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Schistosoma mansoni
cluster # 4519 cluster # 4519       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4519#0 length = 615 sequences # 3  

consensusID : consensus_4519#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 615
fasta sequence
                              [TCGAGGCCAGATAGGCACGAGGATTTCCACACTTTATGGCACTCAGCTGGAATATGCGTAGTGAATATTCCAAAGCTGGTTACGCAATGACGTCTATAATCAATCCGGATTTATGTAAACGAGTTGCTTTACGTTATTCAATAGCATCAAGTTTAGTTTGTTTAGCTGGTGCTGGTTGCAGTGCTATAAGTTTAGGACCATGGGCTGGTTGTGCATTAGGCATTGGCTCATTGCCAGCTAATATAGGTTTAATTTATTATGCATGGAAATTTGCTAAATCCAATTCGAATGTTGGTGATGGAAGTTCTGCTGCTGCAAGACGTTTATTTCGAGCAACATTATTTCATCTACCTGTAGTTATGATCACTGTATTATTGGGTTCTTATTGTTCTATCAATGCTGGACATATGTAGTGATATATCTATAGACGATTGGATTAGGCTTATTAATATATGTACCTAGATATTTTATAACATATTGTCGTTTTCGTTTCTTAGTACATTACCTTTAATTTGTCTCCTTTTTGTATCTCCCATGCTCTGTATGTAAATGGAGTTTTCTTCATACTAGTTGTATTAGTAATTTTTCCCAACAACTTATAATACAGAATGGTTT]

[+] EMBL CD081340             [TCGAGGCCAGATAGGCACGAGGATTTCCACACTTTATGGCACTCAGCTGGAATATGCGTAGTGAATATTCCAAAGCTGGTTACGCAATGACGTCTATAATCAATCCGGATTTATGTAAACGAGTTGCTTTACGTTATTCAATAGCATCAAGTTTAGTTTGTTTAGCTGGTGCTGGTTGCAGTGCTATAAGTTTAGGACCATGGGCTGGTTGTGCATTAGGCATTGGCTCATTGCCAGCTAATATAGGTTTAATTTATTATGCATGGAAATTTGCTAAATCCAATTCGAATGTTGGTGATGGAAGTTCTGCTGCTGCAAGACGTTTATTTCGAGCAACATTATTTCATCTACCTGTAGTTATGATCACTGTATTATTGGGTTCTTATTGTTCTATCAATGCTGGACATATGTAGTGATATATCTATAGACGATTGGATTAGGCTTATTAATATATGTACCTAGATATTTTATAACATATTGTCGTTTTCGTTTCTTAGTACATTACCTTTAATTTGTCTCCTTTTTGTATCTCCCATGCTCTGTATGTAAATGGAGTTTTCTTCATACTAGTTGTATTAGTAATTTTTCCCAAC ACTTATAATACAGAATGGTT ]
[-] EMBL CD075173             [                       TTTCCACACTTTATGGCACTCAGCTGGAATATGCGTAGTGAATATTCCAAAGCTGGTTACGCAATGACGTCTATAATCAATCCGGATTTATGTAAACGAGTTGCTTTACGTTATTCAATAGCATCAAGTTTAGTTTGTTTAGCTGGTGCTGGTTGCAGTGCTATAAGTTTAGGACCATGGGCTGGTTGTGCATTAGGCATTGGCTCATTGCCAGCTAATATAGGTTTAATTTATTATGCATGGAAATTTGCTAAATCCAATTCGAATGTTGGTGATGGAAGTTCTGCTGCTGCAAGACGTTTATTTCGAGCAACATTATTTCATCTACCTGTAGTTATGATCACTGTATTATTGGGTTCTTATTGTTCTATCAATGCTGGACATATGTAGTGATATATCTATAGACGATTGGATTAGGCTTATTAATATATGTACCTAGATATTTTATAACATATTGTCGTTTTCGTTTCTTAGTACATTACCTTTAATTTGTCTCCTTTTTGTATCTCCCATGCTCTGTATGTAAATGGAGTTTTCTTCATACTAGTTGTATTAGTAATTTTTCCCAACAACTTATAATACAGAATGGTTT]
[-] EMBL CD075664             [                                                                                                      ATCCGGATTTATGTAAACGAGTTGCTTTACGTTATTCAATAGCATCAAGTTTAGTTTGTTTAGCTGGTGCTGGTTGCAGTGCTATAAGTTTAGGACCATGGGCTGGTTGTGCATTAGGCATTGGCTCATTGCCAGCTAATATAGGTTTAATTTATTATGCATGGAAATTTGATAAATCCAATTCGAATGTTGGTGATGGAAGTTTTGCTGCTGCAAGACGTTTATTTCGAGCACCATTATTTCATCTACCTGTAGTTATGATCACTGTATTATTGGGTTCTTATTGTTCTATCAATGCTGGACATATGTAGTGATATATCTATAGACGATTGGATTAGGCTTATTAATATATGTACCTAGATATTTTATAACATATTGTCGTTTTCGTTTTTTAGTACATTACCTTTAATTTGTCTCCTTTTTGTATCTCCCATGCTCTGTATGTAAATGGAGTTTTTTTCATACTAGTTGTATTAGTAATTTTTCCCAACAACTTATAATACAGAATGGTTT]


>consensus_4519#0 TCGAGGCCAGATAGGCACGAGGATTTCCACACTTTATGGCACTCAGCTGGAATATGCGTA GTGAATATTCCAAAGCTGGTTACGCAATGACGTCTATAATCAATCCGGATTTATGTAAAC GAGTTGCTTTACGTTATTCAATAGCATCAAGTTTAGTTTGTTTAGCTGGTGCTGGTTGCA GTGCTATAAGTTTAGGACCATGGGCTGGTTGTGCATTAGGCATTGGCTCATTGCCAGCTA ATATAGGTTTAATTTATTATGCATGGAAATTTGCTAAATCCAATTCGAATGTTGGTGATG GAAGTTCTGCTGCTGCAAGACGTTTATTTCGAGCAACATTATTTCATCTACCTGTAGTTA TGATCACTGTATTATTGGGTTCTTATTGTTCTATCAATGCTGGACATATGTAGTGATATA TCTATAGACGATTGGATTAGGCTTATTAATATATGTACCTAGATATTTTATAACATATTG TCGTTTTCGTTTCTTAGTACATTACCTTTAATTTGTCTCCTTTTTGTATCTCCCATGCTC TGTATGTAAATGGAGTTTTCTTCATACTAGTTGTATTAGTAATTTTTCCCAACAACTTAT AATACAGAATGGTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)