Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4310 cluster # 4310       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4310#0 length = 602 sequences # 3  

consensusID : consensus_4310#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 602
fasta sequence
                              [CCGGGGGCTACTGACTGTTCCAAAACAAGGAAAAAGGTGGAGAGTTGGGCATGAGGTTAGCGACCCAATCCCGTAGAAAACTAGCTCGCTAAAAAAACGTTA-ACCAGAAAAAACAATATCTATACACAGAGGGATTACCTTTTCATAATTAACATCAGTTTCCAATACTTTGTCAAAGAGACGTTTACCTTCCTAAGAATTTAACCGTATAACATGGAGTATATAGATTTAGGTTTAAGGCTACTTTCTGACTACATATCTCCTAAAAATGACATTACCTCCACATATTTGCAATGTTTCCTTACACAAATAAGACTAATGATAAAGTTTAATAGCGTTATAGCGGTAAATGTTCGTTCAGTTCTATAATTTTTTTCCGTATAACAGATTATTCATTATATTTTTTGTGACACATTAGAGTACTAGAGCCATGAATAAATTTGGTTTTTTTAATCAGTTGATATTTAATGAAAAGGGTATATTATACGCATTCTTCTGTTGTTTTGATATGTTAGCCTAAATATCTCTTAGTGGATAAGAGATATTTTTAGATTATATATATAAATTTATAAAAA-CCTTGAGTTCAGTATCATATATTTAAC]

[+] EMBL CD084557             [CCGGGGGCTACTGACTGTTCCAAAACAAGGAAAAAGGTGGAGAGTTGGGCATGAGGTTAGCGACCCAATCCCGTAGAAAACTAGCTCGCTAAAAAAACGTTANACCAGAAAAAACAATATCTATACACAGAGGGATTACCTTTTCATAATTAACATCAGTTTCCAATACTTTGTCAAAGAGACGTTTACCTTCCTAAGAATTTAACCGTATAACATGGAGTATATAGATTTAGGTTTAAGGCTACTTTCTGACTACATATCTCCTAAAAATGACATTACCTCCACATATTTGCAATGTTTCCTTACACAAATAAGACTAATGATAAAGTTTAATAGCGTTATAGCGGTAAATGTTCGTTCAGTTCTATAATTTTTTTCCGTATAACAGATTATTCATTATATTTTTTGTGACACATTAGAGTACTAGAGCCATGAATAAATTTGGTTTTTTTAATCAGTTGATATTTAATGAAAAGGGTATATTATACGCATTCTTCTGTTGCTTTGATATGTTAGCCTAAATATCTCTTAGTGGATAAGAGATATTTTTAGATTATATATATAAATTTATAAAAA CCTTGAGTTCAGTATCATATATTTAAC]
[+] EMBL CD084589             [CCGGGGGCTACTGACTGTTCCAAAACAAGGAAAAAGGTGGAGAGTTGGGCATGAGGTTAGCGACCCAATCCCGTAGAAAACTAGCTCGCTAAAAAAACGTTA ACCAGAAAAAACAATATCTATACACAGAGGGATTACCTTTTCATAATTAACATCAGTTTCCAATACTTTGTCAAAGAGACGTTTACCTTCCTAAGAATTTAACCGTATAACATGGAGTATATAGATTTAGGTTTAAGGCTACTTTCTGACTACATATCTCCTAAAAATGACATTACCTCCACATATTTGCAATGGTTCCTTACACAAATAAGACTAATGATAAAGTTTAATAGCGTTATAGCGGTAAATGTTCGTTCAGTTCTATAATTTTTTTCCGTATAACAGATTATTCATTATATTTTTTGTGACACATTAGAGTACTAGAGCCATGAATAAATTTGGTTTTTTTAATCAGTTGATATTTAATGAAAAGGGTATATTATACGCATTCTTCTGTTGTTTTGATATGTTAGCCTAAATATCTCTTAGTGGATAAGAGATATTTTTAGATTATATATATAAATTTATAAAAACCCTTGAGCTCAGTATCATATATTTAAC]
[+] EMBL CD084517             [CCGGGGGCTACTGACTGTTCCAAAACAAGGAAAAAGGTGGAGAGTTGGGCATGAGGTTAGCGACCCAATCCCGTAGAAAACTAGCTCGCTAAAAAAACGTTA ACCAGAAAAAACAATATCTATACACAGAGGGATTACCTTTTCATAATTAACATCAGTTTCCAATACTTTGTCAAAGAGACGTTTACCTTCCTAAGAATTTAACCGTATAACATGGAGTATATAGATTTAGGTTTAAGGCTACTTTCTGACTACATATCTCCTAAAAATGACATTACCTCCACATATTTGCAATGTTTCCTTACACAAATAAGACTAATGATAAAGTTTAATAGCGTTATAGCGGTAAATGTTCGTTCAGTTCTATAATTTTTTTCCGTATAACAGATTATTCATTATATTTTTTGTGACACATTAGAGTACTAGAGCCATGAATAAATTTGGTTTTTTTAATCAGTTGATATTTAATGAAAAGGGTATATTATACGCATTCTTCTGTTGTTTTGATATGTTAGCCTAAATATCTCTTATTGGATAAG                                                                ]


>consensus_4310#0 CCGGGGGCTACTGACTGTTCCAAAACAAGGAAAAAGGTGGAGAGTTGGGCATGAGGTTAG CGACCCAATCCCGTAGAAAACTAGCTCGCTAAAAAAACGTTAACCAGAAAAAACAATATC TATACACAGAGGGATTACCTTTTCATAATTAACATCAGTTTCCAATACTTTGTCAAAGAG ACGTTTACCTTCCTAAGAATTTAACCGTATAACATGGAGTATATAGATTTAGGTTTAAGG CTACTTTCTGACTACATATCTCCTAAAAATGACATTACCTCCACATATTTGCAATGTTTC CTTACACAAATAAGACTAATGATAAAGTTTAATAGCGTTATAGCGGTAAATGTTCGTTCA GTTCTATAATTTTTTTCCGTATAACAGATTATTCATTATATTTTTTGTGACACATTAGAG TACTAGAGCCATGAATAAATTTGGTTTTTTTAATCAGTTGATATTTAATGAAAAGGGTAT ATTATACGCATTCTTCTGTTGTTTTGATATGTTAGCCTAAATATCTCTTAGTGGATAAGA GATATTTTTAGATTATATATATAAATTTATAAAAACCTTGAGTTCAGTATCATATATTTA AC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)