cluster # 5499

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Schistosoma mansoni
cluster # 5499 cluster # 5499 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5499#0 length = 603 sequences # 3

consensusID : consensus_5499#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 603
fasta sequence

                              [ATTGTTCATTATTTATTAGATTAGTATGATATTCCATATTTGATGATGGTAATGATGAAGATAATAATAAATTAGATGATGGCGATGATGAATGTAAATTATCCATAGATCCAAATGGATCATTAACCATTGCTTCATTATTACAATGATAGGATGAATTCATTGTTATTGTTCGATTAATAAAAGACATTCGTAAAATAGACCAATCATAATCATCTTTTTCTTGAAATGATAAAGAATTTTGTTTAGGATTAATCCAACTAATAGGATTGATTATTGAAGTATTAGTCTTTGAATAATCATTGGGATCTTGAACATCGTCAGTAGTAGTTGTTGTTGTATTACTATTAATAGAAGGAGTATTCAATGAAAGATTATATTGATGTTTTAATGGATCAATTAATTCAACAGCATAACCGATAGTTTTTAAATTTCCATTCCATGTTAATATAAATTGTCGACCTATTTCAATTAATTCTGGATGACGAGCAAAACGTAATAAAATGTAAGTTGTAGCGT-CTAAATGATTCTCATTATTATTCATTATATAATCTTTCAAGTTGTTCTGTTGTATTTCTTCTTCATGTTTACATTGATATATCC]

[+] EMBL CD088832             [ATTGTTCATTATTTATTAGATTAGTATGATATTCCATATTTGATGATGGTAATGATGAAGATAATAATAAATTAGATGATGGCGATGATGAATGTAAATTATCCATAGATCCAAATGGATCATTAACCATTGCTTCATTATTACAATGATAGGATGAATTCATTGTTATTGTTCGATTAATAAAAGACATTCGTAAAATAGACCAATCATAATCATCTTTTTCTTGAAATGATAAAGAATTTTGTTTAGGATTAATCCAGCTAATAGGATTGATTATTGAAGTATTAGTCTTTGAATAATCATTGGGATCTTGAACATCGTCAGTAGTAGTTGTTGTTGTATTACTATTAATAGAAGGAGTATTCAATGAAAGATTATATTGATGTTTTAATGGA                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD153448             [                                                                                                                                                                                                                                                  TGTTTAGGATTAATCCAACTAATAGGATTGATTATTGAAGTATTAGTCTTTGAATAATCATTGGAATCTTGAACATCGTCAGTAGTAGTTGTTGTTGTATTACTATTAATAGAAGGAGTATTCAATGAAAGATTATATTGATGTTTTGGTGGATCAATTAATTCAACAGCATAACCGATAGTTTTTAAATTTCCATTCCATGTTAATATAAATTGTCGACCTATTTCAATTAATTCTGGATGACGAGCAAAACGTAATAAAATGTAAGTTGTAGCGTGCTAAATGATTCTCATTATTATTCATTATATAATCTTTCAAGTTGTTCTGTTGTATTTCTTCTTCATGTTTACATTGATATATCC]
[-] EMBL CD153468             [                                                                                                                                                                                                                                                         GATTAATCCAACTAATAGGATTGATTATTGAAGTATTAGTCTNTGAATAACCATTGGGATCTTGAACATCGTCAGTAGTAGTTGTTGTTGTATTACTATTAATAGAAGGAGTATTCAATGAAAGATTATATTGATGTTTTAATGGATCAATTAATTCAACAGCATAACCGATAGTTTTTAAATATCCATTCCATGTTAATATAAATTGTCGACCTATTTCAATTAATTCTGGATGNCGAGCGCAACGCAACAAAAAATAAGGTGTATCAT CTTAATGATTCTCACTAATATTCCATATAAAATCTTTCAAGNTGTTCTGTTGTATTTCTTCTTCATGTTTACATTGATATATCC]




>consensus_5499#0
ATTGTTCATTATTTATTAGATTAGTATGATATTCCATATTTGATGATGGTAATGATGAAG
ATAATAATAAATTAGATGATGGCGATGATGAATGTAAATTATCCATAGATCCAAATGGAT
CATTAACCATTGCTTCATTATTACAATGATAGGATGAATTCATTGTTATTGTTCGATTAA
TAAAAGACATTCGTAAAATAGACCAATCATAATCATCTTTTTCTTGAAATGATAAAGAAT
TTTGTTTAGGATTAATCCAACTAATAGGATTGATTATTGAAGTATTAGTCTTTGAATAAT
CATTGGGATCTTGAACATCGTCAGTAGTAGTTGTTGTTGTATTACTATTAATAGAAGGAG
TATTCAATGAAAGATTATATTGATGTTTTAATGGATCAATTAATTCAACAGCATAACCGA
TAGTTTTTAAATTTCCATTCCATGTTAATATAAATTGTCGACCTATTTCAATTAATTCTG
GATGACGAGCAAAACGTAATAAAATGTAAGTTGTAGCGTCTAAATGATTCTCATTATTAT
TCATTATATAATCTTTCAAGTTGTTCTGTTGTATTTCTTCTTCATGTTTACATTGATATA
TCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case