cluster # 4777

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Schistosoma mansoni
cluster # 4777 cluster # 4777 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4777#0 length = 670 sequences # 3

consensusID : consensus_4777#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 670
fasta sequence

                              [TTTCATCACTATTATCCTTCGTCTCTTGTCTTTTGCTAACTTTCTTTACTCAATACAAAGCATACTTCATAAGATTTTCAAAATATCTAGTTTCAGATGAGTTACATTACATAGCAAAGTGTAATTTACTGAATCTTTAATTTTATCAGGGTCATAAATGAACAACATTATTTTTAAAAATGGTAGGTTGGTGCCCATGTATTAGCATTCCTTCATACATACAAGAAATACTTCCTTTTTATGGGTGCTGTTTTGATTATTTTCTCCATTATCAATTAAAACAGCATATGACAATGACAACAATAAAGGGTGATGGAAGCAGATTACTATTACATTTTTCTTTCTTCAGTAAAAGTTTCGACAGTTTTTATTGAATAAAGCGATAGATTCTTCTGTAGTGATGCTGTGATCTCAATTTTCTTGTTTTCCTTTTGCTTCTATTTAAGTTTTTATTCATCATGCTTTGTTTTAAGAACTTGATAACACTGTCATATAGTGTGATTGTATTTTACACAAAATGTCCACTATATGCATTACCTCTGTTATTACCGNATTTGTTGCAGTTGCATATATTTGGGTATTTATCTCATTTGGTGGTTTTCTATCCTCCTCTACAACTTGGGCACCCTATTCCTGGNGCTTATTTTACCTTGGGATACATCGCATGCAT]

[+] EMBL CD143344             [TTTCATCACTATTATCCTTCGTCTCTTGTCTTTTGCTAACTTTCTTTACTCAATACAAAGCATACTTCATAAGATTTTCAAAATATCTAGTTTCAGATGAGTTACATTACATAGCAAAGTGTAATTTACTGAATCTTTAATTTTATCAGGGTCATAAATGAACAACATTATTTTTAAAAATGGTAGGTTGGTGCCCATGTATTAGCATTCCTTCATACATACAAGAAATACTTCCTTTTTATGGGTGCTGTTTTGATTATTTTCTCTATTATCAATTAAAACAGCATATGACAATGACAACAATAAAGGGTGATGGAAGCAGATTACTATTACATTTTTCTTTCTTCAGTAAAAGTTTCGACAGTTTTTATTGAATAAAGCGATAGATTCTTCTGTAGTGATGCTGTGATCTCAATTTTCTTGTTTTCCTTTTGCTTCTATTTAAGTTTTTATTCATCATGCTTTGTTTTAAGAACTTGATAACACTGTCATATAGTGTGATTGTATTTTACACAAAATGTCCACTATATGCATTACCTCTGTTATTACCGNATTTGTTGCAGTTGCATATATTTGGGTATTTATCTCATTTGGTGGTTTTCTATCCTCCTCTACAACTTGGGCACCCTATTCCTGGNGCTTATTTTACCTTGGGATACATCGCATGCAT]
[+] EMBL CD143389             [TTTCATCACTTTTATCCTTCGTCTCTTGTCTTTTGCTAACTTTCTTTACTCAATACAAAGCATACTTCATAAGATTTTCAAAATATCTAGTTTCAGATGAGTTACATTACATAGCAAAGTGTAATTTACTGAATCTTTAATTTTATCAGGGTCATAAATGAACAACATTATTTTTAAAAATGGTAGGTTGGTGCCCATGTATTAGCATTCCTTCATACATACAAGAAATACTTCCTTTTTATGGGTGCTGTTTTGATTATTTTCTCCATTATCAATTAAAACAGCATATGACAATGACAACAATAAAGGGTGATGGAAGCAGATTACTATTACATTTTTCTTTCTTCAGTAAAAGTTTCGACAGTTTTTATTGAATAAAGCGATAGATTCTTCTGTAGTGATGCTGTGATCTCAATTTTCTTGTTTTCCTTTTGCTTCTATNTAAGTTTTTATTCATCATGCTTTGTTTTAAGAACTTGATAACACTGTCATATAGTGTGATTGTATTTTACACAAAATGTCCACTATATGCATTACCTCTNGTATTACCGGATTTGTTGCAGNTGCATATATTTGGGAATTTATCTCATTGGTTGGTTTTCTATCCTCCTCTAACAC TGGNCACCCTATTCCTTGTGCTTATTTTACCTGGTGATACATCGCATGC  ]
[-] EMBL CD126201             [                                                   AATACAAAGCATACTTCATAAGATTTTCAAAATATCTAGTTTCAGATGAGTTACATTACATAGCAAAGTGTAATTTACTGAATCTTTAATTTTATCAGGGTCATAAATGAACAACATTATTTTTAAAAATGGTAGGTTGGTGCCCATGTATTAGCATTCCTTCATACATACAAGAAATACTTCCTTTTTATGGGTGCTGTTTTGATTATTTTCTCCATTATCAATTAAAACAGCATATGACAATGACAACAATAAAGGGTGATGGAAGCAGATTACTATTACATTTTTCTTTCTTCAGTAAAAGTTTCGACAGTTTTTATTGAATAAAGCGATAGATTCTTCTGTAGTGATGCTGTGATCTCAATTTTCTTGTTTTCCTTTTGCTTCTATTTAAGTTTTTATTCATCATGCTTTGTTTTAAGAACTTGATAACACTGTCATATAGTGTGATTGTA TTTACACAAAATGTCCAC ATATGCA TACCTCTGTTATTACCGATTTTGTTGCAGTTGCA ATATTTGTGTA                                                                                          ]




>consensus_4777#0
TTTCATCACTATTATCCTTCGTCTCTTGTCTTTTGCTAACTTTCTTTACTCAATACAAAG
CATACTTCATAAGATTTTCAAAATATCTAGTTTCAGATGAGTTACATTACATAGCAAAGT
GTAATTTACTGAATCTTTAATTTTATCAGGGTCATAAATGAACAACATTATTTTTAAAAA
TGGTAGGTTGGTGCCCATGTATTAGCATTCCTTCATACATACAAGAAATACTTCCTTTTT
ATGGGTGCTGTTTTGATTATTTTCTCCATTATCAATTAAAACAGCATATGACAATGACAA
CAATAAAGGGTGATGGAAGCAGATTACTATTACATTTTTCTTTCTTCAGTAAAAGTTTCG
ACAGTTTTTATTGAATAAAGCGATAGATTCTTCTGTAGTGATGCTGTGATCTCAATTTTC
TTGTTTTCCTTTTGCTTCTATTTAAGTTTTTATTCATCATGCTTTGTTTTAAGAACTTGA
TAACACTGTCATATAGTGTGATTGTATTTTACACAAAATGTCCACTATATGCATTACCTC
TGTTATTACCGNATTTGTTGCAGTTGCATATATTTGGGTATTTATCTCATTTGGTGGTTT
TCTATCCTCCTCTACAACTTGGGCACCCTATTCCTGGNGCTTATTTTACCTTGGGATACA
TCGCATGCAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case