cluster # 4120

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4120 cluster # 4120 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4120#0 length = 851 sequences # 3

consensusID : consensus_4120#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 851
fasta sequence

                              [GGATGGCCGGGCTGTATAAATTGAACAAAATCTAATTAGATTGACATGAGTGAAAGACAAACCCATCGCTAGTAAGAACTATGGTCAGAAAATAGAACGTTCAGATCACAAAGTGGCAGGTTTCCCACAATTAATACATATTCAAACAATTTTTATTTTACAGGAACACTTAAAATACAGATACTCTTGTGACTTTTAGTTTATTTTGATTAGACATACCACAGAAGCAAAATCCTGGCTTCAAAAGTCTTAACGATCGGATTAAGTACTATATAAACAATACATGGACTCGTGTTGGGCAGTTTAGTTGTTAATTCATAAACTTTATTGATCTTTTTACCT-ACATACTGCAGTTAATCCTTACAACCTTAATGATAACTAACGGATATCAATCCAGATATTTTAGAAGTTTTGCTATGAATCCCTGTTACACTACATACAATTAAACATTTAGTCGACTTGAGGGATATAACCTAGAAAATTCTAAACTGATTTACTCTATTCGAGTACGATTATGTGGAGTCAAAACGCTGTTTGCATCTCGAACCGTCTTGACAATATTTTCAGAAGCATACCTACAACAGTTAGATATTTTAAAGGGAAAAAGGAGCTTAACAAGTACCACTGGACATGGGCTATTTAAATAACAACTCTGACGTATGTGTCCAAAAAGTGAGGAGCCGAACAACAAGATTCTTCAGATTATATACCTGATTGATGTTTTCAGATGCTTTCTTGATAAACTGCATGAAATTTCACCGAGGCATCAGACAATACGCAAATGGNTATGGCGGTTTCAACAGGTTACTTTTGGTAGCTTACTTGATGGCGTTAACGATGACGGTATCCTC]

[+] EMBL CD147555             [GGATGGCCGGGCTGTATAAATTGAACAAAATCTAATTAGATTGACATGAGTGAAAGACAAACCCATCGCTAGTAAGAACTATGGTCAGAAAATAGAACGTTCAGATCACAAAGTGGCAGGTTTCCCACAATTAATACATATTCAAACAATTTTTATTTTACAGGAACACTTAAAATACAGATACTCTTGTGACTTTTAGTTTATTTTGATTAGACATACCACAGAAGCAAAATCCTGGCTTCAAAAGTCTTAACGATCGGATTAAGTACTATATAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD178901             [                   ATTGAACAAAATCTAATTAGATTGACATGAGTGAAAGACAAACCCATCGCTAGTAAGAACTATGGTCAGAAAATAGAACGTTCAGATCACAAAGTGGCAGGTTTCCCACAATTAATACATATTCAAACAATTTTTATTTTACAGGAACACTTAAAATACAGATACTCTTGTGACTTTTAGTTTATTTTGATTAGACATACCACAGAAGCAAAATCCTGGCTTCAAAAGTCTTAACGATGGGATTAAGTACTATAAAAACAATACATGGACTCGTGTTGGGCAGTTTAGTTGTTAATTCATAAACTTTATTGATCTTTTTACCT ACATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD161367             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTTGTTAATTCATAAACTTTATTGATC TTTTACCTAACATACTGCAGTTAATCCTTACAACCTTAATGATAACTAACGGATATCAATCCAGATATTTTAGAAGTTTTGCTATGAATCCCTGTTACACTACATACAATTAAACATTTAGTCGACTTGAGGGATATAACCTAGAAAATTCTAAACTGATTTACTCTATTCGAGTACGATTATGTGGAGTCAAAACGCTGTTTGCATCTCGAACCGTCTTGACAATATTTTCAGAAGCATACCTACAACAGTTAGATATTTTAAAGGGAAAAAGGAGCTTAACAAGTACCACTGGACATGGGCTATTTAAATAACAACTCTGACGTATGTGTCCAAAAAGTGAGGAGCCGAACAACAAGATTCTTCAGATTATATACCTGATTGATGTTTTCAGATGCTTTCTTGATAAACTGCATGAAATTTCACCGAGGCATCAGACAATACGCAAATGGNTATGGCGGTTTCAACAGGTTACTTTTGGTAGCTTACTTGATGGCGTTAACGATGACGGTATCCTC]




>consensus_4120#0
GGATGGCCGGGCTGTATAAATTGAACAAAATCTAATTAGATTGACATGAGTGAAAGACAA
ACCCATCGCTAGTAAGAACTATGGTCAGAAAATAGAACGTTCAGATCACAAAGTGGCAGG
TTTCCCACAATTAATACATATTCAAACAATTTTTATTTTACAGGAACACTTAAAATACAG
ATACTCTTGTGACTTTTAGTTTATTTTGATTAGACATACCACAGAAGCAAAATCCTGGCT
TCAAAAGTCTTAACGATCGGATTAAGTACTATATAAACAATACATGGACTCGTGTTGGGC
AGTTTAGTTGTTAATTCATAAACTTTATTGATCTTTTTACCTACATACTGCAGTTAATCC
TTACAACCTTAATGATAACTAACGGATATCAATCCAGATATTTTAGAAGTTTTGCTATGA
ATCCCTGTTACACTACATACAATTAAACATTTAGTCGACTTGAGGGATATAACCTAGAAA
ATTCTAAACTGATTTACTCTATTCGAGTACGATTATGTGGAGTCAAAACGCTGTTTGCAT
CTCGAACCGTCTTGACAATATTTTCAGAAGCATACCTACAACAGTTAGATATTTTAAAGG
GAAAAAGGAGCTTAACAAGTACCACTGGACATGGGCTATTTAAATAACAACTCTGACGTA
TGTGTCCAAAAAGTGAGGAGCCGAACAACAAGATTCTTCAGATTATATACCTGATTGATG
TTTTCAGATGCTTTCTTGATAAACTGCATGAAATTTCACCGAGGCATCAGACAATACGCA
AATGGNTATGGCGGTTTCAACAGGTTACTTTTGGTAGCTTACTTGATGGCGTTAACGATG
ACGGTATCCTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case