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Schistosoma mansoni
cluster # 5287 cluster # 5287       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5287#0 length = 990 sequences # 3  

consensusID : consensus_5287#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 990
fasta sequence
                              [TTTTCCCTCTTTGTATAAATTTAATATAGTCATATCTGTATAAAATNGCAACTCATTTATTTGCATCATAAGATAAAATCCAATAAAATAATGTGGTTTCTAACCAAAATTGTTCATTATCAATAGAGTCAACGCGTTTATTTTCAGAATTTCACCTTTTGTTTTCGGAATTCTTTCATCACCATGTAGAGTATGGGGAGTGCTGTTTGTCATTAGTTACTGCTTTGGTCACACATGTTGACATAAGTCATGTCTACAATTAATTGCATATTTTTGTAGTATCGCGTTACGAAATAGTTCTAAGTATTTCCAACTCCATTTGCTTTAACCTAATAGTATTAATTCAATACGGTAATCTAAAGTAACTTTTCTGGTCAACTTCAAGTCACATTTGTTGTGCGAGAGCTAGAAGTACTGACTGTCTCTGAATAACGTAAATTAGAATTTGGGTGTTCTATAATTTTGTGACTGGGTACGTAAAGGCAGCTCCACTATTTACGAGTCAGGACTTTGTCTCTGACGTTTGAAATGAAAAATAACTAGCATTCACAAACATGTAAATTTGCAACCTGTTTTCAACGATATTATATTATTTGTTGGATGATTACTTATTCCATTTATGTCTACTTATCGCGTTGCAACTGTAGTACCTAACGGGATGGGAACCAACGATTCATCTTAATTTTTCTAAATATTCATAGTACTTTTGGCTTTGTTCCATAAAGCGCTCTTCTACAGTTCGTTTGTTTCTCCTTTTGTGGTAATGTTGGTGGCGTGGAAATGATTACTAGGGTCTTTTGCCTAAATACTATCCTTGCGAGTACCATTCAGGGATCGCAGATTAAAATCACTCACAGTTTACAAGGCAGGCAACAATGTCAATACACTAACATTCTTGGGCTTGTAGAAAAATCTAAGGACTCANGAGATTAGTAATTGTTAATCGTTTGATTTTCTTCTTCTGCACTATCGCACACCATTATTCATATA]

[-] EMBL CD111987             [TTTTCCCTCTTTGTATAAATTTAATATAGTCATATCTGTATAAAATNGCAACTCATTTATTTGCATCATAAGATAAAATCCAATAAAATAATGTGGTTTCTAACCAAAATTGTTCATTATCAATAGAGTCAACGCGTTTATTTTCAGAATTTCACCTTTTGTTTTCGGAATTCTTTCATCACCATGTAGAGTATGGGGAGTGCTGTTTGTCATTAGTTACTGCTTTGGTCACACATGTTGACATAAGTCATGTCTACAATTAATTGCATATTTTTGTAGTATCGCGTTACGAAATAGTTCTAAGTATTTCCAACTCCATTTGCTTTAACCTAATAGTATTAATTCAATACGGTAATCTAAAGTAACTTTTCTGGTCAACTTCAAGTCACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD089683             [                                                                                                                                                                                                                                                                            TATTTTTGTAGTATCGCGTTACGAAATAGTTCTAAGTATTTCCAACTCCATTTGCTTTAACCTAATAGTATTAATTCAATACGGTAATCTAAAGTAACTTTTCTGGTCAACTTCAAGTCACATTTGTTGTGCGAGAGCTAGAAGTACTGACTGTCTCTGAATAACGTAAATTAGAATTTGGGTGTTCTATAATTTTGTGACTGGGTACGTAAAGGCAGCTCCACTATTTACGAGTCAGGACTTTGTCTCTGACGTTTGAAATGAAAAATAACTAGCATTCACAAACATGTAAATTTGCAACCTGTTTTCAACGATATTATATTATTTGTTGGATGATTACTTATTCCATTTATGTCTACTTATCGCGTTGCAACTGTAGTACCTAACGGGATGGGAACCAACGATTCATCTTAATTTTTCTAAATATTCATAGTACTTTTGGCTTTGTTCCATAAAGCGCTCTTCTACAGTT                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD194762             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACTGTCTCTGAATAACGTAAATTAGAATTTGGGTGTTCTATAATTTTGTGACTGGGTACGTAAAGGCAGCTCCACTATTTACGAGTCAGGACTTTGTCTCTGACGTTTGAAATGAAAAATAACTAGCATTCACAAACATGTAAATTTGCAACCTGTTTTCAACGATATTATATTATTTGTTGGATGATTACTTATTCCATTTATGCCTACTTATCGCGTTGCAACTGTAGTACCTAACGGGATGGGAACCAACGATTCATCTTAATTTTTCTAAATATTCATAGTACTTTTGGCTTTGTTCCATAAAGCGCTCTTCTACAGTTCGTTTGTTTCTCCTTTTGTGGTAATGTTGGTGGCGTGGAAATGATTACTAGGGTCTTTTGCCTAAATACTATCCTTGCGAGTACCATTCAGGGATCGCAGATTAAAATCACTCACAGTTTACAAGGCAGGCAACAATGTCAATACACTAACATTCTTGGGCTTGTAGAAAAATCTAAGGACTCANGAGATTAGTAATTGTTAATCGTTTGATTTTCTTCTTCTGCACTATCGCACACCATTATTCATATA]


>consensus_5287#0 TTTTCCCTCTTTGTATAAATTTAATATAGTCATATCTGTATAAAATNGCAACTCATTTAT TTGCATCATAAGATAAAATCCAATAAAATAATGTGGTTTCTAACCAAAATTGTTCATTAT CAATAGAGTCAACGCGTTTATTTTCAGAATTTCACCTTTTGTTTTCGGAATTCTTTCATC ACCATGTAGAGTATGGGGAGTGCTGTTTGTCATTAGTTACTGCTTTGGTCACACATGTTG ACATAAGTCATGTCTACAATTAATTGCATATTTTTGTAGTATCGCGTTACGAAATAGTTC TAAGTATTTCCAACTCCATTTGCTTTAACCTAATAGTATTAATTCAATACGGTAATCTAA AGTAACTTTTCTGGTCAACTTCAAGTCACATTTGTTGTGCGAGAGCTAGAAGTACTGACT GTCTCTGAATAACGTAAATTAGAATTTGGGTGTTCTATAATTTTGTGACTGGGTACGTAA AGGCAGCTCCACTATTTACGAGTCAGGACTTTGTCTCTGACGTTTGAAATGAAAAATAAC TAGCATTCACAAACATGTAAATTTGCAACCTGTTTTCAACGATATTATATTATTTGTTGG ATGATTACTTATTCCATTTATGTCTACTTATCGCGTTGCAACTGTAGTACCTAACGGGAT GGGAACCAACGATTCATCTTAATTTTTCTAAATATTCATAGTACTTTTGGCTTTGTTCCA TAAAGCGCTCTTCTACAGTTCGTTTGTTTCTCCTTTTGTGGTAATGTTGGTGGCGTGGAA ATGATTACTAGGGTCTTTTGCCTAAATACTATCCTTGCGAGTACCATTCAGGGATCGCAG ATTAAAATCACTCACAGTTTACAAGGCAGGCAACAATGTCAATACACTAACATTCTTGGG CTTGTAGAAAAATCTAAGGACTCANGAGATTAGTAATTGTTAATCGTTTGATTTTCTTCT TCTGCACTATCGCACACCATTATTCATATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)