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Schistosoma mansoni
cluster # 5356 cluster # 5356       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5356#0 length = 888 sequences # 3  

consensusID : consensus_5356#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 888
fasta sequence
                              [GTATACATTTTGTGATGTAGAGCATCCAGGATGAAAATGAAGTTGTGGGATTAATTTACGATAATCAACATCTTCAGTAGACGTTGAGCACCATTGTTGAGTAGGATATAATGATTGGTTGATATTGTTGATAGTATTACTTGCGATGAAAGGACGTAGATCAATATCGCCAACAGAATCTATTGACGATGTTTCAACAGTCTGATTCTCCATTTTTATATTTTCAGTAGATAGTGCTTCTTTATTAAACTGAACAGGAGTTGGTACGTAAGGGTCTTTCGACAATGAATTAAACAAAGATGAACTTAATTTATCATCTGATGGCAAATTAACTGCGATTTCTTCTGTATTGCTTGGTGTCTCTTGATCAGGATTCAATATTGGCGGTGAGGATGATGATGATGATAATAAAGATGGTACAGGATGTGAAATATTTTCGGCATTTGATGTCACATTGATTGGTCTAGTCAATATAATTAATAGTTGATTTTCTACAGTGGCATCACACCCGGTTAACTGGAATTTCGATAACAAATTCACCGGTAATAGTATATCTTTTAAATGAGTATTTCCTATCAATGGATAGAGTAAACAATCATTTATACCCTGAAAACGCGGTTCTAAGCTACCACATGCATTGATCTCTTTTAAATGATTAAATATATCTTTATAGATATGAGACATTTGTTTAGTTCTTGGTGTAACACGAAGTGCAAACAATTCTCTAGGATGTGTTGAATCTAACAATGTCTGTCCTAAATAGACTGGTAAACTGATTAAATTCACTCCACGACTAACAACGAGTGATGTTTGTTTACCTATTAATAAAGATTCCCATTGGATCATTTCATTTCTATCATTATTACTAGGATAATTTAATATTTTACG]

[-] EMBL CD155733             [GTATACATTTTGTGATGTAGAGCATCCAGGATGAAAATGAAGTTGTGGGATTAATTTACGATAATCAACATCTTCAGTAGACGTTGAGCACCATTGTTGAGTAGGATATAATGATTGGTTGATATTGTTGATAGTATTACTTGCGATGAAAGGACGTAGATCAATATCGCCAACAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD129536             [                                        AGTTGTGGGATTAATTTACGATAATCAACATCTTCAGTAGACGTTGAGCACCATTGTTGAGTAGGATATAATGATTGGTTGATATTGTTGATAGTATTACTTGCGATGAAAGGACGTAGATCAATATCGCCAACAGAATCTATTGACGATGTTTCAACAGTCTGATTCTCCATTTTTATATTTTCAGTAGATAGTGCTTCTTTATTAAACTGAACAGGAGTTGGTACGTAAGGGTCTTTCGACAATGAATTAAACAAAGATGAACTTAATTTATCATCTGATGGCAAATTAACTGCGATTTCTTCTGTATTGCTTGGTGTCTCTTGATCAGGATTCAATATTGGCGGTGAGGATGATGATGATGATAATAAAGATGGTACAGGATGTGAAATATTTTCGGCATTTGATGTCACATTGATTGGTCTAGTCAATATAATTAATAGTTGATTTTCTACAGTGGCATCACACCCGGTTAACTGGAATTTCGATAACAAATTCACCGGTAATAGTATATCTTTTAAATGAGTATTTCCTATCAATGGATAGAGTAAACAATCATTTATACCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD178236             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccGCGATTTCTTCTGTATGNCTTGGTGTCTCTTGATCAGGATTCAATATTGGCGGTGAGGATGATGATGATGATAATAAAGATGGTACAGGATGTGAAATATTTTCGGCATTTGATGTCACATTGATTGGTCTAGTCAATATAATTAATAGTTGATTTTCTACAGTGGCATCACACCCGGTTAACTGGAATTTCGATAACAAATTCACCGGTAATAGTATATCTTTTAAATGAGTATTTCCTATCAATGGATAGAGTAAACAATCATTTATACCCTGAAAACGCGGTTCTAAGCTACCACATGCATTGATCTCTTTTAAATGATTAAATATATCTTTATAGATATGAGACATTTGTTTAGTTCTTGGTGTAACACGAAGTGCAAACAATTCTCTAGGATGTGTTGAATCTAACAATGTCTGTCCTAAATAGACTGGTAAACTGATTAAATTCACTCCACGACTAACAACGAGTGATGTTTGTTTACCTATTAATAAAGATTCCCATTGGATCATTTCATTTCTATCATTATTACTAGGATAATTTAATATTTTACG]


>consensus_5356#0 GTATACATTTTGTGATGTAGAGCATCCAGGATGAAAATGAAGTTGTGGGATTAATTTACG ATAATCAACATCTTCAGTAGACGTTGAGCACCATTGTTGAGTAGGATATAATGATTGGTT GATATTGTTGATAGTATTACTTGCGATGAAAGGACGTAGATCAATATCGCCAACAGAATC TATTGACGATGTTTCAACAGTCTGATTCTCCATTTTTATATTTTCAGTAGATAGTGCTTC TTTATTAAACTGAACAGGAGTTGGTACGTAAGGGTCTTTCGACAATGAATTAAACAAAGA TGAACTTAATTTATCATCTGATGGCAAATTAACTGCGATTTCTTCTGTATTGCTTGGTGT CTCTTGATCAGGATTCAATATTGGCGGTGAGGATGATGATGATGATAATAAAGATGGTAC AGGATGTGAAATATTTTCGGCATTTGATGTCACATTGATTGGTCTAGTCAATATAATTAA TAGTTGATTTTCTACAGTGGCATCACACCCGGTTAACTGGAATTTCGATAACAAATTCAC CGGTAATAGTATATCTTTTAAATGAGTATTTCCTATCAATGGATAGAGTAAACAATCATT TATACCCTGAAAACGCGGTTCTAAGCTACCACATGCATTGATCTCTTTTAAATGATTAAA TATATCTTTATAGATATGAGACATTTGTTTAGTTCTTGGTGTAACACGAAGTGCAAACAA TTCTCTAGGATGTGTTGAATCTAACAATGTCTGTCCTAAATAGACTGGTAAACTGATTAA ATTCACTCCACGACTAACAACGAGTGATGTTTGTTTACCTATTAATAAAGATTCCCATTG GATCATTTCATTTCTATCATTATTACTAGGATAATTTAATATTTTACG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)