cluster # 5158

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Schistosoma mansoni
cluster # 5158 cluster # 5158 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5158#0 length = 930 sequences # 3

consensusID : consensus_5158#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 930
fasta sequence

                              [TTCTTTATTTTAAGGATAATTGTTTTAATTGTCATGTTGAAAATTATAATTGATCATAGAAAACGTGTTCAAGAAAAAACATCTCATGCTTACAATCATAAACTTGTATGGTTCAATTCCCGATTGGGGAATCAGTTTACAATGAATAAAAGTCCTATAGAGGAGAAATCAAATGAATCAACGGTACATAATCAATACTGGTCAACAAATGATTTATTGTCTTGTGAATGTGACAGTAATAATGATGATGAAAAATGGCTCCATTCAAATGAAACTGAATATCATAGAGCTAACCTTGATGATAGATTAGGTGTTAATTTTAATTCTGGAATATATGATTGGTCCCAAAGTGAATCTTGGTTAATTGTTCAAAATGCTATAATAAATATCATTCTCTGTAAACCAGATCTAGATATCAGTGAAGCCGTCAGAAATATGAGACAACTGATAAACTCTGGAATTGAAACGGCTACTGTTATTGAATATTGTGAAAAAAAGGTATTACGTAACACTATGCGTACTCTTCGCAGACCATTGGAAAAGTTAAATGGCAATGAACTGATCAGTGAACTAATAGGAATTTGGAAATATTATATAAACTATAGTTATCCTATTATTTTATTGATATTCACTACAGTATCAGNNTCACAAAAGACTGTTGAATACATGTTAGGAGTTTCATTTTTAAAGTATATACTTGAAAGGATGAAAATTGAAGCCATTATCAAAAGCCAGAAAAACAAAATTAATTCGCATGTTAGACACATGTATTGCCCAATACTAACATTCTGTTCAGATAGACTTTCAGTTGACAAAATTCACCAGTATAATCAATTATTAATGAAGTATATTTTACCTGGAATGGAATTCAATGAAAACCAATAGAAGGGAACCCTATTATCATCAGTTTGTTGTTAAGGCAAATATACC]

[+] EMBL CD078297             [TTCTTTATTTTAAGGATAATTGTTTTAATTGTCATGTTGAAAATTATAATTGATCATAGAAAACGTGTTCAAGAAAAAACATCTCATGCTTACAATCATAAACTTGTATGGTTCAATTCCCGATTGGGGAATCAGTTTACAATGAATAAAAGTCCTATAGAGGAGAAATCAAATGAATCAACGGTACATAATCAATACTGGTCAACAAATGATTTATTGTCTTGTGAATGTGACAGTAATAATGATGATGAAAAATGGCTCCATTCAAATGAAACTGAATATCATAGAGCTAACCTTGATGATAGATTAGGTGTTAATTTTAATTCTGGAATATATGATTGGTCCCAAAGTGAATCTTGGTTAATTGTTCAAAATGCTATAATAAATATCATTCTCTGTAAACCAGATCTAGATATCAGTGAAGCCGTCAGAAATATGAGACAACTGATAAACTCTGGAATTGAAACGGCTACTGTTATTGAATATTGTGAAAAAAAGGTATTACGTAACACTATGCGTACTCTTCGCAGACCATTGGAAAAGTTAAATGGCAATGAACTGATCAGTGAACTAATAGGAATTTGGAAATATTATATAAACTATAGTTATCCTATTATTTTATTGATATTCACTACAGTATCAGNNT                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD078384             [TTCTTTATTTTAAGGATAATTGTTTTAATTGTCATGTTGAAAATTATAATTGATCATAGAAAACGTGTTCAAGAAAAAACATCTCATGCTTACAATCATAAACTTGTATGGTTCAATTCCCGATTGGGGAATCAGTTTACAATGAATAAAAGTCCTATAGAGGAGAAATCAAATGAATCAACGGTACATAATCAATACTGGTCAACAAATGATTTATTGTCTTGTGAATGTGACAGTAATAATGATGATGAAAAATGGCTCCATTCAAATGAAACTGAATATCATAGAGCTAACCTTGATGATAGATTAGGTGTTAATTTTAATTCTGGAATATATGATTGGTCCCAAAGTGAATCTTGGTTAATTGTTCAAAATGCTATAATAAATATCATTCTCTGTAAACCAGATCTAGATATCAGTGAAGCCGTCAGAAATATGAGACAACTGATAAACTCTGGAATTGAAACGGCTACTGTTATTGAATATTGTGAAAAAAAGGTATTACGTAACACTATGCGTACTCTTCGCAGACCATTGGAAAAGTTAAATGGCAATGAACTGATCAGTGAACTAATAGGAATTTGGAAATATTATATAAACTATAGTTATCCTATTATTTTATTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD072945             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AACTCTGGAATTGAAACGGCTACTGTTATTGAATATTGTGAAAAAAAGGTATTACGTAACACTATGCGTACTCTTCGCAGACCATTGGAAAAGTTAAATGGCAATGAACTGATCAGTGAACTAATAGGAATTTGGAAATATTATATAAACTATAGTTATCCTATTATTTTATTGATATTCACTACAGTATCAGTTCCACAAAAGACTGTTGAATACATGTTAGGAGTTTCATTTTTAAAGTATATACTTGAAAGGATGAAAATTGAAGCCATTATCAAAAGCCAGAAAAACAAAATTAATTCGCATGTTAGACACATGTATTGCCCAATACTAACATTCTGTTCAGATAGACTTTCAGTTGACAAAATTCACCAGTATAATCAATTATTAATGAAGTATATTTTACCTGGAATGGAATTCAATGAAAACCAATAGAAGGGAACCCTATTATCATCAGTTTGTTGTTAAGGCAAATATACC]




>consensus_5158#0
TTCTTTATTTTAAGGATAATTGTTTTAATTGTCATGTTGAAAATTATAATTGATCATAGA
AAACGTGTTCAAGAAAAAACATCTCATGCTTACAATCATAAACTTGTATGGTTCAATTCC
CGATTGGGGAATCAGTTTACAATGAATAAAAGTCCTATAGAGGAGAAATCAAATGAATCA
ACGGTACATAATCAATACTGGTCAACAAATGATTTATTGTCTTGTGAATGTGACAGTAAT
AATGATGATGAAAAATGGCTCCATTCAAATGAAACTGAATATCATAGAGCTAACCTTGAT
GATAGATTAGGTGTTAATTTTAATTCTGGAATATATGATTGGTCCCAAAGTGAATCTTGG
TTAATTGTTCAAAATGCTATAATAAATATCATTCTCTGTAAACCAGATCTAGATATCAGT
GAAGCCGTCAGAAATATGAGACAACTGATAAACTCTGGAATTGAAACGGCTACTGTTATT
GAATATTGTGAAAAAAAGGTATTACGTAACACTATGCGTACTCTTCGCAGACCATTGGAA
AAGTTAAATGGCAATGAACTGATCAGTGAACTAATAGGAATTTGGAAATATTATATAAAC
TATAGTTATCCTATTATTTTATTGATATTCACTACAGTATCAGNNTCACAAAAGACTGTT
GAATACATGTTAGGAGTTTCATTTTTAAAGTATATACTTGAAAGGATGAAAATTGAAGCC
ATTATCAAAAGCCAGAAAAACAAAATTAATTCGCATGTTAGACACATGTATTGCCCAATA
CTAACATTCTGTTCAGATAGACTTTCAGTTGACAAAATTCACCAGTATAATCAATTATTA
ATGAAGTATATTTTACCTGGAATGGAATTCAATGAAAACCAATAGAAGGGAACCCTATTA
TCATCAGTTTGTTGTTAAGGCAAATATACC

clustalw multiple alignements is not computed in this case