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Schistosoma mansoni
cluster # 5410 cluster # 5410       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5410#0 length = 430 sequences # 3  

consensusID : consensus_5410#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 430
fasta sequence
                              [TATTCGTGTAGATTCAGCTTCAGCATTTGCCGGTGCAATTATTTCTCCGTATTATGATTCATTA-TTGGTTAAAATAATTGCACGGGCAAGTGATTTTCGTTTAGCTGCTAAAAAAATGCTACGCTCATTGGCGGAATTTCGTATACATGGTGTTAAAACAAACATTCCATTTCTTATGAATGTAATTAAACATGAACAATTTTTATCTGGGATTGTCGATACTAATTTTATTGATGAACATCCTGACTTGTTTGATTTACCTCCGGCTAAACAACGTGCCCAAAAATTATTACGTTATATCGGTAATATTATGATTAATGGACCATCTACTATGTTAGCTACACAACTTCCACCATCTGATATTGAACCAAAGGTACCAACAATTTCTTATGCCAATCATATTCCACGTGGTTGGCGTAATATGCTACTA]

[+] EMBL CD129328             [TATTCGTGTAGATTCAGCTTCAGCATTTGCCGGTGCAATTATTTCTCCGTATTATGATTCATTACTTGGTTAAAATAATTGCACGGGCAAGTGATTTTCGTTTAGCTGCTAAAAAAATGCTACGCTCATTGGCGGAATTTCGTATACATGGTGTTAAAACAAACATTCCATTTCTTATGAATGTAATTAACCATGAACAATTTTTATCTGGGATTGTCGATACTAATTTTATTGATGAACATCCTGACCTGTTTGATTTACCTCCGGCTAAACAACGTGCCCAGAAATTATTACGTTATATCGGCAATATTATGATTAATGGACCATCTACTATGTTAGCTACACAACTTCCACCGTCTGATATTGAACCAAAGGTACCAACAATTTCTTATGCCAATCATATTCCACGTGGTTGGCGTAATATGCTACTA]
[+] EMBL CD185434             [                                     ATTATTTCTCCGTATTATGATTCATTA TTGGTTAAAATAATTGCACGGGCAAGTGATTTTCGTTTAGCTGCTAAAAAAATGCTACACTCATTGGCGGAATTTCGTATACATGGTGTTAAAACAAACATTCCATTTCTTATGAATGTAATTAAACATGAACAATTTCTATCTGGGATTGTCGATACTAATTTTATTGATGAACATCCTGACTTGTTTGATTTACCTCCGGCTAAACAACGTGCCCAAAGATTATTACGTTATATCGGTAATATTATGATTAATGGACCATCTACTATGTTAGCTACACAACTTCCACCATCTGATATTGAACCAAAGGTACCAACAATTTCTTATGCCAATCATATTCCACGTGGTTGGCGTA           ]
[+] EMBL CD133766             [                                     ATTATTTCTCCGTATTATGATTCATTA TTGGTTAAAATAATTGCACGGGCAAGTGATTTTCGTTTAGCTGCTAAAAAAATGCTACGCTCATTGGCGGGATTTCGTATACATGGTGTTAAAACAAACATTCCATTTCTTATGAATGTAATTAAACATGAACAATTTTTATCTGGGATTGTCGATACTAATTTTATTGATGAACATCCTGACTTGTTTGATTTACCTCCGGCTAAACAACGTGCCCAAAAATTATTACGTTATATCGGTAATATTATGATTAATGGACCATCTACTATGTTAGCTACACAACTTCCACCATCTGATATTGAACCAAAGGTACCAACAATTTCTTATGCCAATCATATTCCACGTGGTTGGCGTA           ]


>consensus_5410#0 TATTCGTGTAGATTCAGCTTCAGCATTTGCCGGTGCAATTATTTCTCCGTATTATGATTC ATTATTGGTTAAAATAATTGCACGGGCAAGTGATTTTCGTTTAGCTGCTAAAAAAATGCT ACGCTCATTGGCGGAATTTCGTATACATGGTGTTAAAACAAACATTCCATTTCTTATGAA TGTAATTAAACATGAACAATTTTTATCTGGGATTGTCGATACTAATTTTATTGATGAACA TCCTGACTTGTTTGATTTACCTCCGGCTAAACAACGTGCCCAAAAATTATTACGTTATAT CGGTAATATTATGATTAATGGACCATCTACTATGTTAGCTACACAACTTCCACCATCTGA TATTGAACCAAAGGTACCAACAATTTCTTATGCCAATCATATTCCACGTGGTTGGCGTAA TATGCTACTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)