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Schistosoma mansoni
cluster # 5832 cluster # 5832       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5832#0 length = 1085 sequences # 3  

consensusID : consensus_5832#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1085
fasta sequence
                              [CGAGCCTTTAATTCGGCACCAGGCGCTTAACATGGGGTAATGATCTTTGCTGGGGTGGACGTCGTGTCATACATCTTTTCCTTCTTGGTAATGTCCCATCTAATAATGAACGTTTAAAATACATATTAAAAAATGAGTCCTATGTATATCATGATATAATTCAACAAGATTTTCTTGATCACTATTATAATAGTACATATAAAATTATGTTTGGTATTAATTGGGCAGTAAAATATTGTTCAAATGTCCCAATTATTATGTTTGTTGATGATGATTATTTTATCTATCCAAAAAAATGTGGTTGCTTATATTGAAGGTTTAAGCACCGAGCTACGTAAACTTTTGATCAGTGGTTATGTTTGGTATAATGCTGGACCAGTTCGTAAGAATATCGGCAGTCACGATAAGTGGTTGGTTGATGACAAAGAATATGCTCCGCGTTATTATCCTCCATATGTGGCAGGGGGTAATTTTTTTTTATCAATGAATTTGGCACGTCAATTAAATATAGCTATGCGTTACACAAAATATCTTCGGTTTGATGATGTCTACCTTGGAATAATACTTAAGAAGTTATTACATGTACCGATGCATTTAAAAAAAGTCTACACATTCCACCCTGTAAATTTAAATTCATCTGAGATATATGAAATGATTTCTAGTCATGGCTTTGGCAAATCTGTTTCACAATTCTTCTTATGGGACCGCTTAAAATGTTCAACATTNTGTGTACACTCTATTGTTTAATTTACCATTTGTTTTTCTTCTTTTATACTATTAGAACAATACTTATGACGTTTCTCTTCTTTTTTTTAATCATCCTTCCTGGATCTATCCAATTATCAGTCAAGATAAAATGGTAGACAGTTTTACAGGAAACTTTGTCATTNTTATTCGCCTTTTGTTG-GGTGTGGGTATCACCTGTCTTAATCATTTGTATTCTAAATG-ACATACTTTTACTATTATCTGATATATGAAACAAGAAANATG-TCATTCTTGATA-TTACTC-AATGCTCCCACTTATCG-TACC-ATACTACTTTTGAT-AAATTTCTGATAGACT-AATATA-TTATTGATC-AAAGATATTTA]

[+] EMBL CD081815             [CGAGCCTTTAATTCGGCACCAGGCGCTTAACATGGGGTAATGATCTTTGCTGGGGTGGACGTCGTGTCATACATCTTTTCCTTCTTGGTAATGTCCCATCTAATAATGAACGTTTAAAATACATATTAAAAAATGAGTCCTATGTATATCATGATATAATTCAACAAGATTTTCTTGATCACTATTATAATAGTACATATAAAATTATGTTTGGTATTAATTGGGCAGTAAAATATTGTTCAAATGTCCCAATTATTATGTTTGTTGATGATGATTATTTTATCTATCCAAAAAAATGTGGTTGCTTATATTGAAGGTTTAAGCACCGAGCTACGTAAACTTTTGATCAGTGGTTATGTTTGGTATAATGCTGGACCAGTTCGTAAGAATATCGGCAGTCACGATAAGTGGTTGGTTGATGACAAAGAATATGCTCCGCGTTATTATCCTCCATATGTGGCAGGGGGTAATTTTTTTTTATCAATGAATTTGGCACGTCAATTAAATATAGCTATGCGTTACACAAAATATCTTCGGTTTGATGATGTCTACCTTGGAATAATACTTAAGAAGTTATTACATGTACCGATGCATTTAAAAAAAGTCTACACATTCCACCCTGTAAATTTAAATTCATCTGAGATATATGAAATGATTTCTAGTCATGGCTTTGGCAAATCTGTTTCACAATTCTTCTTATGGGACCGCTTAAAATGTTCAACATTNTGTGTACACTCTATTGTTTAATTTACCATTTGTTTTTCTTCTTTTATACTATTAGAACAATACTTATGACGTTTCTCTTCTTTTTTTTAATCATCCTTCCTGGATCTATCCAATTATCAGTCAAGATAAAATGGTAGACAGTTTTACAGGAAACTTTGTCATTNTTATTCGCCTTTTGTTG GGTGTGGGTATCACCTGTCTTAATCATTTGTATTCTAAATG ACATACTTTTACTATTATCTGATATATGAAACAAGAAANATG TCATTCTTGATA TTACTC AATGCTCCCACTTATCG TACC ATACTACTTTTGAT AAATTTCTGATAGACT AATATA TTATTGATC AAAGAT     ]
[-] EMBL CD193026             [                                                                        ATCTTTTCCTTCTTGGTAATGTCCCATCTAATAATGAACGTTTAAAATACATATTAAAAAATGAGTCNTATGTATATCATGATATAATTCAACAAGATTCTCTTGATCACTATTATAATAGTACATATAAAATTATGTTTGGTATTAATTGGGCAGTAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD075546             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATAATGCTGGACCAGTTCGTAAGAATATCGGCAGTCACGATAAGTGGTTGGTTGATGACAAAGAATATGCTCCGCGTTATTATCCTCCATATGTGGCAGGGGGTAATTTTTTTTTATCAATGAATTTGGCACGTCAATTAAATATAGCTATGCGTTACACAAAATATCTTCGGTTTGATGATGTCTACCTTGGAATAATACTTAAGAAGTTATTACATGTACCGATGCATTTAAAAAAAGTCTACACATTCCACCCTGTAAATTTAAATTCATCTGAGATATATGAAATGATTTCTAGTCATGGCTTTGGCAAATCTGTTTCACAATTCTTCTTATGGGACCGCTTAAAATGTTCAACATTTTGTGTACACTCTATTGTTTAATTTACCATTTGTTTTTCTTCTTTTATACTATTAGACCAATACTTATGACGTTTCTCTTCTTTTTTTTAATCATCCTTCCTGGATCTATCCAATTATCAGTCAAGATAAAATGGTAGACAGTTTTACAGGAAACTTTGTCATTTTTATTCGCCTTTTGTTGTTGT TGGGTATCACCTGTCTTAATCATTTGTATTCTAATTGTACATACTTTTACTATTATCTGATATATGAAACAAGAAA ATGTTCATTCTTGATATTTACTCAAATGCTCCCACTTATCGTTACCAATACTACTTTTGATAAAATTTCTGATAGACTAAATATATTTATTGGTCAAAAGA ATTTA]


>consensus_5832#0 CGAGCCTTTAATTCGGCACCAGGCGCTTAACATGGGGTAATGATCTTTGCTGGGGTGGAC GTCGTGTCATACATCTTTTCCTTCTTGGTAATGTCCCATCTAATAATGAACGTTTAAAAT ACATATTAAAAAATGAGTCCTATGTATATCATGATATAATTCAACAAGATTTTCTTGATC ACTATTATAATAGTACATATAAAATTATGTTTGGTATTAATTGGGCAGTAAAATATTGTT CAAATGTCCCAATTATTATGTTTGTTGATGATGATTATTTTATCTATCCAAAAAAATGTG GTTGCTTATATTGAAGGTTTAAGCACCGAGCTACGTAAACTTTTGATCAGTGGTTATGTT TGGTATAATGCTGGACCAGTTCGTAAGAATATCGGCAGTCACGATAAGTGGTTGGTTGAT GACAAAGAATATGCTCCGCGTTATTATCCTCCATATGTGGCAGGGGGTAATTTTTTTTTA TCAATGAATTTGGCACGTCAATTAAATATAGCTATGCGTTACACAAAATATCTTCGGTTT GATGATGTCTACCTTGGAATAATACTTAAGAAGTTATTACATGTACCGATGCATTTAAAA AAAGTCTACACATTCCACCCTGTAAATTTAAATTCATCTGAGATATATGAAATGATTTCT AGTCATGGCTTTGGCAAATCTGTTTCACAATTCTTCTTATGGGACCGCTTAAAATGTTCA ACATTNTGTGTACACTCTATTGTTTAATTTACCATTTGTTTTTCTTCTTTTATACTATTA GAACAATACTTATGACGTTTCTCTTCTTTTTTTTAATCATCCTTCCTGGATCTATCCAAT TATCAGTCAAGATAAAATGGTAGACAGTTTTACAGGAAACTTTGTCATTNTTATTCGCCT TTTGTTGGGTGTGGGTATCACCTGTCTTAATCATTTGTATTCTAAATGACATACTTTTAC TATTATCTGATATATGAAACAAGAAANATGTCATTCTTGATATTACTCAATGCTCCCACT TATCGTACCATACTACTTTTGATAAATTTCTGATAGACTAATATATTATTGATCAAAGAT ATTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)