cluster # 4186

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Schistosoma mansoni
cluster # 4186 cluster # 4186 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4186#0 length = 457 sequences # 3

consensusID : consensus_4186#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 457
fasta sequence

                              [ATTGTAGTAGCAGTTGTATTACATCTTTGATGTTCTTCCAACAATGATGATGATGTTAAAGATGGAGAGAATGAAAAAGATGATGATGGAAATATTTTTGGAACAGTTTTTTCATGAGGATCTTGTTGTATACCGCAGTTGATTGGGATAGTAGTTAATAATTTCGTCAAGATATTGATTAACTCTTCTTGTCTACATTCAGATAGCAATGGTTTTTTAGATTCAAGAAAATGTTGATTCATTTGATTTAATGCATTCAATGCATTTTGAACTAATGTATACAAATGTTGTTCATACCAATCCATATCTTCACGATAAGACATTTGACCAGTAGTAGATTGATCTATTATTTCTGTTGTTTCAATATTTATAAATAATTGATTCTTAGAAACAGATGATATTGTATCAATTTGTTGTTGTTGTTCAGAGGATTCTTGTAATTCTAACATATTGATGT]

[+] EMBL CD096775             [ATTGTAGTAGCAGTTGTATTACATCTTTGATGTTCTTCCAACAATGATGATGATGTTAAAGATGGAGAGAATGAAAAAGATGATGATGGAAATATTTTTGGAACAGTTTTTTCATGAGGATCTTGTTGTATACCGCTGTTGATTGGGATAGTAGTTAATAATTTCGTCAAGATATTGATGAACTCTTCTTGTCTACATTCAGATAGCAATGGTTTTTTAGATTCAAGAAAATGTTGATTCATTTGATTTAATGCATTCAATGCATTTTGAACTAATGTATACAAATGTTGTTCATACCAATCCATATCTTCATGATAGGACATTTGACCAGTGGTAGATTGATCTGTTATTTCTGTTGTTTCAATATTTATAAATAATTGATTCTTAGAAACAGATGATATTGTATCAATTTGTTGTTGTTGTTCAGAGGATTCTTGTAATTCTAACATATTGATGT]
[-] EMBL CD066319             [                                                    ATCTTAAAGATGGAGAGAATGAAANAGATGATGATGGAAATATTTTTGGAACAGTTTTTTCATGAGGATCTTGTTGTATACCGCAGTTGATTGGGATAGTAGTTAATAATTTCGTCAAGATATTGATTAACTCTTCTTGTCTACATTCAGATAGCAATGGTTTTTTAGATTCAAGAAAATGTTGATTCATTTGATTTAATGCATTCAATGCATTTTGAACTAATGTATACAAATGTTGTTCATACCAATCCATATCTTCACGATAAGACATTTGACCAGTAGTAGATTGATCTATTATTTCTGTTGTT                                                                                                 ]
[-] EMBL CD066320             [                                                                                                                                   ACCGCAGTTGATTGGGATAGTAGTTAATAATTTCGTCAAGATATTGATTAACTCTTCTTGTCTACATTCAGATAGCAATGGTTTTTTAGATTCAAGAAAATGTTGATTCATTTGATTTAATGCATTCAATGCATTTTGAACTAATGTATACAAATGTTGTTCATACCAATCCATATCTTCACGATAAGACATTTGACCAGTAGTAAATTGATCTATTATTTCTGTTctc                                                                                                 ]




>consensus_4186#0
ATTGTAGTAGCAGTTGTATTACATCTTTGATGTTCTTCCAACAATGATGATGATGTTAAA
GATGGAGAGAATGAAAAAGATGATGATGGAAATATTTTTGGAACAGTTTTTTCATGAGGA
TCTTGTTGTATACCGCAGTTGATTGGGATAGTAGTTAATAATTTCGTCAAGATATTGATT
AACTCTTCTTGTCTACATTCAGATAGCAATGGTTTTTTAGATTCAAGAAAATGTTGATTC
ATTTGATTTAATGCATTCAATGCATTTTGAACTAATGTATACAAATGTTGTTCATACCAA
TCCATATCTTCACGATAAGACATTTGACCAGTAGTAGATTGATCTATTATTTCTGTTGTT
TCAATATTTATAAATAATTGATTCTTAGAAACAGATGATATTGTATCAATTTGTTGTTGT
TGTTCAGAGGATTCTTGTAATTCTAACATATTGATGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case