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Schistosoma mansoni
cluster # 5651 cluster # 5651       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5651#0 length = 1019 sequences # 3  

consensusID : consensus_5651#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1019
fasta sequence
                              [CGAGCCAANATTCGGCACGAGGATTTTTGGTTCAGTTCGACTAGTAAATGCGATAAATTTGGATGAATTGGAAAATCGTTTGATTAGCGCGAAACAGGCTTTGGATCAACTTGAAATTGAAGTTCAAGAACGTATAAACCGTTGGAGTCGTATTGAAGCCTTAACTGGTCACTTTATACACACAGATATTCATAATCAATATGCGAAAAGTACCATTTGTGAAACGACAAAGTCAATTCATTGCTCAATGGATATGTATAGATATTGTAATGGTAGTATGAAGTCTAGTGATTCTGATCGTCTGTCATCTATGATTGAAGAAACTTCTCTAGAATCTAATCGTTTTTCTAAATCTACTAGTAATGGTTTGGTGAATGATTTCGATTGTACTCATAATAAAGAAATTTTCAACTTGAAAGATTCTTTTCAATCAAACAGTGAAACCGCTGATACCTTCAGGACAAGTTTACCACGAAATTATTCTTTTGTTCGACCATTTGCTACTTTATGGAGACGTAAGACAAAATCTGGCCGAGGTAAAGCAGATTCTAAACAATAATTATATAGAATTTTTTTCCTCAGAGTAATACACTTATTTTAATTTCTATCTTCTTTCACTATTTATCTTCATAAGATGTCAAGCTGAATCTTTAAGATGACATGATTAGATTCTTTGTTACTTCCTGTT-AATATATATACGTATAACCTTAGCATACATTCCTTTAATCAGTAATGCGTCTTTCTATTAGATTGTATGTTTGAATCTAAAGGGAAATTGTTCGACTGAAATTATTGTGTCTAAAGGTTTTGTGCAATGTTGGCTTTATTATCAAACGGAACTTTATCATTTATTTACCTTGACCTGTTTACTTCAATCTTCTGACTGTCATAGTACTTTACATTTGCTATAATATACCTATATTTGTTTTCCTCTTTTGTTTGTACTTTCATAATATTACCCAGGTTGGTAATAAATTTAACTGTGTTAAGGGCATTTATATTTATTTTAATTAAATTTT]

[+] EMBL CD080017             [CGAGCCAANATTCGGCACGAGGATTTTTGGTTCAGTTCGACTAGTAAATGCGATAAATTTGGATGAATTGGAAAATCGTTTGATTAGCGCGAAACAGGCTTTGGATCAACTTGAAATTGAAGTTCAAGAACGTATAAACCGTTGGAGTCGTATTGAAGCCTTAACTGGTCACTTTATACACACAGATATTCATAATCAATATGCGAAAAGTACCATTTGTGAAACGACAAAGTCAATTCATTGCTCAATGGATATGTATAGATATTGTAATGGTAGTATGAAGTCTAGTGATTCTGATCGTCTGTCATCTATGATTGAAGAAACTTCTCTAGAATCTAATCGTTTTTCTAAATCTACTAGTAATGGTTTGGTGAATGATTTCGATTGTACTCATAATAAAGAAATTTTCAACTTGAAAGATTCTTTTCAATCAAACAGTGAAACCGCTGATACCTTCAGGACAAGTTTACCACGAAATTATTCTTTTGTTCGACCATTTGCTACTTTATGGAGACGTAAGACAAAATCTGGCCGAGGTAAAGCAGATTCTAAACAATAATTATATAGAATTTTTTTCCTCAGAGTAATACACTTATTTTAATTTCTATCTTCTTTCACTATTTATCTTCATAAGATGTCAAGCTGAATCTTTAAGATGACATGATTAGATTCTTTGTTACTTCCTGTT AATATATATACGTATAACCTTAGCATACATTCCTTTAATCAGTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD077687             [                                                                                                                                                                                                         gGCGAAAAGTACCATTTGTGAAACGACAAAGTCAATTCATTGCTCAATGGATATGTATAGATATTGTAATGGTAGTATGAAGTCTAGTGATTCTGATCGTCTGTCATCTATGATTGAAGAAACTTCTCTAGAATCTAATCGTTTTTCTAAATCTACTAGTAATGGTTTGGTGAATGATTTCGATTGTACTCATAATAAAGAAATTTTCAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD077191             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTGCTACTTTATGGAGACGTAAGACAAAATCTGGCCGAGGTAAAGCAGATTCTAAACAATAATTATATAGAATTTTTTTCCTCAGAGTAATACACTTATTTTAATTTCTATCTTCTTTCACTATTTATCTTCATAAGATGTCAAGCTGAATCTTTAAGATGACATGATTAGATTCTTTGTTACTTCCTGTTAAATATATATACGTATAACCTTAGCATACATTCCTTTAATCAGTAATGCGTCTTTCTATTAGATTGTATGTTTGAATCTAAAGGGAAATTGTTCGACTGAAATTATTGTGTCTAAAGGTTTTGTGCAATGTTGGCTTTATTATCAAACGGAACTTTATCATTTATTTACCTTGACCTGTTTACTTCAATCTTCTGACTGTCATAGTACTTTACATTTGCTATAATATACCTATATTTGTTTTCCTCTTTTGTTTGTACTTTCATAATATTACCCAGGTTGGTAATAAATTTAACTGTGTTAAGGGCATTTATATTTATTTTAATTAAATTTT]


>consensus_5651#0 CGAGCCAANATTCGGCACGAGGATTTTTGGTTCAGTTCGACTAGTAAATGCGATAAATTT GGATGAATTGGAAAATCGTTTGATTAGCGCGAAACAGGCTTTGGATCAACTTGAAATTGA AGTTCAAGAACGTATAAACCGTTGGAGTCGTATTGAAGCCTTAACTGGTCACTTTATACA CACAGATATTCATAATCAATATGCGAAAAGTACCATTTGTGAAACGACAAAGTCAATTCA TTGCTCAATGGATATGTATAGATATTGTAATGGTAGTATGAAGTCTAGTGATTCTGATCG TCTGTCATCTATGATTGAAGAAACTTCTCTAGAATCTAATCGTTTTTCTAAATCTACTAG TAATGGTTTGGTGAATGATTTCGATTGTACTCATAATAAAGAAATTTTCAACTTGAAAGA TTCTTTTCAATCAAACAGTGAAACCGCTGATACCTTCAGGACAAGTTTACCACGAAATTA TTCTTTTGTTCGACCATTTGCTACTTTATGGAGACGTAAGACAAAATCTGGCCGAGGTAA AGCAGATTCTAAACAATAATTATATAGAATTTTTTTCCTCAGAGTAATACACTTATTTTA ATTTCTATCTTCTTTCACTATTTATCTTCATAAGATGTCAAGCTGAATCTTTAAGATGAC ATGATTAGATTCTTTGTTACTTCCTGTTAATATATATACGTATAACCTTAGCATACATTC CTTTAATCAGTAATGCGTCTTTCTATTAGATTGTATGTTTGAATCTAAAGGGAAATTGTT CGACTGAAATTATTGTGTCTAAAGGTTTTGTGCAATGTTGGCTTTATTATCAAACGGAAC TTTATCATTTATTTACCTTGACCTGTTTACTTCAATCTTCTGACTGTCATAGTACTTTAC ATTTGCTATAATATACCTATATTTGTTTTCCTCTTTTGTTTGTACTTTCATAATATTACC CAGGTTGGTAATAAATTTAACTGTGTTAAGGGCATTTATATTTATTTTAATTAAATTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)