These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4568#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 806 fasta sequence [TGGAATATCTGGAAATTCTATACCATTATCTATTGCAGAGATTACTGCTTGCACTTGTGAATGTACACCTGGTACACGATAAATTCCTTCAGAACTTAAACCATATTGTTCAATATAATCGATACAATGACGAAAAAATGCTGGCAGAACAATTCCATCATGACTAGGATTTCTGCTACAGGCTACATCTAAAGGCATTCCAAAAATAGTTTTGTTTACAGTTTTTGTTTGTTCTTTTTTTGTCGATTTATTATGTGAATGTAATTTTAAGCCACGTTTCTTTTTAGTTTTAATTGAATTAGAATGTTGTAAATTTGACTGAGAAACTGTGATCATTGAATCAGTAGTGTTAGTAGTAGTAGTAGTAGTATACTTTAATTTTTTCTCCTCTTTTTTCTTAATTTTCTGTTTTGA-TTTATTATTATTGTTATTATGATTGAGAATAGTACTAAAAGTATTTTCATTTGTAGTCGATGAAATAGTTACCCCAGTAATAGAATTGGTAACTATCGGATCATTTATGCCGTTAGTGGTTTGTTGTAAATCCATAGAGTTTATCTCATTCAATGAACAGGAGTTCTTTTCCATTGATTGATCATTTAATGTATCTTGATAGGTGGTTAATGTTTTAGGCGAAGTATTTAAAATATTAAGTTGGTTTACTTTGTCTTTTTCTTCTTGTTCAACTTCTTCTTTATCTTTTCTACCTTTTTTATGTTTTTTTGATCGAGATAATCCTTTAAAACCGGATTTTGATAATTTTGATGATTTTTGATTTGGATTAGAAGACATTTTGATTTGAACAT] [+] EMBL CD121312 [TGGAATATCTGGAAATTCTATACCATTATCTATTGCAGAGATTACTGCTTGCACTTGTGAATGTACACCTGGTACACGATAAATTCCTTCAGAACTTAAACCATATTGTTCAATATAATCGATACAATGACGAAAAAATGCTGGCAGAACAATTCCATCATGACTAGGATTTCTGCTACAGGCTACATCTAAAGGCATTCCAAAAATAGTTTTGTTTACAGTTTTTGTTTGTTCTTTTTTTGTCGATTTATTATGTGAATGTAATTTTAAGCCACGTTTCTTTTTAGTTTTAATTGAATTAGAATGTTGTAAATTTGACTGAGAAACTGTGATCATTGAATCAGTAGTGTTAGTAGTAGTAGTAGTAGTATACTTTAATTTTTTCTCCTCTTTTTTCTTAATTTTCTGTTTTGA TTTATTATTATTGTTATTATGATTGAGAATAGTACTAAAAGTATT ] [-] EMBL CD121349 [ ACAGTTTTTGTTTGTTCTTTTTTTGTCGATTTATTATGTGAATGTAATTTTAAGCCACGTTTCTTTTTAGTTTTAATTGAATTAGAATGTTGTAAATTTGACTGAGAAACTGTGATCATTGAATCAGTAGTGTTAGTAGTAGTAGTAGTGGTATACTTTAATTTTTTCTCCTCTTTTTTCTTAATTTTCTGTTTTGATTTTATTATTATTGTTATTATGATTGAGAATAGTACTAAAAGTATTTTCATTTGTAGTCGATGAAATAGTTACCCCAGTAATAGAATTGGTAACTATCGGATCATTTATGCCGTTAGTGGTTTGTTGTAAATCCATAGAGTTTATCTCATTCAATGAACAGGAGTTCTTTTCCATTGATTGATCATTTAATGTATCTTGATAGGTGGTTAATGTTTTAGGCGAAGTATTTAAAATATTAAGTTGGTTTACTTTGTCTTT ] [-] EMBL CD140208 [ AGTAGTAGTATACTTTAATTTTTGCTCCTCTTTTTTCTTAATTTTCTGTTTTGA TTTATTATTATTGTTATTATGATTGAGAATAGTACTAAAAGTATTTTCATTTGTAGTCGATGAAATAGTTACCCCAGTAATAGAATTGGTAACTATCGGATCGTTTATGCCGTTAGTGGTTTGTTGTAAATCCATAGAGTTTATCTCATTCAATGAACAGGAGTTCTTTTCCATTGATTGATCATTTAATGTATCTTGATAGGTGGTTAATGTCTTAGGCGAAGTA TTAAAATATTAAGTTGGTTTACTTTGTCCTTTTCTTCTTGTTCAACTTCTTCTTTATCTTTTCTACCTTTTTTATGTTTTTTTGATCGAGATAATCCTTTAAAACCGGATTTTGATAATTTTGATGATTTTTGATTTGGATTAGAAGACATTTTGATTTGAACAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||