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Schistosoma mansoni
cluster # 5243 cluster # 5243       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5243#0 length = 1286 sequences # 3  

consensusID : consensus_5243#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1286
fasta sequence
                              [CTGAAAAGGAGTCTAAGAAAGTGAAAAAGTCTCGAACAAAACAAGAACAAGAGCCGGTTGTTTCTCCTAAAATCCCAGCTACTGCTGCATTGGCATTGGCATTGACGAATAATCCTAGAGAAGTATTAGACATGCCAGTTGATCCAAATGAACCTACCTACTGTATATGTCAACAAGTATCGTATGGCGAAATGGTTGCGTGCGATAATCGTGATTGTGCAATTGAATGGTTCCATTTTGAGTGTGTTGGTTTGGTGAGCAAACCACGTGGACAATGGTATTGTCCACAGTGTATAGCTCAAGGATTTCCTTTGAAAAAAGATGACTAGTAAAGTCATTGTAGACCACTTTAATTGTTTGACTCTTTTGTTCTTGCACTTTACTATGCTTGTTGTATCTCATCAACAAAATCTACCTCTTTTGTTTCTTTTCACACTATGTAATCTGCACGCTGTAAATAGATGAATATTCTAGTTTTCCATTTTTTCTCCTGTATATAGATATACTTGTTAATACCTCCTCATTTACATACTTCCATGTGAATGTTTAGNTGTTCAGCATGTCAACACCCACCAGAAAGACTAAAAAGCGACATTCCAGCGTACATGCCCCTTTCAAATCTCCATTAAAAAGGATCAATGAAAGTAACAGTTTCACCAATCCTACTATTAACAATCAAACCAATGAAATTAATGAACAACTAGATGTTATTAAAAGTCAATTAAACCTAAATGATATTGATCAACAAACCAATTTATTCCACACTGAGCTACGACACCTCGGGAATGAAAATA-TCACCCTGCTAAAGTTAGTATTGATAATGTCAACGACAACGAGGACAAAGACGAATTGGATGACGACAGTGAAATAGAAAATTGTATTAACAAACTGTTATCAAAGCGACCAAATCAAAGTTGTATTGATTTAGAGGTGGAATTAGCTAAGTGTCGTAATCGTTTACACGCTTACAATGAAGCCAAAGATTCATGTATAATACTATTTGGTCTGTTAGCGAACAATCGAGGTTGTTTAGTCCGAGAATTGTATTTTGAATTCGATTTGAACCTGGACGACTAGAGACTATTAGTTTTTTTGTTAAGATGAAGCGTCTACCAAATCAGAAAGCCAATTTGCGCTGTTTTGCCTTACCTTGCTTGTTCAGAGATCAAGTTTAAAATTTACGACAGCTTTATTGTCCCTCTATTAATATGACTATTGTTATTATTAATTCTAACGTTGTACACACGGCCATGACTTTTTGTCTTGTTTTAAAAATAAAAACTTTT]

[+] EMBL CD078649             [CTGAAAAGGAGTCTAAGAAAGTGAAAAAGTCTCGAACAAAACAAGAACAAGAGCCGGTTGTTTCTCCTAAAATCCCAGCTACTGCTGCATTGGCATTGGCATTGACGAATAATCCTAGAGAAGTATTAGACATGCCAGTTGATCCAAATGAACCTACCTACTGTATATGTCAACAAGTATCGTATGGCGAAATGGTTGCGTGCGATAATCGTGATTGTGCAATTGAATGGTTCCATTTTGAGTGTGTTGGTTTGGTGAGCAAACCACGTGGACAATGGTATTGTCCACAGTGTATAGCTCAAGGATTTCCTTTGAAAAAAGATGACTAGTAAAGTCATTGTAGACCACTTTAATTGTTTGACTCTTTTGTTCTTGCACTTTACTATGCTTGTTGTATCTCATCAACAAAATCTACCTCTTTTGTTTCTTTTCACACTATGTAATCTGCACGCTGTAAATAGATGAATATTCTAGTTTTCCATTTTTTCTCCTGTATATAGATATACTTGTTAATACCTCCTCATTTACATACTTCCATGTGAATGTTTAGNTGTTCAGCATGTCAACACCCACCAGAAAGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD163432             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTTTGACTCTTTTGTTCTTGCACTTTACTATGCTTGTTGTATCTCATCAACAAAATCTACCTCTTTTGTTTCTTTTCACACTATGTAATCTGCACGCTGTAAATAGATGAATATTCTAGTTTTCCATTTTTTCTCCTGTATATAGATATACTTGTTAATACCTCCTCATTTACATACTTCCATGTGAATGTTTAGTTGTTCAGCATGTCAACACCCACCAGAAAGACTAAAAAGCGACATTCCAGCGTACATGCCCCTTTCAAATCTCCATTAAAAAGGATCAATGAAAGTAACAGTTTCACCAATCCTACTATTAACAATCAAACCAATGAAATTAATGAACAACTAGATGTTATTAAAAGTCAATTAAACCTAAATGATATTGATCAACAAACCAATTTATTCCACACTGAGCTACGACACCTCGGGAATGAAAATA TCACCCTGCTAAAGTTAGTATTGATAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD073113             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTTATTAAAAGTCAATTAAACCTAAATGATATTGATCAACAAACCAATTTATTCCACACTGAGCTACGACACCTCGGGAATGAAAATATTCACCCTGCTAAAGTTAGTATTGATAATGTCAACGACAACGAGGACAAAGACGAATTGGATGACGACAGTGAAATAGAAAATTGTATTAACAAACTGTTATCAAAGCGACCAAATCAAAGTTGTATTGATTTAGAGGTGGAATTAGCTAAGTGTCGTAATCGTTTACACGCTTACAATGAAGCCAAAGATTCATGTATAATACTATTTGGTCTGTTAGCGAACAATCGAGGTTGTTTAGTCCGAGAATTGTATTTTGAATTCGATTTGAACCTGGACGACTAGAGACTATTAGTTTTTTTGTTAAGATGAAGCGTCTACCAAATCAGAAAGCCAATTTGCGCTGTTTTGCCTTACCTTGCTTGTTCAGAGATCAAGTTTAAAATTTACGACAGCTTTATTGTCCCTCTATTAATATGACTATTGTTATTATTAATTCTAACGTTGTACACACGGCCATGACTTTTTGTCTTGTTTTAAAAATAAAAACTTTT]


>consensus_5243#0 CTGAAAAGGAGTCTAAGAAAGTGAAAAAGTCTCGAACAAAACAAGAACAAGAGCCGGTTG TTTCTCCTAAAATCCCAGCTACTGCTGCATTGGCATTGGCATTGACGAATAATCCTAGAG AAGTATTAGACATGCCAGTTGATCCAAATGAACCTACCTACTGTATATGTCAACAAGTAT CGTATGGCGAAATGGTTGCGTGCGATAATCGTGATTGTGCAATTGAATGGTTCCATTTTG AGTGTGTTGGTTTGGTGAGCAAACCACGTGGACAATGGTATTGTCCACAGTGTATAGCTC AAGGATTTCCTTTGAAAAAAGATGACTAGTAAAGTCATTGTAGACCACTTTAATTGTTTG ACTCTTTTGTTCTTGCACTTTACTATGCTTGTTGTATCTCATCAACAAAATCTACCTCTT TTGTTTCTTTTCACACTATGTAATCTGCACGCTGTAAATAGATGAATATTCTAGTTTTCC ATTTTTTCTCCTGTATATAGATATACTTGTTAATACCTCCTCATTTACATACTTCCATGT GAATGTTTAGNTGTTCAGCATGTCAACACCCACCAGAAAGACTAAAAAGCGACATTCCAG CGTACATGCCCCTTTCAAATCTCCATTAAAAAGGATCAATGAAAGTAACAGTTTCACCAA TCCTACTATTAACAATCAAACCAATGAAATTAATGAACAACTAGATGTTATTAAAAGTCA ATTAAACCTAAATGATATTGATCAACAAACCAATTTATTCCACACTGAGCTACGACACCT CGGGAATGAAAATATCACCCTGCTAAAGTTAGTATTGATAATGTCAACGACAACGAGGAC AAAGACGAATTGGATGACGACAGTGAAATAGAAAATTGTATTAACAAACTGTTATCAAAG CGACCAAATCAAAGTTGTATTGATTTAGAGGTGGAATTAGCTAAGTGTCGTAATCGTTTA CACGCTTACAATGAAGCCAAAGATTCATGTATAATACTATTTGGTCTGTTAGCGAACAAT CGAGGTTGTTTAGTCCGAGAATTGTATTTTGAATTCGATTTGAACCTGGACGACTAGAGA CTATTAGTTTTTTTGTTAAGATGAAGCGTCTACCAAATCAGAAAGCCAATTTGCGCTGTT TTGCCTTACCTTGCTTGTTCAGAGATCAAGTTTAAAATTTACGACAGCTTTATTGTCCCT CTATTAATATGACTATTGTTATTATTAATTCTAACGTTGTACACACGGCCATGACTTTTT GTCTTGTTTTAAAAATAAAAACTTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)