cluster # 4535

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Schistosoma mansoni
cluster # 4535 cluster # 4535 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4535#0 length = 861 sequences # 3

consensusID : consensus_4535#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 861
fasta sequence

                              [CTCGAGGGCCAAAATTCGGCACGAGGACAATTTAGATAAACAGGGCTTTCAATGAATTACTATCATATTGGATAATGTTATAATATAATTTACACCAATAATATATAACTGAATCGTTTTATTATATGATTGGTCCAATTCAAGGTCATAGCTTGATGTGCTATATTTGAGTATATGCTCAGTTTATTACTTACCCCTCCTCCAAAAATTTAAGAATATTTTATATCCAATTCACTATTATTGAATCTAATTCTTATTCATATAATTGTTGAATTTATTTTATCAGAGAATTCTTAACATACCTAATTCGTTTAAACTTTGAAACATACCCTATTGTCAGTTATTCTGTTGAATAAATATATTATTTACGAAATATCCAATTAATATGACTAATTATTGGTTTCAACTCTTCTGTTGTATGATTATTGGATTTCTAATACTAACTAGTCATACTAATTGCATGGACTCTGATAATGATCCTTCAGATATCAGTGCAGATAAACGCTTTCTGTTAGCTTTACCGTCACCTAAAAGGTTAAGCCAACCTTCATATTCGTTTAACCGTTACAGACGTCCAATGTATGGATATGGCTATAGACCAGATTATATTGATGCTGATGATGATTTATTCAATGAAGATAAAAGATTTCTACTTGGTCTACCGCCTAAAGTTGAACATAAACGTTTTCTACTTGGTTTACCACCATCACTTAGACAACATAAAAGGTTCATTTTAGGGCTACCAGCACCAACTAGATTTCATTCGTAATTGAAGATAGTTTTAAACACGTGAACACTTACACACATATGCATAC-AAACATTNCA-CAGAC-TATATGTA-TCA-TATAT-ACA-GTCT--GATATAAA]

[+] EMBL CD080106             [CTCGAGGGCCAAAATTCGGCACGAGGACAATTTAGATAAACAGGGCTTTCAATGAATTACTATCATATTGGATAATGTTATAATATAATTTACACCAATAATATATAACTGAATCGTTTTATTATATGATTGGTCCAATTCAAGGTCATAGCTTGATGTGCTATATTTGAGTATATGCTCAGTTTATTACTTACCCCTCCTCCAAAAATTTAAGAATATTTTATATCCAATTCACTATTATTGAATCTAATTCTTATTCATATAATTGTTGAATTTATTTTATCAGAGAATTCTTAACATACCTAATTCGTTTAAACTTTGAAACATACCCTATTGTCAGTTATTCTGTTGAATAAATATATTATTTACGAAATATCCAATTAATATGACTAATTATTGGTTTCAACTCTTCTGTTGTATGATTATTGGATTTCTAATACTAACTAGTCATACTAATTGCATGGACTCTGATAATGATCCTTCAGATATCAGTGCAGATAAACGCTTTCTGTTAGCTTTACCGTCACCTAAAAGGTTAAGCCAACCTTCATATTCGTTTAACCGTTACAGACGTCCAATGTATGGATATGGCTATAGACCAGATTATATTGATGCTGATGATGATTTATTCAATGAAGATAAAAGATTTTTACTTGGTCTACCGCCTAAAGTTGAACATAAACGTTTCCTACTTGGTTTACCACCATCACTTAGACANCATANNAGGTTCATTNTAGGGCTACCAGCACCNACTAGATTTCATTCGTAATTGAAGATAGTTTTAAACACGTG ACACTTAC CACATATGCATAC AAACATTNCA CAGAC TATATGTA TCA TATAT ACA GTCT  GATATA  ]
[+] EMBL CD083060             [                                                                                                                                                                                                                              ATATCCAATTCACTATTATTGAATCTAATTCTTATTCATATAATTGTTGAATTTATTTTATCAGAGAATTCTTAACATACCTAATTCGTTTAAACTTTGAAACATACCCTATTGTCAGTTATTCTGTTGAATAAATATATTATTTACGAAATATCCAATTAATATGACTAATTATTGGTTTCAACTCTTCTGTTGTATGATTATTGGATTTCTAATACTAACTAGTCATACTAATTGCATGGACTCTGATAATGATCCTTCAGATATCAGTGCAGATAAACGCTTTCTGTTAGCTTTACCGTCACCCAAAAGGTTAAGCCAACCTTCATATTCGTTTAACCGTTACAGACGTCCAATGTATGGATATGGCTATAGACCAGATTATATTGATGCTGATGATGATTTATTCAATGAAGATAAAAGATTTCTACTTGGTCTACCGCCTAAAGTTGAACATAAACGTTTTCTACTTGGTTTACCACCATCACTTAGACAACATAAAAGGTTCATTTTAGGGCTACCAGCACCAACTAGATTTCATTCGTAATTGAAGATAGTTNTAAACACGTGAACACTTACACACATATGCATACAAAACATTTCACCAGACATATATGTATTCATTATATAACATGTCTNNGATATAAA]
[-] EMBL CD133584             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CCTTCATATTCGTTTAACCGTTACAGACGTCCAATGTATGGATATGGCTATAGACCAGATTATATTGATGCTGATGATGATTTATTCAATGAAGATAAAAGATTTCTACTTGGTCTACCGCCTAAAGTTGAACATAAACGTTTTCTACTTGGTTTACCACCATCACTTAGACAACATAAAAGGTTCATTTTAGGGCTACCAGCACCAACTAGATTTCATTCGTAATTGAAGATAGTTTTAAACACGTGAACACTTACACACATATGCATAC AA                                                    ]




>consensus_4535#0
CTCGAGGGCCAAAATTCGGCACGAGGACAATTTAGATAAACAGGGCTTTCAATGAATTAC
TATCATATTGGATAATGTTATAATATAATTTACACCAATAATATATAACTGAATCGTTTT
ATTATATGATTGGTCCAATTCAAGGTCATAGCTTGATGTGCTATATTTGAGTATATGCTC
AGTTTATTACTTACCCCTCCTCCAAAAATTTAAGAATATTTTATATCCAATTCACTATTA
TTGAATCTAATTCTTATTCATATAATTGTTGAATTTATTTTATCAGAGAATTCTTAACAT
ACCTAATTCGTTTAAACTTTGAAACATACCCTATTGTCAGTTATTCTGTTGAATAAATAT
ATTATTTACGAAATATCCAATTAATATGACTAATTATTGGTTTCAACTCTTCTGTTGTAT
GATTATTGGATTTCTAATACTAACTAGTCATACTAATTGCATGGACTCTGATAATGATCC
TTCAGATATCAGTGCAGATAAACGCTTTCTGTTAGCTTTACCGTCACCTAAAAGGTTAAG
CCAACCTTCATATTCGTTTAACCGTTACAGACGTCCAATGTATGGATATGGCTATAGACC
AGATTATATTGATGCTGATGATGATTTATTCAATGAAGATAAAAGATTTCTACTTGGTCT
ACCGCCTAAAGTTGAACATAAACGTTTTCTACTTGGTTTACCACCATCACTTAGACAACA
TAAAAGGTTCATTTTAGGGCTACCAGCACCAACTAGATTTCATTCGTAATTGAAGATAGT
TTTAAACACGTGAACACTTACACACATATGCATACAAACATTNCACAGACTATATGTATC
ATATATACAGTCTGATATAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case