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Schistosoma mansoni
cluster # 5056 cluster # 5056       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5056#0 length = 856 sequences # 3  

consensusID : consensus_5056#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 856
fasta sequence
                              [CCCTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAACTCTAATATTGTCCTCTTATTTGACGGATTACAATGACATAGGCTCATCGTCCGCCTTTTTATCTTCCTCTAAATAGAATGATCCCATTTAACTATAAATTTCACAAATGGACATCGACTGAAACTTTTGAACAATAAACAATATTATGCCCAACAACCTCACCTTGCTTTTCAATAATTCTCGTTAGTTTAAGTCTGTGATGGAAAGTTTCTTTAAAACGAGTGAATTTTAAATCATCCATCCAGAAACTGAACATTAATCAATACTTATTTATTCCATGACCATTTATTCCCATCTTCCTCATTCTGATGTTTTCGCTTTTTTTATTTCTAGTCAGAACTACGTTATGTTTCATTTCTGAACAGTATGATGTTTCCTTCTGTTTATTTGTGGATAGTTTTGTGACCTTGATTCACCTTATTGGAGTTTGTCAGTAGGAAACATTTAAATGGGCGAACTTCTGATGCTTTTTTCCATTTTTATTTTCTATAATTTGCTATACTGAGGGTTTTTTCAAAATTTACCTCATGACAAACTGTTTAGTTACATGATATGGTGATTTTAATCACTATCCTGTTATCTTTTAGTTTGACCAAGATCATATCACCGGTTAATTTCATTCGTGACTTCTTTCTTCTATTAATTTATAGAAATTTTCTGAAAGGGAGCTACTAGCGT-AATAATAATGTGCTTTTTTCTATATTA-TCGAAATAAGTCTTCC-AAAAATATTTAAAAATAAATGGATGCTTTCATAATACTTAAAACACTCATCATTTTTCCATCTTACGTAATTTTATTATTTGCTACGCTATTGTAATCTGCGTT]

[+] EMBL CD082712             [CCCTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAACTCTAATATTGTCCTCTTATTTGACGGATTACAATGACATAGGCTCATCGTCCGCCTTTTTATCTTCCTCTAAATAGAATGATCCCATTTAACTATAAATTTCACAAATGGACATCGACTGAAACTTTTGAACAATAAACAATATTATGCCCAACAACCTCACCTTGCTTTTCAATAATTCTCGTTAGTTTAAGTCTGTGATGGAAAGTTTCTTTAAAACGAGTGAATTTTAAATCATCCATCCAGAAACTGAACATTAATCAATACTTATTTATTCCATGACCATTTATTCCCATCTTCCTCATTCTGATGTTTTCGCTTTTTTTATTTCTAGTCAGAACTACGTTATGTTTCATTTCTGAACAGTATGATGTTTCCTTCTGTTTATTTGTGGATAGTTTTGTGACCTTGATTCACCTTATTGGAGTTTGTCAGTAGGAAACATTTAAATGGGCGAACTTCTGATGCTTTTTTCCATTTTTATTTTCTATAATTTGCTATACTGAGGGTTTTTTCAAAATTTACCTCATGACAAACTGTTTAGTTACATGATATGGTGATTNTAATCACTATCCTGTTATCTTTTAGTTTGACCAAGATCATATCACCGGTTAATTTCATTCGTGACTTCTTTCTTCTATTAATTTATAGAAATTTTCTGAAAGGGAGCTACTAGCGT AATAATAATGTGCTTTTTTCTATATTATTCGAAATAAGTCTTCC AAAAATATTTAAAAATAAA GGATGCTTT                                                                           ]
[-] EMBL CD076302             [                                                                                                                                                                                                      TTTTCAATAATTCTCGTTAGTTTAAGTCTGTGATGGAAAGTTTCTTTAAAACGAGTGAATTTTAAATCATCCATCCAGAAACTGAACATTAATCAATACTTATTTATTCCATGACCATTTATTCCCATCTTCCTCATTCTGATGTTTTCGCTTTTTTTATTTCTAGTCAGAACTACGTTATGTTTCATTTCTGAACAGTATGATGTTTCCTTCTGTTTATTTGTGGATAGTTTTGTGACCTTGATTCACCTTATTGGAGTTTGTCAGTAGGAAACATTTAAATGGGCGAACTTCTGATGCTTTTTTCCATTTTTATTTTCTATAATTTGCTATACTGAGGGTTTTTTCAAAATTTACCTCATGACAAACTGTTTAGTTACATGATATGGTGATTTTAATCACTATCCTGTTATCTTTTAGTTTGACCAAGATCATATCACCGGTTAATTTCATTCGTGACTTCTTTCTTCTATTAATTTATAGAAATTTTCTGAAAGGGAGCTACTAGCGT AATAATAATGTGCTTTTTTCTATATTA TCGAAATAAGTCTTCCAAAAAATATTTAAAAATAAATGGATGCTTTC                                                                          ]
[+] EMBL AI447066             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATTTCTGAACAGTATGATGTTTCCTTCTGTTTATTTGTGGATAGTTTTGTGACCTTGATTCACCTTATTGGAGTTTGTCAGTAGGAAACATTTAAATGGGCGAACTTCTGATGCTTTTTTCCATTTTTATTTTCTATAATTTGCTATACTGAGGGTTTTTTCAAAATTTACCTCATGACAAACTGTTTAGTTACATGATATGGTGATTTTAATCACTATCCTGTTATCTTTTAGTTTGACCAAGATCATATCACCGGTTAATTTCATTCGTGACTTCTTTCTTCTATTAATTTATAGAAATTTTCTGAAAGGGAGCTACTAGCGTGAATAATAATGTGCGTTTTTCTATATTA TCGAAATAAGTCTTCC AAAAATATTT AAAATAAATGGGTGCTTTCATAATACTTAAAACACTCATCATTTTTCCATCTTACGTAATTTTATTATTTGCTACGCTATTGTAATCTGCGTT]


>consensus_5056#0 CCCTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAACTCTAATATTGTCCTCTTATTTGACGGATT ACAATGACATAGGCTCATCGTCCGCCTTTTTATCTTCCTCTAAATAGAATGATCCCATTT AACTATAAATTTCACAAATGGACATCGACTGAAACTTTTGAACAATAAACAATATTATGC CCAACAACCTCACCTTGCTTTTCAATAATTCTCGTTAGTTTAAGTCTGTGATGGAAAGTT TCTTTAAAACGAGTGAATTTTAAATCATCCATCCAGAAACTGAACATTAATCAATACTTA TTTATTCCATGACCATTTATTCCCATCTTCCTCATTCTGATGTTTTCGCTTTTTTTATTT CTAGTCAGAACTACGTTATGTTTCATTTCTGAACAGTATGATGTTTCCTTCTGTTTATTT GTGGATAGTTTTGTGACCTTGATTCACCTTATTGGAGTTTGTCAGTAGGAAACATTTAAA TGGGCGAACTTCTGATGCTTTTTTCCATTTTTATTTTCTATAATTTGCTATACTGAGGGT TTTTTCAAAATTTACCTCATGACAAACTGTTTAGTTACATGATATGGTGATTTTAATCAC TATCCTGTTATCTTTTAGTTTGACCAAGATCATATCACCGGTTAATTTCATTCGTGACTT CTTTCTTCTATTAATTTATAGAAATTTTCTGAAAGGGAGCTACTAGCGTAATAATAATGT GCTTTTTTCTATATTATCGAAATAAGTCTTCCAAAAATATTTAAAAATAAATGGATGCTT TCATAATACTTAAAACACTCATCATTTTTCCATCTTACGTAATTTTATTATTTGCTACGC TATTGTAATCTGCGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)