cluster # 5055

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5055 cluster # 5055 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5055#0 length = 492 sequences # 3

consensusID : consensus_5055#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 492
fasta sequence

                              [TAATGTTTCGACTAATATCTGGATTTGAATCAAGTGTAATAGTAACGGGTCCATCGTTAATAAGACTGACATCCATCATTGCGCCAAAAATTCCATCTTTAACTTTTTCTTCATTATAATTCTTCTTTAATCGATTAATCAGTTGTGAATAAATATCTTTAGATAATTTTGGATCCATAGCATTATGAAAATCTAATTTATTACCTTTTAATTCACTATATAATGTGAACTGACTAACACAAAGAATTTCCAGATTTAAATCTTTTACACTTTTATCCCAACGTCTTATTCCATCTAGTGATGGGAATAAACGAATGTTCAGTATTTTCCTAACTATATACTCCATATCACTTTCTGTATCGCGTCTTGATAAGCCAATAAGAACAAGTATTCCACGACCAATTTGACTAACAATTGAATCATTTACACTAACAGATGCTTGTTTAACTCGTTGCACCACAGCACGCATTGCGTGCAAAGAATAATATCACT]

[+] EMBL CD140062             [TAATGTTTCGACTAATATCTGGATTTGAATCAAGTGTAATAGTAACGGGTCCATCGTTAATAAGACTGACATCCATCATTGCGCCAAAAATTCCATCTTTAACTTTTTCTTCATTATAATTCTTCTTTAATCGATTAATCAGTTGTGAATAAATATCTTTAGATAATTTTGGATCCATAGCATTATGAAGATCTAATTTATTACCTTTTAATTCACTATATAATGTGAACTGACTAACACAAAGAATTTCCAGATTTAAATCTTTTACACTTATATCCCAACGTCTTATTCCATCTAGTGATGGGAATAAACGAATGTTCAGTATTTTCCTAACTATATACTCCATATCACTTTCTGTATCGCGTCTTGATAAGCCAATAAGAACAAGTATTCCACGACCAATTTGACTAACAATTGAATCA                                                                      ]
[+] EMBL CD140236             [TAATGTTTCGACTAATATCAGGATTTGAATCAAGTGTAATAGTAACGGGTCCATCGTTAATAAGACTGACATCCATCATTGCGCCAAAAATTCCATCTTTAACTTTTTCTTCATTATAATTCTTCTTTAATCGATTAATCAGTTGTGAATAAATATCTTTAGATAATTTTGGATCCATAGCATTATGAAAATCTAATTTATTACCTTTTAATTCACTATATAATGTGAACTGACTAACACAAAGAATTTCCAGATTTAAATCTTTTACACTTTTATCCCAACGTCTTATTCCATCTAGTGATGGGAATAGACGAATGTTCAGTATTTTCCTAACTATATACTCCATATCACTTTCTGTATCGCGTCTTGATAAGCCCATTAGAAC                                                                                                           ]
[-] EMBL CD140287             [                                                                                         ATTCCATCTTTAACTTTTTCTTCATTATAATTCTTCTTTAATCGATTAATCAGTTGTGAATAAATATCTTTAGATAATTTTGGATCCATAGCATTATGAAAATCTAATTTATTACCTTTTAATTCACTATATAATGTGAACTGACTAACACAAAGAATTTCCAGATTTAAATCTTTTACACTTTTATCCCAACGTCTTATTCCATCTAGTGATGGGAATAAACGAATGTTCAGTATTTTCCTAACTATATACTCCATATCACTTTCTGTATCGCGTCTTGATAAGCCAATAAGAACAAGTATTCCACGACCAATTTGACTAACAATTGAATCATTTACACTAACAGATGCTTGTTTAACTCGTTGCACCACAGCACGCATTGCGTGCAAAGAATAATATCACT]




>consensus_5055#0
TAATGTTTCGACTAATATCTGGATTTGAATCAAGTGTAATAGTAACGGGTCCATCGTTAA
TAAGACTGACATCCATCATTGCGCCAAAAATTCCATCTTTAACTTTTTCTTCATTATAAT
TCTTCTTTAATCGATTAATCAGTTGTGAATAAATATCTTTAGATAATTTTGGATCCATAG
CATTATGAAAATCTAATTTATTACCTTTTAATTCACTATATAATGTGAACTGACTAACAC
AAAGAATTTCCAGATTTAAATCTTTTACACTTTTATCCCAACGTCTTATTCCATCTAGTG
ATGGGAATAAACGAATGTTCAGTATTTTCCTAACTATATACTCCATATCACTTTCTGTAT
CGCGTCTTGATAAGCCAATAAGAACAAGTATTCCACGACCAATTTGACTAACAATTGAAT
CATTTACACTAACAGATGCTTGTTTAACTCGTTGCACCACAGCACGCATTGCGTGCAAAG
AATAATATCACT

clustalw multiple alignements is not computed in this case