cluster # 4924

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Schistosoma mansoni
cluster # 4924 cluster # 4924 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4924#0 length = 695 sequences # 3

consensusID : consensus_4924#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 695
fasta sequence

                              [GTTTCTTTTAATACATTTTCGTTCCTGGTGATGTTGATTGTCAACACCTAACTAGCCACATATTTTCACCTCCAACTCTTACCCTCTTTGTTTGCAAACTATGTATCAATGGCTTCGATGATGTTATACATTCCTGAAGTAAACAAACTCACTTGACATGTTATTTTAAAACTTCAAATGTTTTGTGCCTAAACAGCTATGCATTTGTGCCTGTCATTGGTTTGAAATTCTTTGAAGTGTCTGAATTTCATTTTACTGTCATAGGAGCATTCGGTTCTTTTATTGCCTAGCTTCATGTTTCGTTATTTTGGTTTTCGAGTCAATCAAAATTCGTGGATTCTAAAAAATTTTAGGCCAGATTCTGTAGAAAGGTAATTGTACTTAATATCATGGACTAGTCCTTTTTGTGTGTTTATCACTAAAGTTCATTGTAAATAATTTTGNCATTGTCTGTGATTCTATTGTAAATGAGCACAAAATTGTAAACGTAAGACCACCTCTTTTGGCCTTTACTGTTAACCTTTTGTTCTGTCAGTGTTCCCATCCAACTAGTCAAAGTTTTAAAATATCCAACTTTGACGTTTATGTACTTAAAGTAGATTAGTAGACTTCATTTGTCAAATTTATTGGCATTTCCCAGGTATTAATGGTAGTCAACATTCCTAAATTCATTGGTAGTGAAATATATTTGAAAA]

[+] EMBL AW017435             [GTTTCTTTTAATACATTTTCGTTCCTGGTGATGTTGATTGTCAACACCTAACTAGCCACATATTTTCACCTCCAACTCTTACCCTCTTTGTTTGCAAACTATGTATCAATGGCTTCGATGATGTTATACATTCCTGAAGTAAACAAACTCACTTGACATGTTATTTTAAAACTTCAAATGTTTTGTGCCTAAACAGCTATGCATTTGTGCCTGTCATTGGTTTGAAATTCTTTGAAGTGTCTGAATTTCATTTTACTGTCATAGGAGCATTCGGTTCTTTTATTGCCTAGCTTCATGTTTCGTTATTTTGGTTTTCGAGTCAATCAAAATTCGTGGATTCTAAAAAATTTTAGGCCAGATTCTGTAGAAAGGTAATTGTACTTAATATCATGGACTAGTCCTTTTTGTGTGTCTATCACTAAAGTTCA                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD141051             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTTTAGGCCAGATTCTGTAGAAAGGTAATCGTACTTAATATCATGGACTAGTCC  TTTGTGTGTTTATCACT AAGTTCATTGTAAATAATTTTGNCATTGTCTGTGATTCTATTGTAAATGAGCACAAAATTGTAAACGTAAGACCACCTCTTTTGGCCTTTACTGTTAACCTTTTGTTCTGTCAGTGTTCCCATCCAACTAGTCAAAGTTTTAAAATATCCAACTTTGACGTTTATGTACTTAAAGTAGATTAGTAGACTTCATTTGTCAAATTTATTGGCATTTCCCAGGTATTAATGGTAGTCAACATTCCTAAATTCATTGGTAGTGAAATATATTTGAAAA]
[-] EMBL CD186169             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTAATATCATGGACTAGTCCTTTTTGTGTGTTTATCACTAAAGTTCATTGTAAATAATTTTTGCATTGTCTGTGATTCTATTGTAAATGCGCACAAAATTGTAAACGTAAGACCACCTCTTTTGGCCTTTACTGTTAACCTTTTGTTCTGTCAGTGTTCCCATCCAACTAGTCAAAGTTTTAAAATATCCAACTTTGACGTTTATGTACTTAAAGTAGATTAGTAGACTTCATTTGTCAAATTTA                                                                     ]




>consensus_4924#0
GTTTCTTTTAATACATTTTCGTTCCTGGTGATGTTGATTGTCAACACCTAACTAGCCACA
TATTTTCACCTCCAACTCTTACCCTCTTTGTTTGCAAACTATGTATCAATGGCTTCGATG
ATGTTATACATTCCTGAAGTAAACAAACTCACTTGACATGTTATTTTAAAACTTCAAATG
TTTTGTGCCTAAACAGCTATGCATTTGTGCCTGTCATTGGTTTGAAATTCTTTGAAGTGT
CTGAATTTCATTTTACTGTCATAGGAGCATTCGGTTCTTTTATTGCCTAGCTTCATGTTT
CGTTATTTTGGTTTTCGAGTCAATCAAAATTCGTGGATTCTAAAAAATTTTAGGCCAGAT
TCTGTAGAAAGGTAATTGTACTTAATATCATGGACTAGTCCTTTTTGTGTGTTTATCACT
AAAGTTCATTGTAAATAATTTTGNCATTGTCTGTGATTCTATTGTAAATGAGCACAAAAT
TGTAAACGTAAGACCACCTCTTTTGGCCTTTACTGTTAACCTTTTGTTCTGTCAGTGTTC
CCATCCAACTAGTCAAAGTTTTAAAATATCCAACTTTGACGTTTATGTACTTAAAGTAGA
TTAGTAGACTTCATTTGTCAAATTTATTGGCATTTCCCAGGTATTAATGGTAGTCAACAT
TCCTAAATTCATTGGTAGTGAAATATATTTGAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case