cluster # 5897

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Schistosoma mansoni
cluster # 5897 cluster # 5897 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5897#0 length = 575 sequences # 3

consensusID : consensus_5897#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 575
fasta sequence

                              [CAGATTTACGCTCGGAAGCAATGAAACAGGATTCAACATTGGGAATACCATCTAATGAAATAGCTAAACGTGCTGATGTATTAGAAAAAGAGATTTATCATTTGTTATCAGTTGCCCAGGAATGTGCTGATGGTAATGCTCAATCATTGGAGCATCAACAAAATGTAATCATAGCAGCTGAAAATCTAGTGAATACAGCTCATGCAACAGCTGCACCAATTATTCGATCACGTCTTACAAAAGGATTGGAATTCGCTACTCGACTTACAGCAGATAATGTAGGTCCATTAGCTACAGTCGGTGGAGAAGTTGTACGTATTTGTCAAAATGATACATATCAGTTGGCTTCGGATTTAGAACAATTACAAAAACGTGTAATGCCTCAAGTGAAT-TTATCTTGTAACATTGCTCGTGTTCAACCGTATGATGT-AAAAAATCAAGCTAATTTACTTGCTGCATCGCAGAATTTAATGAAGTGCCTAGAAGATTTATTGCGATCAGCTGATGCAGTTGCACCAACAATTGAAGATTCCGGTGTCCAGTCGGCATTAACTGATGTGACACGAAACACTCAT]

[+] EMBL CD122643             [CAGATTTACGCTCGGAAGCAATGAAACAGGATTCAACATTGGGAATACCATCTAATGAAATAGCTAAACGTGCTGATGTATTAGAAAAAGAGATTTATCATTTGTTATCAGTTGCCCAGGAATGTGCTGATGGTAATGCTCAATCATTGGAGCATCAACAAAATGTAATCATAGCAGCTGAAAATCTAGTGAATACAGCTCATGCAACAGCTGCACCAATTATTCGATCACGTCTTACAAAAGGATTGGAATTCGCTACTCGACTTACAGCAGATAATGTAGGTCCATTAGCTACAGTCGGTGGAGAAGTTGTACGTATTTGTCAAAATGATACATATCAGTTGGCTTCGGATTTAGAACAATTACAAAAACGTGTAATGCCTCAAGTGAAT TTATCTCGTAACATTGCTCGTGTTCAACCGTATGATGT AAAAAATCAAGCTAATTTACTTGCTGCATCGCAGAATTTAATGAAGTGCCTAGAAGATTTATTGCGATCAGCTGATGCAGTTGCACCAACAATTGAAGATTCCGGTGTCCAG                                 ]
[+] EMBL CD182206             [                                                      ATGAAATAGCTAAACGTGCTGATGTATTAGAAAAAGAGATTTATCATTTGTTATCAGTTGCCCAGGAATGTGCTGATGGTAATGCTCAATCATTGGAGCATCAACAAAATGTAATCATAGCAGCTGAAAATCTAGTGAATACAGCTCATGCAACAGCTGCACCAATTATTCGATCACGTCTTACAAAAGGATTGGAATTCGCTACTCGACTTACAGCAGATAATGTAGGTCCATTAGCTACAGTCGGTGGAGAAGTTGTACGTATTTGTCAAAATGATACATATCAGTTGGCTTCGGATTTAGAACAATTACAAAAACGTGTAATGCCTCAAGTGAATNNTATCTTGT ACATTGCTCGTGTTCAACCGTATGATGT AAAAAATCAAGCNNTATTACTTGCTGCATCGCAGAATTT                                                                                                          ]
[-] EMBL CD195574             [                                                                                                                                                                                                                  CTGCACCAATTATTCGATCACGTCTTACAAAAGGATTGGAATTCGCTACTCGACTTACAGCAGATAATGTAGGTCCATTAGCTACAGTCGGTGGAGAAGTTGTACGTATTTGTCAAAATGATACATATCAGTTGGCTTCGGATTTAGAACAATTACAAAAACGTGTAATGCCTCAAGTGAAT TTATCTTGTAACATTGCTCGTGTTCAACCGTATGATGTAAAAAAATCAAGCTAATTTACTTGCTGCATCGCGGAATTTAATGAAGTGCCTAGAAGATTTATTGCGATCAGCTGATGCAGTTGCACCAACAATTGAAGATTCCGGTGTCCAGTCGGCATTAACTGATGTGACACGAAACACTCAT]




>consensus_5897#0
CAGATTTACGCTCGGAAGCAATGAAACAGGATTCAACATTGGGAATACCATCTAATGAAA
TAGCTAAACGTGCTGATGTATTAGAAAAAGAGATTTATCATTTGTTATCAGTTGCCCAGG
AATGTGCTGATGGTAATGCTCAATCATTGGAGCATCAACAAAATGTAATCATAGCAGCTG
AAAATCTAGTGAATACAGCTCATGCAACAGCTGCACCAATTATTCGATCACGTCTTACAA
AAGGATTGGAATTCGCTACTCGACTTACAGCAGATAATGTAGGTCCATTAGCTACAGTCG
GTGGAGAAGTTGTACGTATTTGTCAAAATGATACATATCAGTTGGCTTCGGATTTAGAAC
AATTACAAAAACGTGTAATGCCTCAAGTGAATTTATCTTGTAACATTGCTCGTGTTCAAC
CGTATGATGTAAAAAATCAAGCTAATTTACTTGCTGCATCGCAGAATTTAATGAAGTGCC
TAGAAGATTTATTGCGATCAGCTGATGCAGTTGCACCAACAATTGAAGATTCCGGTGTCC
AGTCGGCATTAACTGATGTGACACGAAACACTCAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case