cluster # 5317

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5317 cluster # 5317 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5317#0 length = 592 sequences # 3

consensusID : consensus_5317#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 592
fasta sequence

                              [TATTGTATTCCAACTTTAGCTTATTAATGGAGTTAACATGTACATTAGGATTGTTATATCATCTAATCAGTCATAATTGAATAATACGATTAATCATTGTTAAACCGATGGCGTACAAATCCCGGTGACTGTCGTTTCAATTTTTGCTCAAGTTTCTCCATTAATAATGCCAACTGTAAGTATGGCTAATTTCGATAGCGAAGACCTATTGAGTGCTAGGCTCCTATCATTTATGGCTAATGGTGATCAATCGAACTCGGAGGGGCAGTATCATATGAGTGGAAATACTGACTTTAATACATCAAATTTTTGTTCGCTTATGTCGGAATCTGGAAATGCAAGTTTCAACATTAATTCACCAGGTCACCGAAACGTCCAAACCTCACTAATTTACGACAGAACATCTAGTGGGATATCTTTAAGTCCTTCGAATGAAAATGGAGTATATGGTGGGGTACCTGTTAGTCCCATATCAGGGCCAAGTACCCCTCC-TCCGACTG-TATGTCTCAAGCTGANTTGGCCGANTATTTCCCGAATATGCGTTACAACCATATTGGAGTACCTCCTTACTCAGCACTTACGTCTCCATGTC]

[+] EMBL CD180619             [TATTGTATTCCAACTTTAGCTTATTAATGGAGTTAACATGTACATTAGGATTGTTATATCATCTAATCAGTCATAATTGAATAATACGATTAATCATTGTTAAACCGATGGCGTACAAATCCCGGTGACTGTCGTTTCAATTTTTGCTCAAGTTTCTCCATTAATAATGCCAACTGTAAGTATGGCTAATTTCGATAGCGAAGACCTATTGAGTGCTAGGCTCCTATCATTTATGGCTAATGGTGATCAATCGAACTCGGAGGGGCAGTATCATATGAGTGGAAATACTGACTTTAATACATCAAATTTTTGTTCGCTTATGTCGGAATCTGGAAATGCAAGTTTCAACATTAATTCACCAGGTCACCGAAACGTCCAAACCTCACTAATTTACGACAGAACATCTAGTGNGATATCTTTAAGTCCTTCGAATGANAACGGAGTATATGGTGGGGTACCTGTTAGTCCCATATCAGGGCCAAGTACCCCTCCTTNCGACTG TATGTCTCAAGCTGANTTGGCCGANTATTTCCCGAATATGCGTTACAACCATATTGGAGTACCTCCTTACT                     ]
[-] EMBL CD116552             [                                                                                                                                               TTGCTCAAGTTTCTCCATTAATAATGCCAACTGTAAGTATGGCTAATTTCGATAGCGAAGACCTATTGAGTGCTAGGCTCCTATCATTTATGGCTAATGGTGATCAATCGAACTCGGAGGGGCAGTATCATATGAGTGGAAATACTGACTTTAATACATCAAATTTTTGTTCGCTTATGTCGGAATCCGGAAATGCAAGTTTCAACATTAATTCACCAGGTCACCGAAACGTCCAAACCTCACTAATTTACGACAGAACATCTAGTGGGATATCTTTAAGTCCTTCGAATGAAAATGGAGTATATGGTGGGGTACCTGTTAGTCCCATATCAGGGCCAAGTACCCCTCC TCCGACTGTTATGTCTCAAGCTGATTTGGCCGATAATTTCCCGAATATGCGTTACAACCATATTGGAGTACCTCCTTACTCAGCACTTACGTCTCCATGTC]
[+] EMBL CD113719             [                                                                                                                                               cTGCTC CCTGTGTCAATTAATAATGCCAACTGTAAGTATGGCTAATTTCGATAGCGAAGACCTATTGAGTGCTAGGCTCCTATCATTTATGGCTAATGGTGATCAATCGAACTCGGAGGGGCAGTATCATATGAGTGGAAATACTGACTTTAATACATCAAATTATTGTTCGCTTATGTCGGAATCTGGAAATGCAAGTTTCAACATTAATTCACCAGGTCACCGAAACGTCCAAACCTCACTAATTTACGACAGAACATCTAGTGGGATATCCTTAAGTCCTTCGAATGAAAATGGAGTATATGGTGGGGTACCTGTTAGTCCCATATCAGGGCCAAGTACCCCTCC TCCGACTG Ttat                                                                                        ]




>consensus_5317#0
TATTGTATTCCAACTTTAGCTTATTAATGGAGTTAACATGTACATTAGGATTGTTATATC
ATCTAATCAGTCATAATTGAATAATACGATTAATCATTGTTAAACCGATGGCGTACAAAT
CCCGGTGACTGTCGTTTCAATTTTTGCTCAAGTTTCTCCATTAATAATGCCAACTGTAAG
TATGGCTAATTTCGATAGCGAAGACCTATTGAGTGCTAGGCTCCTATCATTTATGGCTAA
TGGTGATCAATCGAACTCGGAGGGGCAGTATCATATGAGTGGAAATACTGACTTTAATAC
ATCAAATTTTTGTTCGCTTATGTCGGAATCTGGAAATGCAAGTTTCAACATTAATTCACC
AGGTCACCGAAACGTCCAAACCTCACTAATTTACGACAGAACATCTAGTGGGATATCTTT
AAGTCCTTCGAATGAAAATGGAGTATATGGTGGGGTACCTGTTAGTCCCATATCAGGGCC
AAGTACCCCTCCTCCGACTGTATGTCTCAAGCTGANTTGGCCGANTATTTCCCGAATATG
CGTTACAACCATATTGGAGTACCTCCTTACTCAGCACTTACGTCTCCATGTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case