Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5028 cluster # 5028       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5028#0 length = 541 sequences # 3  
consensusID : consensus_5028#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 541
fasta sequence 
                              [TGTGAGATGTGGGAATCGCCTGGAAGGCATTCTCAAAATGTCCAAGCCACAAAGGCTAGTGCCACAAGATTTTGACAACAATTAAAATGTTATTACTGCATTTAAATACATGTTAGATTTTATTATCATTCTGTCCAAATTATCGACTCCAATATTAAAGTGATTCCAGAACAGTAAATCAATCTGTACTCATATTTACACATTGCATTTTAAGTTAAATTCGTCATACTAATATCCCTTTTCCATTCCCAATGATTATATGATCAATTAGCTTTGTTCACGTAGATTAATTGGTTGTATTCATTTCGACATGATTAATAATTTCATACTGACTTATATTAAAGGTCACCAAAAATATGTTAGCACAATTACAGTTTCCTGTCTGTAGCCGATACTTTCGCAGTCTAATTAGTATTTATATATGTCTATGTACACTGATATAAGTAATGACAAGTAATAAGGTTTAACTAACAAACTATTTGGATACGTAGGTAAGGGTGAAACACACTNTATTCAATGTAATGCTTCTCGTCTGTTTAAT]

[+] EMBL CD192172             [TGTGAGATGTGGGAATCGCCTGGAAGGCATTCTCAAAATGTCCAAGCCACAAAGGCTAGTGCCACAAGATTTTGACAACAATTAAAATGTTATTACTGTATTTAAATACATGTTAGATTTTATTATCATTCTGTCCAAATTATCGACTCCAATATTAAAGTGATTCCAGAACAGTAAATCAATCTGTACTCATATTTACACATTGCATTTTAAGTTAAATTCGTCATACTAATATCCCTTTTCCATTCCCAATGATTATATGATCAATTAGCTTTGTTCACGTAGATTAATTGGTTGTATTCATTTCGACATGATTAATAATTTCATACTGACTTATATTAAAGGTCACCAAAAATATGTTAGCACAATTACAGTTTCCTGTCTGTAGCCGATACTTTCGCAGTCTAATTAGTATTTATATATGTCTATGTACACTGATATAAGTAATGACAAGTAATAAGGTTTAACTAACAAACTATTTGGATACGTAGGTAAGGGTGAAACACACTNTATTCAATGTAATGCTTCTCGTCTGTTTAAT]
[+] EMBL CD118958             [TGTGAGATGTGGGAATCGCCTGGAAGGCATTCTCAAAATGTCCAAGCCACAAAGGCTAGTGCCACAAGATTTTGACAACAATTAAAATGTTATTACTGCATTTAAATACATGTTAGATTTTATTATCATTCTGTCCAAATTATCGACTCCAATATTAAAGTGATTCCAGAACAGTAAATCAATCTGTACTCATATTTACACATTGCATTTTAAGTTAAATTCGTCATACTAATATCCCTTTTCCATTCCCAATGATTATATGATCAATTAGCTTTGTTCACGTAGATTAATTGGTTGTATTCATTTCGACATGATTAATAATTTCATACTGACTTATATTAAAGGTCACCAAAAATATGTTAGCACAATTACAGTTTCCTGTCTGTAGCCGATACTTTCGCAGTCTAATTAGTATTTATATATGTCTATGTACACTGATATAA                                                                                                  ]
[+] EMBL CD118935             [TGTGAGATGTGGGAATCGCCTGGAAGGCATTCTCAAAATGTCCAAGCCACAAAGGCTAGTGCCACAAGATTTTGACAACAATTAAAATGTTATTACTGCATTTAAATACATGTTAGATTTTATTATCATTCTGTCCAAATTATCGACTCCAATATTAAAGTGATTCCAGAACAGTAAATCAATCTGTACTCATATTTACACATTGCATTTTAAGTTAAATTCGTCATACTAATATCCCTTTTCCATTCCCAATGATTATATGATCAATTAGCTTTGTTCACGTAGATTAATTGGTTGTATTCATTTCGACATGATTAATAATTTCATACTGACTTATATTAAAGGTCACCAAAAATATGTTAGCACAATTACAGTTTCCTGTCTGTAGCCGATACTTTCGCAGTCTAATTAGTATTTATATATGTCTATGT                                                                                                              ]




>consensus_5028#0
TGTGAGATGTGGGAATCGCCTGGAAGGCATTCTCAAAATGTCCAAGCCACAAAGGCTAGT
GCCACAAGATTTTGACAACAATTAAAATGTTATTACTGCATTTAAATACATGTTAGATTT
TATTATCATTCTGTCCAAATTATCGACTCCAATATTAAAGTGATTCCAGAACAGTAAATC
AATCTGTACTCATATTTACACATTGCATTTTAAGTTAAATTCGTCATACTAATATCCCTT
TTCCATTCCCAATGATTATATGATCAATTAGCTTTGTTCACGTAGATTAATTGGTTGTAT
TCATTTCGACATGATTAATAATTTCATACTGACTTATATTAAAGGTCACCAAAAATATGT
TAGCACAATTACAGTTTCCTGTCTGTAGCCGATACTTTCGCAGTCTAATTAGTATTTATA
TATGTCTATGTACACTGATATAAGTAATGACAAGTAATAAGGTTTAACTAACAAACTATT
TGGATACGTAGGTAAGGGTGAAACACACTNTATTCAATGTAATGCTTCTCGTCTGTTTAA
T

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)