These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4310#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 602 fasta sequence [CCGGGGGCTACTGACTGTTCCAAAACAAGGAAAAAGGTGGAGAGTTGGGCATGAGGTTAGCGACCCAATCCCGTAGAAAACTAGCTCGCTAAAAAAACGTTA-ACCAGAAAAAACAATATCTATACACAGAGGGATTACCTTTTCATAATTAACATCAGTTTCCAATACTTTGTCAAAGAGACGTTTACCTTCCTAAGAATTTAACCGTATAACATGGAGTATATAGATTTAGGTTTAAGGCTACTTTCTGACTACATATCTCCTAAAAATGACATTACCTCCACATATTTGCAATGTTTCCTTACACAAATAAGACTAATGATAAAGTTTAATAGCGTTATAGCGGTAAATGTTCGTTCAGTTCTATAATTTTTTTCCGTATAACAGATTATTCATTATATTTTTTGTGACACATTAGAGTACTAGAGCCATGAATAAATTTGGTTTTTTTAATCAGTTGATATTTAATGAAAAGGGTATATTATACGCATTCTTCTGTTGTTTTGATATGTTAGCCTAAATATCTCTTAGTGGATAAGAGATATTTTTAGATTATATATATAAATTTATAAAAA-CCTTGAGTTCAGTATCATATATTTAAC] [+] EMBL CD084557 [CCGGGGGCTACTGACTGTTCCAAAACAAGGAAAAAGGTGGAGAGTTGGGCATGAGGTTAGCGACCCAATCCCGTAGAAAACTAGCTCGCTAAAAAAACGTTANACCAGAAAAAACAATATCTATACACAGAGGGATTACCTTTTCATAATTAACATCAGTTTCCAATACTTTGTCAAAGAGACGTTTACCTTCCTAAGAATTTAACCGTATAACATGGAGTATATAGATTTAGGTTTAAGGCTACTTTCTGACTACATATCTCCTAAAAATGACATTACCTCCACATATTTGCAATGTTTCCTTACACAAATAAGACTAATGATAAAGTTTAATAGCGTTATAGCGGTAAATGTTCGTTCAGTTCTATAATTTTTTTCCGTATAACAGATTATTCATTATATTTTTTGTGACACATTAGAGTACTAGAGCCATGAATAAATTTGGTTTTTTTAATCAGTTGATATTTAATGAAAAGGGTATATTATACGCATTCTTCTGTTGCTTTGATATGTTAGCCTAAATATCTCTTAGTGGATAAGAGATATTTTTAGATTATATATATAAATTTATAAAAA CCTTGAGTTCAGTATCATATATTTAAC] [+] EMBL CD084589 [CCGGGGGCTACTGACTGTTCCAAAACAAGGAAAAAGGTGGAGAGTTGGGCATGAGGTTAGCGACCCAATCCCGTAGAAAACTAGCTCGCTAAAAAAACGTTA ACCAGAAAAAACAATATCTATACACAGAGGGATTACCTTTTCATAATTAACATCAGTTTCCAATACTTTGTCAAAGAGACGTTTACCTTCCTAAGAATTTAACCGTATAACATGGAGTATATAGATTTAGGTTTAAGGCTACTTTCTGACTACATATCTCCTAAAAATGACATTACCTCCACATATTTGCAATGGTTCCTTACACAAATAAGACTAATGATAAAGTTTAATAGCGTTATAGCGGTAAATGTTCGTTCAGTTCTATAATTTTTTTCCGTATAACAGATTATTCATTATATTTTTTGTGACACATTAGAGTACTAGAGCCATGAATAAATTTGGTTTTTTTAATCAGTTGATATTTAATGAAAAGGGTATATTATACGCATTCTTCTGTTGTTTTGATATGTTAGCCTAAATATCTCTTAGTGGATAAGAGATATTTTTAGATTATATATATAAATTTATAAAAACCCTTGAGCTCAGTATCATATATTTAAC] [+] EMBL CD084517 [CCGGGGGCTACTGACTGTTCCAAAACAAGGAAAAAGGTGGAGAGTTGGGCATGAGGTTAGCGACCCAATCCCGTAGAAAACTAGCTCGCTAAAAAAACGTTA ACCAGAAAAAACAATATCTATACACAGAGGGATTACCTTTTCATAATTAACATCAGTTTCCAATACTTTGTCAAAGAGACGTTTACCTTCCTAAGAATTTAACCGTATAACATGGAGTATATAGATTTAGGTTTAAGGCTACTTTCTGACTACATATCTCCTAAAAATGACATTACCTCCACATATTTGCAATGTTTCCTTACACAAATAAGACTAATGATAAAGTTTAATAGCGTTATAGCGGTAAATGTTCGTTCAGTTCTATAATTTTTTTCCGTATAACAGATTATTCATTATATTTTTTGTGACACATTAGAGTACTAGAGCCATGAATAAATTTGGTTTTTTTAATCAGTTGATATTTAATGAAAAGGGTATATTATACGCATTCTTCTGTTGTTTTGATATGTTAGCCTAAATATCTCTTATTGGATAAG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||