These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5056#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 856 fasta sequence [CCCTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAACTCTAATATTGTCCTCTTATTTGACGGATTACAATGACATAGGCTCATCGTCCGCCTTTTTATCTTCCTCTAAATAGAATGATCCCATTTAACTATAAATTTCACAAATGGACATCGACTGAAACTTTTGAACAATAAACAATATTATGCCCAACAACCTCACCTTGCTTTTCAATAATTCTCGTTAGTTTAAGTCTGTGATGGAAAGTTTCTTTAAAACGAGTGAATTTTAAATCATCCATCCAGAAACTGAACATTAATCAATACTTATTTATTCCATGACCATTTATTCCCATCTTCCTCATTCTGATGTTTTCGCTTTTTTTATTTCTAGTCAGAACTACGTTATGTTTCATTTCTGAACAGTATGATGTTTCCTTCTGTTTATTTGTGGATAGTTTTGTGACCTTGATTCACCTTATTGGAGTTTGTCAGTAGGAAACATTTAAATGGGCGAACTTCTGATGCTTTTTTCCATTTTTATTTTCTATAATTTGCTATACTGAGGGTTTTTTCAAAATTTACCTCATGACAAACTGTTTAGTTACATGATATGGTGATTTTAATCACTATCCTGTTATCTTTTAGTTTGACCAAGATCATATCACCGGTTAATTTCATTCGTGACTTCTTTCTTCTATTAATTTATAGAAATTTTCTGAAAGGGAGCTACTAGCGT-AATAATAATGTGCTTTTTTCTATATTA-TCGAAATAAGTCTTCC-AAAAATATTTAAAAATAAATGGATGCTTTCATAATACTTAAAACACTCATCATTTTTCCATCTTACGTAATTTTATTATTTGCTACGCTATTGTAATCTGCGTT] [+] EMBL CD082712 [CCCTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAACTCTAATATTGTCCTCTTATTTGACGGATTACAATGACATAGGCTCATCGTCCGCCTTTTTATCTTCCTCTAAATAGAATGATCCCATTTAACTATAAATTTCACAAATGGACATCGACTGAAACTTTTGAACAATAAACAATATTATGCCCAACAACCTCACCTTGCTTTTCAATAATTCTCGTTAGTTTAAGTCTGTGATGGAAAGTTTCTTTAAAACGAGTGAATTTTAAATCATCCATCCAGAAACTGAACATTAATCAATACTTATTTATTCCATGACCATTTATTCCCATCTTCCTCATTCTGATGTTTTCGCTTTTTTTATTTCTAGTCAGAACTACGTTATGTTTCATTTCTGAACAGTATGATGTTTCCTTCTGTTTATTTGTGGATAGTTTTGTGACCTTGATTCACCTTATTGGAGTTTGTCAGTAGGAAACATTTAAATGGGCGAACTTCTGATGCTTTTTTCCATTTTTATTTTCTATAATTTGCTATACTGAGGGTTTTTTCAAAATTTACCTCATGACAAACTGTTTAGTTACATGATATGGTGATTNTAATCACTATCCTGTTATCTTTTAGTTTGACCAAGATCATATCACCGGTTAATTTCATTCGTGACTTCTTTCTTCTATTAATTTATAGAAATTTTCTGAAAGGGAGCTACTAGCGT AATAATAATGTGCTTTTTTCTATATTATTCGAAATAAGTCTTCC AAAAATATTTAAAAATAAA GGATGCTTT ] [-] EMBL CD076302 [ TTTTCAATAATTCTCGTTAGTTTAAGTCTGTGATGGAAAGTTTCTTTAAAACGAGTGAATTTTAAATCATCCATCCAGAAACTGAACATTAATCAATACTTATTTATTCCATGACCATTTATTCCCATCTTCCTCATTCTGATGTTTTCGCTTTTTTTATTTCTAGTCAGAACTACGTTATGTTTCATTTCTGAACAGTATGATGTTTCCTTCTGTTTATTTGTGGATAGTTTTGTGACCTTGATTCACCTTATTGGAGTTTGTCAGTAGGAAACATTTAAATGGGCGAACTTCTGATGCTTTTTTCCATTTTTATTTTCTATAATTTGCTATACTGAGGGTTTTTTCAAAATTTACCTCATGACAAACTGTTTAGTTACATGATATGGTGATTTTAATCACTATCCTGTTATCTTTTAGTTTGACCAAGATCATATCACCGGTTAATTTCATTCGTGACTTCTTTCTTCTATTAATTTATAGAAATTTTCTGAAAGGGAGCTACTAGCGT AATAATAATGTGCTTTTTTCTATATTA TCGAAATAAGTCTTCCAAAAAATATTTAAAAATAAATGGATGCTTTC ] [+] EMBL AI447066 [ CATTTCTGAACAGTATGATGTTTCCTTCTGTTTATTTGTGGATAGTTTTGTGACCTTGATTCACCTTATTGGAGTTTGTCAGTAGGAAACATTTAAATGGGCGAACTTCTGATGCTTTTTTCCATTTTTATTTTCTATAATTTGCTATACTGAGGGTTTTTTCAAAATTTACCTCATGACAAACTGTTTAGTTACATGATATGGTGATTTTAATCACTATCCTGTTATCTTTTAGTTTGACCAAGATCATATCACCGGTTAATTTCATTCGTGACTTCTTTCTTCTATTAATTTATAGAAATTTTCTGAAAGGGAGCTACTAGCGTGAATAATAATGTGCGTTTTTCTATATTA TCGAAATAAGTCTTCC AAAAATATTT AAAATAAATGGGTGCTTTCATAATACTTAAAACACTCATCATTTTTCCATCTTACGTAATTTTATTATTTGCTACGCTATTGTAATCTGCGTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||