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Schistosoma mansoni
cluster # 5392 cluster # 5392       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5392#0 length = 824 sequences # 3  

consensusID : consensus_5392#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 824
fasta sequence
                              [ACGAGGACCTTCCGTAAAGATAGTTTTTCAGTGCTGCACGTCTGCCAAACTCTTAATTGATGAAGGCGGTTCAGAGACAGCCATCAACAAAGGTCTTATAGCTTATGTAGCTTTTTTAAAAGATTGTTCTGATGAAGTTTTGCATAAAATTGCCGAGACAATTTGTACAGTCCGCCTGATATCTGACAGCAATAACAAACTCCGATCTGTGATTGATAGCCCTTGTGACTTACTGATTGTCCCTCAATTCTGTCTATCCGGGAAACTTAAAGGTAAATGTTTCCAGTATCACTCTGCCGTCTCGAAGGTGGCAGCTGAGTCCCTTTATTGCCGATTAGTTAAATTATGTGATACATTTTTAAGAAGTAGTGCTACATGGTTATCCAAGTCATGTAATTTTTCCTATGGAACATTCGGAATTCGCCAGATCTTAAGTCTAGAGACTAATGGTCCTTTCACTCATGTTGTTGAGCTGTAAATTGTATGTCTTCTAAAATGTTCTGATTCCCTAAATTTGTACTTCTTTGTATTATTTTTTTTCGTGATAGAATTTGATTTTTTAAAAACTTTAGTTAACGTAATATGATTGAAATAACGTGCAATGACAGACTTGGTAAGAAAGTACGCATTAAGTGTAACCCGACCGATAAAAGTTGGTGATCTANAAAAGCTGATTGCTGCTCAACTGGAACTACTGGGAGCGTATTGTACTAAAAAATGGTACCCATTTTTAAGATCATATACACTCCAGACTATGAATCATGATGGATGAACTAGACTGTATACATGACTGCTCANAATTGTCATTNTGTAATTCATACAAA]

[+] EMBL CD082111             [ACGAGGACCTTCCGTAAAGATAGTTTTTCAGTGCTGCATTTCTGCCAAACTCTTAATCGATGAAGGCGGTTCAGAGACAGCCATCAACAAAGGTCTTATAGCTTATGTAGCTTTTTTAAAAGATTGTTCTGATGAAGTTTTGCATAAAATTGCCGAGACAATTTGTACAGTCCGCCTGATATCTGACAGCAATAACAAACTCCGATCTGTGATTGATAGCCCTTGTGACTTACTGATTGTCCCTCAATTCTGTCTATCCGGGAAACTTAAAGGTAAATGTTTCCAGTATCACTCTGCCGTCTCGAAGGTGGCAGCTGAGTCCCTTTATTGCCGATTAGTTAAATTATGTGATACATTTTTAAGAAGTAGTGCTACATGGTTATCCAAGTCATGTAATTTTTCCTATGGAACATTCGGAATTCGCCAGATCTTAAGTCTAGAGACTAATGGTCCTTTCACTCATGTTGTTGAGCTGTAAATTGTATGTCTTCTAAAATGTTCTGATTCCCTAAATTTGTACTTCTTTGTATTATTTTTTTTCGTGATAGAATTTGATTTTTTAAAAACTTTAGTTAACGTAATATGATTGAAATAACGTGCAATGACAGACTTGGTAAGAAAGTACGCATTAAGTGTAACCCGACCGATAAAAGTTGGTGATCTANAAAAGCTGATTGCTGCTCAACTGGAACTACTGGGAGCGTATTGTACTAAAAAATGGTACCCATTTTTAAGATCATATACACTCCAGACTATGAATCATGATGGATGAACTAGACTGTATACATGACTGCTCANAATTGTCATTNTGTAATTCATACAAA]
[+] EMBL CD084245             [     ggtCTTCCGTAAAGATAGTTTTTCAGTGCTGCACGTCTGCCAAACTCTTAATTGATGAAGGCGGTTCAGAGACAGCCATCAACAAAGGTCTTATAGCTTATGTAGCTTTTTTAAAAGATTGTTCTGATGAAGTTTTGCATAAAATTGCCGAGACAATTTGTACAGTCCGCCTGATATCTGACAGCAATAACAAACTCCGATCTGTGATTGATAGCCTTTGTGACTTACTGATTGTCCCTCAATTCTGTCTATCCGGGAAACTTAAAGGTAAATGTTTCCAGTATCACTCTGCCGTCTCGAAGGTGGCAGCTGAGTCCCTTTATTGCCGATTAGTTAAATTATGTGATACATTTTTAAGAAGTAGTGCTACATGGTTATCCAAGTCATGTAATTTTTCCTATGGAACATTCGGAATTCGCCAGATCTTAAGTCTAGAGACTAATGGTCCTTTCACTCATGTTGTTGAGCTGTAAATTGTATGTCTTCTAAAATGTTCTGATTCCCTAAATTTGTACTTCTTTGTATTATTTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD077525             [                    TAGTTTTTCAGTGCTGCACGTCTGCCAAACTCTTAATTGATGAAGGCGGTTCAGAGACAGCCATCAACAAAGGTCTTATAGCTTATGTAGCTTTTTTAAAAGATTGTTCTGATGAAGTTTTGCATAAAATTGCCGAGACAATTTGTACAGTCCGCCTGATATCTGACAGCAATAACAAACTCCGATCTGTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_5392#0 ACGAGGACCTTCCGTAAAGATAGTTTTTCAGTGCTGCACGTCTGCCAAACTCTTAATTGA TGAAGGCGGTTCAGAGACAGCCATCAACAAAGGTCTTATAGCTTATGTAGCTTTTTTAAA AGATTGTTCTGATGAAGTTTTGCATAAAATTGCCGAGACAATTTGTACAGTCCGCCTGAT ATCTGACAGCAATAACAAACTCCGATCTGTGATTGATAGCCCTTGTGACTTACTGATTGT CCCTCAATTCTGTCTATCCGGGAAACTTAAAGGTAAATGTTTCCAGTATCACTCTGCCGT CTCGAAGGTGGCAGCTGAGTCCCTTTATTGCCGATTAGTTAAATTATGTGATACATTTTT AAGAAGTAGTGCTACATGGTTATCCAAGTCATGTAATTTTTCCTATGGAACATTCGGAAT TCGCCAGATCTTAAGTCTAGAGACTAATGGTCCTTTCACTCATGTTGTTGAGCTGTAAAT TGTATGTCTTCTAAAATGTTCTGATTCCCTAAATTTGTACTTCTTTGTATTATTTTTTTT CGTGATAGAATTTGATTTTTTAAAAACTTTAGTTAACGTAATATGATTGAAATAACGTGC AATGACAGACTTGGTAAGAAAGTACGCATTAAGTGTAACCCGACCGATAAAAGTTGGTGA TCTANAAAAGCTGATTGCTGCTCAACTGGAACTACTGGGAGCGTATTGTACTAAAAAATG GTACCCATTTTTAAGATCATATACACTCCAGACTATGAATCATGATGGATGAACTAGACT GTATACATGACTGCTCANAATTGTCATTNTGTAATTCATACAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)