Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5811 cluster # 5811       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5811#0 length = 850 sequences # 3  
consensusID : consensus_5811#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 850
fasta sequence 
                              [CCGAGGCCAAAATTCGGCACGAGGCTTTTTTCCATCCGACCTTGGAGTTCATTTCCTCCATCAGGGTGGTCAGTTGGTTTCCTGGGAATTTGTTTATGACATACCGGAGTCTCAATCTAGTCTTTAATATCCCCATCAATGGTGGGTGCGTAGCACTGGATGACATTCATTTCAATCCCTTCTTTATTTAGAAGAATCCTTTGGTGATCAATTAACCATAACGTTCCCATCGTATAAGTGCCTTTCTCGCTTCTTTGGCGAGGGTCATTGTAACTCCTTATGTATGGTGGGGTGCATTTTCTTCATGATCAGTGCAGAATAACGATTCTCCCTAAGCTATTCTCTCATTTCCAGCTTCTGTTCAATGTGTTTCACCTATTACAAGCGGAGCCATGTTGTATCTTCTAATTTCTGCCGGCTTTCGAACAACTCTCTCGGATTCTTACACTGTCCGGACATTCTATGTAGCTACATTAATTGTCGCTCTTGTTATCAGAAGAGGGGTTTTGGAGAATTTGATTGTCAAGGTTCTTCTTTACGGGATGTGGTTGCTAACCCCATCCCTAACCCTTCCTCCTCCGGGCTTGAAACTAGTTGTAACCCTAGTAGGGTTTTAAAAGGAGTTTAAATTTGACTACGGTGGCTGAGATGAACACTTCGGTAACAAAATGCTTCACTTATCCATAATGGGCAGAAGTGATGGCTCATGTGAAGTATCTTTCAACTCTTGTTCAACAAAAACACTGAACTATCTTTTATTGTGTTAACATTCCTTCAGGTTATACATTTATAAACCTCCATGTTTCAGACTGTGATCTTTCATACCTTAATAGTGTTATATATTACATGT]

[+] EMBL CD080432             [CCGAGGCCAAAATTCGGCACGAGGCTTTTTTCCATCCGACCTTGGAGTTCATTTCCTCCATCAGGGTGGTCAGTTGGTTTCCTGGGAATTTGTTTATGACATACCGGAGTCTCAATCTAGTCTTTAATATCCCCATCAATGGTGGGTGCGTAGCACTGGATGACATTCATTTCAATCCCTTCTTTATTTAGAAGAATCCTTTGGTGATCAATTAACCATAACGTTCCCATCGTATAAGTGCCTTTCTCGCTTCTTTGGCGAGGGTCATTGTAACTCCTTATGTATGGTGGGGTGCATTTTCTTCATGATCAGTGCAGAATAACGATTCTCCCTAAGCTATTCTCTCATTTCCAGCTTCTGTTCAATGTGTTTCACCTATTACAAGCGGAGCCATGTTGTATCTTCTAATTTCTGCCGGCTTTCGAACAACTCTCTCGGATTCTTACACTGTCCGGACATTCTATGTAGCTACATTAATTGTCGCTCTTGTTATCAGAAGAGGGGTTTTGGAGAATTTGATTGTCAAGGTTCTTCTTTACGGGATGTGGTTGCTAACCCCATCCCTAACCCTTCCTCCTCCGGGCTTGAAACTAGTTGTAACCCTAGTAGGGTTTTAAAAGGAGTTTAAATTTGACTACGGTGGCTGAGATGAACACTTCGGTAACANAATGCTTCACTTATCCATAATGGGCAGAAGTGATGG                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD074524             [                                                                                                                                                                                                AGAATCCTTTGGTGATCAATTAACCATAACGTTCCCATCGTATAAGTGCCTTTCTCGCTTCTTTGGCGAGGGTCATTGTAACTCCTTATGTATGGTGGGGTGCATTTTCTTCATGATCAGTGCAGAATAACGATTCTCCCTAAGCTATTCTCTCATTTCCAGCTTCTGTTCAATGTGTTTCACCTATTACAAGCGGAGCCATGTTGTATCTTCTAATTTCTGCCGGCTTTCGAACAACTCTCTCGGATTCTTACACTGTCCGGACATTCTATGTAGCTACATTAATTGTCGCTCTTGTTATCAGAAGAGGGGTTTTGGAGAATTTGATTGTCAAGGTTCTTCTTTACGGGATGTGGTTGCTAACCCCATCCCTAACCCTTCCTCCTCCGGGCTTGAAACTAGTTGTAACCCTAGTAGGGTTTTAAAAGGAGTTTAAATTTGACTACGGTGGCTGAGATGAACACTTCGGTAACAAAATGCTTCACTTATCCATAATGGGCAGAAGTGATGGCTCATGTGAAGTATCTTTCAACTCTTGTTCAACAAAAACACTGAACTATCTTTTATTGTGTTAACATTCCTTCAGGTTATACATTTATAAACCTCCATGTTTCAGACTGTGATCTTTCATACCTTAATAGTGTTATATATTACATGT]
[-] EMBL CD074345             [                                                                                                                                                                                                            TGATCAATTAACCATAACGTTCCCATCGTATAAGTGCCTTTCTCGCTTCTTTGGCGAGGGTCATTGTAACTCCTTATGTATGGTGGGGTGCATTTTCTTCATGATCAGTGCAGAATAACGATTCTCCCTAAGCTATTCTCTCATTTCCAGCTTCTGTTCAATGTGTTTCACCTATTACAAGCGGAGCCATGTTGTATCTTCTAATTTCTGCCGGCTTTCGAACAACTCTCTCGGATTCTTACACTGTCCGGACATTCTATGTAGCTACATTAATTGTCGCTCTTGTTATCAGAAGAGGGGTTTTGGAGAATTTGATTGTCAAGGTTCTTCTTTACGGGATGTGGTTGCTAACCCCATCCCTAACCCTTCCTCCTCCGGGCTTGAAACTAGTTGTAACCCTAGTAGGGTTTTAAAAGGAGTTTAAATTTGACTACGGTGGCTGAGATGAACACTTCGGTAACAAAATGCTTCACTTATCCATAATGGGCAGAAGTGATGGCTCATGTGAAGTATCTTTCAACTCTTGTTCAACAAAAACACTGAACTATCTTTTATTGTGTTAACATTCCTTCAGGTTATACATTTATAAACCTCCATGTTTCAGACTGTGATCTTTCATACCTTAATAGTGTTATATATTACATGT]




>consensus_5811#0
CCGAGGCCAAAATTCGGCACGAGGCTTTTTTCCATCCGACCTTGGAGTTCATTTCCTCCA
TCAGGGTGGTCAGTTGGTTTCCTGGGAATTTGTTTATGACATACCGGAGTCTCAATCTAG
TCTTTAATATCCCCATCAATGGTGGGTGCGTAGCACTGGATGACATTCATTTCAATCCCT
TCTTTATTTAGAAGAATCCTTTGGTGATCAATTAACCATAACGTTCCCATCGTATAAGTG
CCTTTCTCGCTTCTTTGGCGAGGGTCATTGTAACTCCTTATGTATGGTGGGGTGCATTTT
CTTCATGATCAGTGCAGAATAACGATTCTCCCTAAGCTATTCTCTCATTTCCAGCTTCTG
TTCAATGTGTTTCACCTATTACAAGCGGAGCCATGTTGTATCTTCTAATTTCTGCCGGCT
TTCGAACAACTCTCTCGGATTCTTACACTGTCCGGACATTCTATGTAGCTACATTAATTG
TCGCTCTTGTTATCAGAAGAGGGGTTTTGGAGAATTTGATTGTCAAGGTTCTTCTTTACG
GGATGTGGTTGCTAACCCCATCCCTAACCCTTCCTCCTCCGGGCTTGAAACTAGTTGTAA
CCCTAGTAGGGTTTTAAAAGGAGTTTAAATTTGACTACGGTGGCTGAGATGAACACTTCG
GTAACAAAATGCTTCACTTATCCATAATGGGCAGAAGTGATGGCTCATGTGAAGTATCTT
TCAACTCTTGTTCAACAAAAACACTGAACTATCTTTTATTGTGTTAACATTCCTTCAGGT
TATACATTTATAAACCTCCATGTTTCAGACTGTGATCTTTCATACCTTAATAGTGTTATA
TATTACATGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)