Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4690 cluster # 4690       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4690#0 length = 617 sequences # 3  

consensusID : consensus_4690#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 617
fasta sequence
                              [AAATGTTCGAAGATATATATTATTACTACCAAGTTGAAATGTTTCTGGTGAATAATGAAGTGAATTCAGAATTTCGTGAACGATAGATTTATTCAATGATTCATTCTGTTTTAATTCTCTTATTTTTGAACTATTCGGCAGTAATGAAACAAATCTATTACAAAATTCTTTTAGAGATAATCGATCCGGATAACTTTGTTTAACTGCTTGTAGAGTATTAATTAATTCAATGCCACGAATTTGTGCACGTATTAAATTGACACATATACGTGCTGGACTAAGCACTAAATTTTTATTTGGATAACGTTTCATTAATTCAAATAAAAATGAATTGGATGTATTATGATTAATGTCATTGTTATTAATATGATTATCGTCATTTGTAAGACGATCATTAGAGGGATAATTTATTTGCATCAATTGATTAATAGGTATTTCTTCATTTAATTCACATAGACCAGCTGTAGATACAGGTAAAAAAACAATGAATCCAATGCATACCACTTGGTGGACCACCATCATTAAAACCGGATCCAGGATCATTCGGATTATATGAAGCATTGTGTGCAGCACAATCATACAGAGAACGTGTTAATGTATCCATTATGGATTTCACT]

[+] EMBL CD092196             [AAATGTTCGAAGATATATATTATTACTACCAAGTTGAAATGTTTCTGGTGAATAATGAAGTGAATTCAGAATTTCGTGAACGATAGATTTATTCAATGATTCATTCTGTTTTAATTCTCTTATTTTTGAACTATTCGGCAGTAATGAAACAAATCTATTACAAAATTCTTTTAGAGATAATCGATCCGGATAACTTTGTTTAACTGCTTGTAGAGTATTAATTAATTCAATGCCACGAATTTGTGCACGTATTAAATTGACACATATACGTGCTGGACTAAGCACTAAATTTTTATTTGGATAACGTTTCATTAATTCAAATAAAAATGAATTGGATGTATTATGATTAATGTCATTGTTATTAATATGATTATCGTCATTTGTAAGACGATCATTAGAGGGATAATTTATTTGCATCAATTGATTAATAGGTATTTCTTCATTTAATTCACATAGACCAGCTGTAGATACAGGTAAAAAAACAATGAATCCAATGCATACCACTTGGTGGACCACCATCATTAAAACCGGATCCAGGATCATTCGGATTATATGAAGCATTGTGTGCAGCACAATCATACAGAGAACGTGTTAATGTATCCATTATGGATTTCACT]
[+] EMBL CD092159             [AAATGTTCGAAGATATATATTATTACTACCAAGTTGAAATGTTTCTGGTGAATAATGAAGTGAATTCAGAATTTCGTGAACGATAGATTTATTCAATGATTCATTCTGTTTTAATTCTCTTATTTTTGAACTATTCGGCAGTAATGAAACAAATCTATTACAAAATTCTTTTAGAGATAATCGATCCGGATAACTTTGTTTAACTGCTTGTAGAGTATTAATTAATTCAATGCCACGAATTTGTGCACGTATTAAATTGACACATATACGTGCTGGACTAAGCACTAAATTTTTATTTGGATAACGTTTCATTAATTCAAATAAAAATGAATTGGATGTATTATGATTAATGTCATTGTTATTAATATGATTATCGTCATTTGTAAGACGATCATTAGAGGGATAATTTATTTGCATCAATTGATTAATAGGTATTTCTTCATTTAATTCACATAGACCAGCTGTAGATACAGGTAAAAAAACAATGAATCCAATGCATACCACTTGGTGGACCACCATCATTAAAACCGGATCCAGGATCATTCGGATTATATGAAGCATTGTGTGCAGCACAATCATACAGAGAACGTGTTAATGTATCC               ]
[-] EMBL CD112154             [                                                                                                          TGTTTTAATTCTCTTATTTTTGAACTATTCGGCAGTAATGAAACAAATCTATTACAAAATTCTTTTAGAGATAATCGATCCGGATAACTTTGTTTAACTGCTTGTAGAGTATTAATTAATTCAATGCCACGAATTTGTGCACGTATTAAATTGACACATATACGTGCTGGACTAAGCACTAAATTTTTATTTGGATAACGTTTCATTAATTCAAATAAAAATGAATTGGATGTATTATGATTAATGTCATTGTTATTAATATGATTATCGTCATTTGTAAGACGATCATTAGAGGGATAATTTATTTGCATCAATTGATTAATAGGTATTTCTTCATTTAATTCACATAGACCAGCTGTAGATACAGGT AAAAAACAATGAATCCAATGCATACCACTTGGTGGACCACCATCATTAAAACCGGATCCAGGATCATTCGGA TATATGAAGCAT                                                        ]


>consensus_4690#0 AAATGTTCGAAGATATATATTATTACTACCAAGTTGAAATGTTTCTGGTGAATAATGAAG TGAATTCAGAATTTCGTGAACGATAGATTTATTCAATGATTCATTCTGTTTTAATTCTCT TATTTTTGAACTATTCGGCAGTAATGAAACAAATCTATTACAAAATTCTTTTAGAGATAA TCGATCCGGATAACTTTGTTTAACTGCTTGTAGAGTATTAATTAATTCAATGCCACGAAT TTGTGCACGTATTAAATTGACACATATACGTGCTGGACTAAGCACTAAATTTTTATTTGG ATAACGTTTCATTAATTCAAATAAAAATGAATTGGATGTATTATGATTAATGTCATTGTT ATTAATATGATTATCGTCATTTGTAAGACGATCATTAGAGGGATAATTTATTTGCATCAA TTGATTAATAGGTATTTCTTCATTTAATTCACATAGACCAGCTGTAGATACAGGTAAAAA AACAATGAATCCAATGCATACCACTTGGTGGACCACCATCATTAAAACCGGATCCAGGAT CATTCGGATTATATGAAGCATTGTGTGCAGCACAATCATACAGAGAACGTGTTAATGTAT CCATTATGGATTTCACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)