cluster # 5254

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Schistosoma mansoni
cluster # 5254 cluster # 5254 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_5254#0 length = 1366 sequences # 3
consensusID : consensus_5254#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1366
fasta sequence
                              [GAGCCAT--ATTCGGCACGACGCAGTTTACACTGG-GATCAAATACGTTCAAGTGGAGCCTTTGAGTTTGGAAATTCATTAGGGTCCAACACGTCACTTCTGTACCTAGATCTTTCATGGAATGGATTTAATGGAAAATGTCTGGAAAATCTTGGCAAAGGTTTGACTCGAAATTGTCATTTAAAGGAATTAAACTTGAAATATAATCGTATTGATTTAAAAAGTATTATCCCATTTGCAGATTGTTTATACACAAATAAATCCTTAAAGAAATTATGTCTCGGTTTCAATCCATTGACAATGGCAGGTATACATGAATTAATTTATGTGATTGAAAACTCATCACAGTGTATACTTGAAGAATTAGATTTAGAAGTAAAACAGATCCGGTGACATTTTTAATAAGTTACCTCAGTAGACATGGAATGCGCTTATTGGATTTATACCATTTATTAGATCCTCAACAAACTGGAGTGATAAGTGAAGCTCAATTCACGGAAAGAATGATCAAAAATCAAATTCCGTTAAACCCCGATGATCTCAAAATATTGATTAATTATATTGATTCGGAAAGAACTGACAAAATCACATATAAACTGCTTGCAAGCCGAATTTATTTTTTTCGAATCAGTGTTGGTGAGCAGTTACGAATTAAAGCGACTGAATTATCAAAGCATCAGTTAGATCAACACAGATTATTTGTACGTCCAGAAGGACCAGATATCATTGATAAACCACCAAAAGGATTCCCTTCTAAAGTAAAAAGATCTGTTGGTGATTCAAAAAGATCCCAAATTATCC-AAACGTCAAAGGGCAACGTTATAACGGATCCCAGTAAAAGTACCCAAAACTATGTAAACAGTCAAGAAAAAGTGTATCCGAAAGCAAATTCTAGTGACGAGTTGCAGAAGGAAAACAATGATTTGTCTATAAATTCTACAGAAATTTTAAAAACAAAAGAGAGTAAACCTAATTGGGCATCCATCATTACTAAAGTATCCAGTTATTATTCAGGTGAAGTTTTAGATCGAACGAAAAAGTTGGATCGTGGGAGTATATCAGATAAACGTAAACCTTTAAGTATACCGAAATACAAAAATTTTGGCAAACCAAACGAAACTACAATTAATCCCAAACTTCAAGTTATTCCAATAACTGAAGTTTTCAACAAGAAATATTTTCAAGATTTTCCTTACTCGTAGTTCATGCACAAAAATATACAACGTTTATGATACACAAATTAAAATAATCATGATTTACGTTTTGCAAATACATTAAACGCTTTCCTGTATGTTGAACGAATAAATCATCTGTCTGCTTCAAGCTCTTTAAGAGCTAACTGTATAGACATAATAATTATTAAGAGGTT]

[+] EMBL CD081728             [GAGCCAT  ATTCGGCACGACGCAGTTTACACTGG GATCAAATACGTTCAAGTGGAGCCTTTGAGTTTGGAAATTCATTAGGGTCCAACACGTCACTTCTGTACCTAGATCTTTCATGGAATGGATTTAATGGAAAATGTCTGGAAAATCTTGGCAAAGGTTTGACTCGAAATTGTCATTTAAAGGAATTAAACTTGAAATATAATCGTATTGATTTAAAAAGTATTATCCCATTTGCAGATTGTTTATACACAAATAAATCCTTAAAGAAATTATGTCTCGGTTTCAATCCATTGACAATGGCAGGTATACATGAATTAATTTATGTGATTGAAAACTCATCACAGTGTATACTTGAAGAATTAGATTTAGAAGTAAAACAGATCCGGTGACATTTTTAATAAGTTACCTCAGTAGACATGGAATGCGCTTATTGGATTTATACCATTTATTAGATCCTCAACAAACTGGAGTGATAAGTGAAGCTCAATTCACGGAAAGAATGATCAAAAATCAAATTCCGTTAAACCCCGATGATCTCAAAATATTGATTAATTATATTGATTCGGAAAGAACTGACAAAATCACATATAAACTGCTTGCAAGCCGAATTTATTTTTTTCGAATCAGTGTTGGTGAGCAGTTACGAATTAAAGCGACTGAATTATCAAAGCATCAGTTAGATCAACACAGATTATTTGTACGTCCAGAAGGACCAGATATCATTGATAAACCACCAAAAGGATTCCCTTCTAAAGTAAAAAGATCTGTTGGTGATTCAAAAAGATCCCAAATTATCC AAACGTCAAAGGGCAACGTTATAACGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD081525             [  nCCATNAATTCGGCACCAGGCAGTTTACACTGGNAATCAAATACGTTCAAGTGGAGCCTTTGAGTTTGGAAATTCATTAGGGTCCAACACGTCACTTCTGTACCTAGATCTTTCATGGAATGGATTTAATGGAAAATGTCTGGAAAATCTTGGCAAAGGTTTGACTCGAAATTGTCATTTAAAGGAATTAAACTTGAAATATAATCGTATTGATTTAAAAAGTATTATCCCATTTGCAGATTGTTTATACACAAATAAATCCTTAAAGAAATTATGTCTCGGTTTCAATCCATTGACAATGGCAGGTATACATGAATTAATTTATGTGATTGAAAACTCATCACAGTGTATACTTGAAGAATTAGATTTAGAAGTAAAACAGATCCGGTGACATTTTTAATAAGTTACCTCAGTAGACATGGAATGCGCTTATTGGATTTATACCATTTATTAGATCCTCAACAAACTGGAGTGATAAGTGAAGCTCAATTCACGGAAAGAATGATCAAAAATCAAATTCCGTTAAACCCCGATGATCTCAAAATATTGATTAATTATATTGATTCGGAAAGAACTGACAAAATCACATATAAACTGCTTGCAAGCCGAATTTATTTTTTTCGAATCAGTGTTGGTGAGCAGTTACGAATTAAAGCGACTGAATTATCAAAGCATCAGTTAGATCAACACAGATTATTTGTACGTCCAGAAGGACCAGATATCATTGATAAACCACCAAAAGGATTCCCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD075348             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGTAAAAAGATCTGTTGGTGA TCAAAAAGATCCC AATTATCCAAAACGTCAAAGGCAAACGTTATAACGGATCCCAGTAAAAGTACCCAAAACTATGTAAACAGTCAAGAAAAAGTGTATCCGAAAGCAAATTCTAGTGACGAGTTGCAGAAGGAAAACAATGATTTGTCTATAAATTCTACAGAAATTTTAAAAACAAAAGAGAGTAAACCTAATTGGGCATCCATCATTACTAAAGTATCCAGTTATTATTCAGGTGAAGTTTTAGATCGAACGAAAAAGTTGGATCGTGGGAGTATATCAGATAAACGTAAACCTTTAAGTATACCGAAATACAAAAATTTTGGCAAACCAAACGAAACTACAATTAATCCCAAACTTCAAGTTATTCCAATAACTGAAGTTTTCAACAAGAAATATTTTCAAGATTTTCCTTACTCGTAGTTCATGCACAAAAATATACAACGTTTATGATACACAAATTAAAATAATCATGATTTACGTTTTGCAAATACATTAAACGCTTTCCTGTATGTTGAACGAATAAATCATCTGTCTGCTTCAAGCTCTTTAAGAGCTAACTGTATAGACATAATAATTATTAAGAGGTT]




>consensus_5254#0
GAGCCATATTCGGCACGACGCAGTTTACACTGGGATCAAATACGTTCAAGTGGAGCCTTT
GAGTTTGGAAATTCATTAGGGTCCAACACGTCACTTCTGTACCTAGATCTTTCATGGAAT
GGATTTAATGGAAAATGTCTGGAAAATCTTGGCAAAGGTTTGACTCGAAATTGTCATTTA
AAGGAATTAAACTTGAAATATAATCGTATTGATTTAAAAAGTATTATCCCATTTGCAGAT
TGTTTATACACAAATAAATCCTTAAAGAAATTATGTCTCGGTTTCAATCCATTGACAATG
GCAGGTATACATGAATTAATTTATGTGATTGAAAACTCATCACAGTGTATACTTGAAGAA
TTAGATTTAGAAGTAAAACAGATCCGGTGACATTTTTAATAAGTTACCTCAGTAGACATG
GAATGCGCTTATTGGATTTATACCATTTATTAGATCCTCAACAAACTGGAGTGATAAGTG
AAGCTCAATTCACGGAAAGAATGATCAAAAATCAAATTCCGTTAAACCCCGATGATCTCA
AAATATTGATTAATTATATTGATTCGGAAAGAACTGACAAAATCACATATAAACTGCTTG
CAAGCCGAATTTATTTTTTTCGAATCAGTGTTGGTGAGCAGTTACGAATTAAAGCGACTG
AATTATCAAAGCATCAGTTAGATCAACACAGATTATTTGTACGTCCAGAAGGACCAGATA
TCATTGATAAACCACCAAAAGGATTCCCTTCTAAAGTAAAAAGATCTGTTGGTGATTCAA
AAAGATCCCAAATTATCCAAACGTCAAAGGGCAACGTTATAACGGATCCCAGTAAAAGTA
CCCAAAACTATGTAAACAGTCAAGAAAAAGTGTATCCGAAAGCAAATTCTAGTGACGAGT
TGCAGAAGGAAAACAATGATTTGTCTATAAATTCTACAGAAATTTTAAAAACAAAAGAGA
GTAAACCTAATTGGGCATCCATCATTACTAAAGTATCCAGTTATTATTCAGGTGAAGTTT
TAGATCGAACGAAAAAGTTGGATCGTGGGAGTATATCAGATAAACGTAAACCTTTAAGTA
TACCGAAATACAAAAATTTTGGCAAACCAAACGAAACTACAATTAATCCCAAACTTCAAG
TTATTCCAATAACTGAAGTTTTCAACAAGAAATATTTTCAAGATTTTCCTTACTCGTAGT
TCATGCACAAAAATATACAACGTTTATGATACACAAATTAAAATAATCATGATTTACGTT
TTGCAAATACATTAAACGCTTTCCTGTATGTTGAACGAATAAATCATCTGTCTGCTTCAA
GCTCTTTAAGAGCTAACTGTATAGACATAATAATTATTAAGAGGTT
clustalw multiple alignements is not computed in this case