cluster # 5619

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Schistosoma mansoni
cluster # 5619 cluster # 5619 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5619#0 length = 615 sequences # 3

consensusID : consensus_5619#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 615
fasta sequence

                              [ATGAGCGTAAAATAATGTGTAAAAGACAATAAGTGTATAGTAGGTGGTACAATAAGTAAGACTTATTGTGCGTGTGCATACTACGTATGGATGGATAGGTGCGAACAAGTCTTGAATATTGTCTGAATAATTGTTTAAATCACAGAGGATAAAATATAAAAGTGTTAATAATCACATAAC--ATAAAAACTGGAAAGGATCAAATATGTAAGCAAAAAAATGGAAGCCCCATGCTGAGTATGTATAATAATAGAAAACGACGACCAATTAATT-GTCAAGAAGCCAGATAATAAAGTTTGTTACATGATGGGTGTTCTTCAAATTATAACATGCCTTCT-ACGTTTCCTGATTGTCTTCGATGTGATCGTCCGGAATGTCTAGATCTATTATGATTAGATACAGCACTGTAATTATCTGTTTGTAATTGTTTTCGATGTTTAGAAC-TGGATTTGTATTGATTGTGATCAACCTTGTCTTCAGTAAGCGTTACAGTTTGTTCATCATCGTTCTCTTCTGAATGATATGGCTGTTTCTTTTTAAAATGAGGGGAATTCAAAGGGCCCAGTTGATCGGATCGTTTCAGTCTATCTGCTTCCTGATTATGGTGGCTTTTAGGC]

[-] EMBL CD063962             [ATGAGCGTAAAATAATGTGTAAAAGACAATAAGTGTATAGTAGGTGGTACAATAAGTAAGACTTATTGTGCGTGTGCATACTACGTATGGATGGATAGGTGCGAACAAGTCTTGAATATTGTCTGAATAATTGTTTAAATCACAGAGGATAAAATATAAAAGTGTTAATAATCACATAAC  ATAAAAACTGGAAAGGATCAAATATGTAAGCAAAAAAATGGAAGCCCCATGCTGAGTATGTATAATAATAGAAAACGACGACCAATTAATT GTCAAGAAGCCAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD196990             [                                                                                                                                                            TAAAAGTGTTAATAATCACATAACAAATAAAAACTGGAAAGGATCAAATATGTAAGCAAAAAAATGGAAGCCCCATGCTGAGTATGTATAATAATAGAAAACGACGACCAATTAATTGGTCAAGAAGCCAGATAATAAAGTTTGTTACATGATGGGTGTTCTTCAAATTATAACATGCCTTCT ACGTTTCCTGATTGTCTTCGATGTGATCGTCCGGAATGTCTAGATCTATTATGATTAGATACAGCACTGTAATTATCTGTTTGTAATTGTTTTCGATGTTTAGAAC TGGATTTGTATTGATTGTGATCAACCTTGTCTTCAGTAAGCGTTACAGTTTGTT                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD063374             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCCTTCTCACGTTTCCTGATTGTCTTCGATGTGATCGTCCGGAATGTCTAGATCTATTATGATTAGATACAGCACTGTAATTATCTGTTTGTAATTGTGTTCGATGTTTAGAACATGGATTTGGATTGATTGTGATCAACCTTGTCTTCAGTAAGCGTTACAGTTTGTTCATCATCGTTCTCTTCTGAATGATATGGCTGTTTCTTTTTAAAATGAGGGGAATTCAAAGGGCCCAGTTGATCGGATCGTTTCAGTCTATCTGCTTCCTGATTATGGTGGCTTTTAGGC]




>consensus_5619#0
ATGAGCGTAAAATAATGTGTAAAAGACAATAAGTGTATAGTAGGTGGTACAATAAGTAAG
ACTTATTGTGCGTGTGCATACTACGTATGGATGGATAGGTGCGAACAAGTCTTGAATATT
GTCTGAATAATTGTTTAAATCACAGAGGATAAAATATAAAAGTGTTAATAATCACATAAC
ATAAAAACTGGAAAGGATCAAATATGTAAGCAAAAAAATGGAAGCCCCATGCTGAGTATG
TATAATAATAGAAAACGACGACCAATTAATTGTCAAGAAGCCAGATAATAAAGTTTGTTA
CATGATGGGTGTTCTTCAAATTATAACATGCCTTCTACGTTTCCTGATTGTCTTCGATGT
GATCGTCCGGAATGTCTAGATCTATTATGATTAGATACAGCACTGTAATTATCTGTTTGT
AATTGTTTTCGATGTTTAGAACTGGATTTGTATTGATTGTGATCAACCTTGTCTTCAGTA
AGCGTTACAGTTTGTTCATCATCGTTCTCTTCTGAATGATATGGCTGTTTCTTTTTAAAA
TGAGGGGAATTCAAAGGGCCCAGTTGATCGGATCGTTTCAGTCTATCTGCTTCCTGATTA
TGGTGGCTTTTAGGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case