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Schistosoma mansoni
cluster # 5408 cluster # 5408       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5408#0 length = 476 sequences # 3  

consensusID : consensus_5408#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 476
fasta sequence
                              [CGAATTATTTGACATTGAAATGTTGAAAATTCTTTTGATGAAACAATCCGACTGGTTAGTTTCAAGTAATGTAACTGATATTTCAAAACCAGTGGATTTATAATGCTCAGGAACGTTTAATTTCTCCGGCCAGTATAAATCACAAATAGTTTGACCATTATATTGAAGCCCTGTTAACATAACAATAAATGGACATTTATACATGTAAACCATATGCCAAAAGTCTCCAATTGTTTGTTTAAGTGGACCTTGTGTAGCAATAAATTCACAATGGTCATTTGCTCGTAGTAAAGTATCATCTGAAGACGGTACTTCAATAGATCTTATAAAATTAGCATTGATATAACCAGTCAAGTTTGTAGATAGCTCAGAAAATGTTACTGGATTCTGATCGTTTGTATTTTTTAAGACAATTCGTGTTTGGTCATAAGCTAATATATCATTATAACGATTTAAATAGTAATTCTGTGGATGAA]

[+] EMBL CD112325             [CGAATTATTTGACATTGAAATGTTGAAAATTCTTTTGATGAAACAATCCGACTGGTTAGTTTCAAGTAATGTAACTGATATTTCAAAACCAGTGGATTTATAATGCTCAGGAACGTTTAATTTCTCCGGCCAGTATAAATCACAAATAGTTTGACCATTATATTGAAGCCCTGTTAACATAACAATAAATGGACATTTATACATGTAAACCATATGCCAAAAGTCTCCAATTGTTTGTTTAAGTGGACCTTGTGTAGCAATAAATTCACAATGGTCATTTGCTCGTAGTAAAGTATCATCTGAAGACGGTACTTCAATAGATCTTATAAAATTAGCATTGATATAACCAGTCAAGTTTGTAGATAGCTCAGAAAATGTTACTGGATTCTGATCGTTTGTATTTTTTAAGACAATTCGTGTTTGGTCATAAGCTAATATATCATTATAACGATTTAAATAGTAATTCTGTGGATGAA]
[+] EMBL CD112415             [CGAATTATTTGACATTGAAATGTTGAAAATTCTTTTGATGAAACAATCCGACTGGTTAGTTTCAAGTAATGTAACTGATATTTCAAAACCAGTGGATTTATAATGCTCAGGAACGTTTAATTTCTCCGGCCAGTATAAATCACAAATAGTTTGACCATTATATTGAAGCCCTGTTAACATAACAATAAATGGACATTTATACATGTAAACCATATGCCAAAAGTCTCCAATTGTTTGTTTAAGTGGACCTTGTGTAGCAATAAATTCACAATGGTCATTTGCTCGTAGTAAAGTATCATCTGAAGACGGTACTTCAATAGATCTTATAAAATTAGCATTGATATAACCAGTCAAGTTTGTAGATAGCTCAGAAAATGTTACTGGATTCTGATCGTTTGTATTTTTTAAGACAATTCGTGTTTGGTCATAAGCTAATATATCATTATAAC                           ]
[+] EMBL CD112571             [CGAATTATTTGACATTGAAATGTTGAAAATTCTTTTGATGAAACAATCCGACTGGTTAGTTCCAAGTAATGTAACTGATATTTCAAAACCAGTGGATTTATAATGCTCAGGAACGTTTAATTTCTCCGGCCAGTATAAATCACAAATAGTTTGACCATTATATTGAAGCCCTGTTAACATAACAATAAATGGACATTTATACATGTAAACCATATGCCAAAAGTCTCCAATTGTTAGTTTAAGTGGACCTTGTGTAGCAATAAATTCACAATGGTCATTTGCTCGTAGTAAAGTATCATCTGAAGACGGTACTTCAATAGATCTTATAAAATTAGCATTGATATAACCAGTCAAGTTTGTAGATAGCTCAGAAAATGTTACTGGATTCTGATCGTTTGTATTTTTTAAGACAATTCGTGTTTGGTCATAAGCTAATATATCATTAT                              ]


>consensus_5408#0 CGAATTATTTGACATTGAAATGTTGAAAATTCTTTTGATGAAACAATCCGACTGGTTAGT TTCAAGTAATGTAACTGATATTTCAAAACCAGTGGATTTATAATGCTCAGGAACGTTTAA TTTCTCCGGCCAGTATAAATCACAAATAGTTTGACCATTATATTGAAGCCCTGTTAACAT AACAATAAATGGACATTTATACATGTAAACCATATGCCAAAAGTCTCCAATTGTTTGTTT AAGTGGACCTTGTGTAGCAATAAATTCACAATGGTCATTTGCTCGTAGTAAAGTATCATC TGAAGACGGTACTTCAATAGATCTTATAAAATTAGCATTGATATAACCAGTCAAGTTTGT AGATAGCTCAGAAAATGTTACTGGATTCTGATCGTTTGTATTTTTTAAGACAATTCGTGT TTGGTCATAAGCTAATATATCATTATAACGATTTAAATAGTAATTCTGTGGATGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)