCGTGTTGAAG]

[+] EMBL CD094056             [GCTGATGTCGCTTCGTGGTGAAAACAGTAAATCTAATTCCTAACCCTAATATTCAACTGTAAATCCTAGTCTTAGTTTCCCACACTAATATATAGCCCTCATTTGACCCTGGTAAGTACGTGGGCATTTCAAGGTCATTTTAGCGTTGCTCATAGGTTGTCCATAAATTACGGTCTTACCAAAGTGTTCTCTGAGTATTAATTGTATGTGGGAAAACCGCCAAGTGAGTGATGTTAAAGTTAAATGTTAAGTTTATGGTGAATGACGTTGTTGTTCTTCGTGCTTGCGCCATATGTTACGCGTATCCAATCAATATGCTATGTTGCATAGCTTATGAGTAGCATTGAAAAGTGAGTGGTATATAAGCTGTCGCTGCATAAGTCACTGACTACTAGTGCGAAATCAGTGGCAGTGGTTCAGCCTCAATCGCTTTTCATATTCATCTTAACTTTAAATCACTATCATTCCACACTTTAATTTCCTTCGATCCCATTCGTGTTTATGGAAATGTTTCTTACCCTTAATCTTANAATACAATGCATATTACTATCACCTCTTCTCTGATTTTGGTGTTGACGACTTTCTTGCCGTGTTGAAG]
[+] EMBL CD094090             [GCTGATGTCGCTTCGTGGTGAAAACAGTAAATCTAATTCCTAACCCTAATATTCAACTGTAAATCCTAGTCTTAGTTTCCCACACTAATATATAGCCCTCATTTGACCCTGGTAAGTACGTGGGCATTTCAAGGTCATTTTAGCGTTGCTCATAGGTTGTCCATAAATTACGGTCTTACCAAAGTGTTCTCTGAGTATTAATTGTATGTGGGAAAACCGCCAAGTGAGTGATGTTAAAGTTAAATGTTAAGTTTATGGTGAATGACGTTGTTGTTCTTCGTGCTTGCGCCATATGTTACGCGTATCCAATCAATATGCTATGTTGCATAGCTTATGAGTAGCATTGAAAAGTGAGTGGTATATAAGCTGTCGCTGCATAAGTCACTGACTACTAGTGCGAAATCAGTGGCAGTGGTTCAGCCTCAATCGCTTTTCATATTCATCTTAACTTTAAATCACTATCATTCCACACTTTAATTTCCTTCGATCCCATTCGTGTTTATGGAAATGTTTCTTACCCTTAATCTTAN ATACAATGCATATTACTATCGCCTCTTCTCTGATTTTGGTGTTGACGACTTTCTTGC          ]
[+] EMBL CD094048             [GCTGATGTCGCTTCGTGGTGAAAACAGTAAATCTAATTCCTAACCCTAATATTCAACTGTAAATCCTAGTCTTAGTTTCCCACACTAATATATAGCCCTCATTTGACCCTGGTAAGTACGTGGGCATTTCAAGGTCATTTTAGCGTTGCTCATAGGTTGTCCATAAATTACGGTCTTACCAAAGTGTTCTCTGAGTATTAATTGTATGTGGGAAAACCGCCAAGTGAGTGATGTTAAAGTTAAATGTTAAGTTTAAGGTGAATGACGTTGTTGTTCTTCGTGCTTGCGCCATATGTTACGCGTATCCAATCAATATGCTATGTTGCATAGCTTATGAGTAGCATTGAAAAGTGAGTGGTATATAAGCTGTCGCTGCATAAGTCACTGACTACTAGTGCGAAACCAGTGGCAGTGGTTCAGCCTCAATCGCTTTTCATATTCATCTTAACTTTAAATCACTATCATTCCACACTTTAATTTCCTTCGATCCCACTCGTGTTTATGGAAATGTTTCTTACCCTTAATCTTAN ATACAATGCATATTACTATCACCTCTTCTCTGATTNTGGTGTTGACGACTNTCTTGC          ]


>consensus_4119#0 GCTGATGTCGCTTCGTGGTGAAAACAGTAAATCTAATTCCTAACCCTAATATTCAACTGT AAATCCTAGTCTTAGTTTCCCACACTAATATATAGCCCTCATTTGACCCTGGTAAGTACG TGGGCATTTCAAGGTCATTTTAGCGTTGCTCATAGGTTGTCCATAAATTACGGTCTTACC AAAGTGTTCTCTGAGTATTAATTGTATGTGGGAAAACCGCCAAGTGAGTGATGTTAAAGT TAAATGTTAAGTTTATGGTGAATGACGTTGTTGTTCTTCGTGCTTGCGCCATATGTTACG CGTATCCAATCAATATGCTATGTTGCATAGCTTATGAGTAGCATTGAAAAGTGAGTGGTA TATAAGCTGTCGCTGCATAAGTCACTGACTACTAGTGCGAAATCAGTGGCAGTGGTTCAG CCTCAATCGCTTTTCATATTCATCTTAACTTTAAATCACTATCATTCCACACTTTAATTT CCTTCGATCCCATTCGTGTTTATGGAAATGTTTCTTACCCTTAATCTTANATACAATGCA TATTACTATCACCTCTTCTCTGATTTTGGTGTTGACGACTTTCTTGCCGTGTTGAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)