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Schistosoma mansoni
cluster # 5646 cluster # 5646       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5646#0 length = 939 sequences # 3  

consensusID : consensus_5646#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 939
fasta sequence
                              [TTCGGCACGAGGGACAAACGAAAATAGTCATGATGATTCCAGTCAAATTTTGGAAAGCCATGTGCCAAATAACTCGTCTTCCTCTTCTAATCCACATTCTGGTGCAACAAATAACGAAAGATCCTCTCAAGGTTAGGTTGTAGTTATTATTTTTTACTGCACTATTTTGAATGCTTTAGAACTTATATATGATTAAGCCACTTTGGTTTATACTTATAAATTGTGAATTCCAAGTTGCGCAATATATTGGTCACTCTTAAATCACCTTGGATTCAGTCAAGTGTTTTGTTATAATTTCCAAACTGCCAGTAGTAAATCCAAGTGCTTATTAATTTATGTTTACCGACCAGTCGTCAATTCACAGTAGGCGGAATTTGTTTTTCTCCATCATGCATCTCGGTGTTTTTAATACATTGGAAAATTATGGGATCGATGAAATTGGTCTTCAACACTTCAAATCAGTTATGTAGCGGATCGTTTATGCTCTTTTTTCATTATATTATGAAGTAAATCAACGTAGTTACTCCAAATATCCTAATTGCTCCTAGGTTATTTGATGCGCTAAATGAGTATTCTAAGTATTACATAAACTGCATGATACTAAGTTAACCTCTAACTGATTTATTGATTCTTTACTTCCAGATTTGAGCAAAGGATCTACTTCTAGCAGCGATCGGAGACGTAAACAAGCATCTGAGAGTGAAAGACAGAAAGCGTATGATTCATGGCTAGCTGAATTTAACAATGAACTACAGAAGTATGAATCATTTGAATTGAGTATAGAAAATCAGGCCCTACCAACAGATGATCATTAAATTGTCAAGCTACACATCCTTCATAAATTTTAGTATCCTTTATTTTCTACTTATTATTTATACCATTTAAGATATTATTTGTTATTTATTTAATTTAAACACGTACATATTTACATAATACAAA]

[+] EMBL CD079736             [TTCGGCACGAGGGACAAACGAAAATAGTCATGATGATTCCAGTCAAATTTTGGAAAGCCATGTGCCAAATAACTCGTCTTCCTCTTCTAATCCACATTCTGGTGCAACAAATAACGAAAGATCCTCTCAAGGTTAGGTTGTAGTTATTATTTTTTACTGCACTATTTTGAATGCTTTAGAACTTATATATGATTAAGCCACTTTGGTTTATACTTATAAATTGTGAATTCCAAGTTGCGCAATATATTGGTCACTCTTAAATCACCTTGGATTCAGTCAAGTGTTTTGTTATAATTTCCAAACTGCCAGTAGTAAATCCAAGTGCTTATTAATTTATGTTTACCGACCAGTCGTCAATTCACAGTAGGCGGAATTTGTTTTTCTCCATCATGCATCTCGGTGTTTTTAATACATTGGAAAATTATGGGATCGATGAAATTGGTCTTCAACACTTCAAATCAGTTATGTAGCGGATCGTTTATGCTCTTTTTTCATTATATTATGAAGTAAATCAACGTAGTTACTCCAAATATCCTAATTGCTCCTAGGTTATTTGATGCGCTAAATGAGTATTCTAAGTATTACATAAACTGCATGATACTAAGTTAACCTCTAACTGATTTATTGATTCTTTACTTCCAGATTTGAGCAAAGGATCTACTTCTAGCAGCGATCGGAGACGTAAACAAGCATCTGA                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD079737             [               ccACGAAAATAGTCATGATGATTCCAGTCAAATTTTGGAAAGCCATGTGCCAACTAACTCGTCTTCCTCTTCTAATCCACATTCTGGTGCAACAAATAACGAAAGATCCTCTCAAGGTTAGGTTGTAGTTATTATTTTTTACTGCACTATCCTGAATGCTTTAGAACTTATATATGATTAAGCCACTCNGGTTTATACTTATAAATTGTGAATNCCAAGCTGCGCAATATATTGGTCACTCTTAAATCACCTTGGATTCANNCNAGGGNNTTGTTATTATTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD073993             [                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTCAAGTGTTTTGTTA AATTTCCAAACTGCCAGTAGTAAATCCAAGTGCTTATTAATTTATGTTTACCGACCAGTCGTCAATTCACAGTAGGCGGAATTTGTTTTTCTCCATCATGCATCTCGGTGTTTTTAATACATTGGAAAATTATGGGATCGATGAAATTGGTTTTCAACACTTCAAATCAGTTATGTAGCGGATCGTTTATGCTCTTTTTTCATTATATTATGAAGTAAATCAACGTAGTTACTCCAAATATCCTAATTGCTCCTAGGTTATTTGATGCGCTAAATGAGTATTTTAAGTATTACATAAACTGCATGATACTAAGTTAACCTCTAACTGATTTATTGATTCTTTACTTCCAGATTTGAGCAAAGGATTTACTTTTAGCAGCGATCGGAGACGTAAACAAGCATTTGAGAGTGAAAGACAGAAAGCGTATGATTCATGGCTAGCTGAATTTAACAATGAACTACAGAAGTATGAATCATTTGAATTGAGTATAGAAAATCAGGCCCTACCAACAGATGATCATTAAATTGTCAAGCTACACATCCTTCATAAATTTTAGTATCCTTTATTTTCTACTTATTATTTATACCATTTAAGATATTATTTGTTATTTATTTAATTTAAACACGTACATATTTACATAATACAAA]


>consensus_5646#0 TTCGGCACGAGGGACAAACGAAAATAGTCATGATGATTCCAGTCAAATTTTGGAAAGCCA TGTGCCAAATAACTCGTCTTCCTCTTCTAATCCACATTCTGGTGCAACAAATAACGAAAG ATCCTCTCAAGGTTAGGTTGTAGTTATTATTTTTTACTGCACTATTTTGAATGCTTTAGA ACTTATATATGATTAAGCCACTTTGGTTTATACTTATAAATTGTGAATTCCAAGTTGCGC AATATATTGGTCACTCTTAAATCACCTTGGATTCAGTCAAGTGTTTTGTTATAATTTCCA AACTGCCAGTAGTAAATCCAAGTGCTTATTAATTTATGTTTACCGACCAGTCGTCAATTC ACAGTAGGCGGAATTTGTTTTTCTCCATCATGCATCTCGGTGTTTTTAATACATTGGAAA ATTATGGGATCGATGAAATTGGTCTTCAACACTTCAAATCAGTTATGTAGCGGATCGTTT ATGCTCTTTTTTCATTATATTATGAAGTAAATCAACGTAGTTACTCCAAATATCCTAATT GCTCCTAGGTTATTTGATGCGCTAAATGAGTATTCTAAGTATTACATAAACTGCATGATA CTAAGTTAACCTCTAACTGATTTATTGATTCTTTACTTCCAGATTTGAGCAAAGGATCTA CTTCTAGCAGCGATCGGAGACGTAAACAAGCATCTGAGAGTGAAAGACAGAAAGCGTATG ATTCATGGCTAGCTGAATTTAACAATGAACTACAGAAGTATGAATCATTTGAATTGAGTA TAGAAAATCAGGCCCTACCAACAGATGATCATTAAATTGTCAAGCTACACATCCTTCATA AATTTTAGTATCCTTTATTTTCTACTTATTATTTATACCATTTAAGATATTATTTGTTAT TTATTTAATTTAAACACGTACATATTTACATAATACAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)