cluster # 5899

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Schistosoma mansoni
cluster # 5899 cluster # 5899 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5899#0 length = 676 sequences # 3

consensusID : consensus_5899#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 676
fasta sequence

                              [TTTCAGCTCCATGTTTTGATCCTAATGTGGGACATGAGTTCTTGAATGAATTACAATCACTATTGCGCAATAACTGTTATTCAAACGGTATGAAGGCAAGTGATCATCAACCAACTGCAATGCAAATTTTAAGTCATGAGAAGAATAGTTCATTGTATACATGCTTGGGCAGTTCAAAATCATCATTATTGAAAATTAATCCAAACAATCAATTAACAACTCCTTTACTTGGTATGCGTAATTCAGTTGATAAGTTATTGTGTCCAGAAGTGATTAAGAAAAATTCAGTGGATGCTAGTAAACCAAAACATTCACAAAAATCATTTTATCATTCATTAGCAGAGACATCTATGAGTCGAATTTCAAAGGATTCCATAAATAATAACAATACTGTTAATACTACTACCACTACTACTGTATTCTCTCCTAATTTTTTACATTCACTTCA-TTGTTCAGTAAAAAATCCTAATATTCAAAATTCAACGTTAAATTCTTTATTGTTGGTATGTAGTCAACCATGTACAACAATGTCAATTGATTCAGAATTATCGACGTTAACTTCATCGACATGTAGTACTCACAAACAGCAACAATATCCATCAGTTGAAACATCCGTATCGCATCCTTCAAGTCCTTTATTCAAATATCGACATCCAATGGATGATCACAAATTTTC]

[+] EMBL CD152288             [TTTCAGCTCCATGTTTTGATCCTAATGTGGGACATGAGTTCTTGAATGAATTACAATCACTATTGCGCAATAACTGTTATTCAAACGGTATGAAGGCAAGTGATCATCAACCAACTGCAATGCAAATTTTAAGTCATGAGAAGAATAGTTCATTGTATACATGCTTGGGCAGTTCAAAATCATCATTATTGAAAATTAATCCAAACAATCAATTAACAACTCCTTTACTTGGTATGCGTAATTCAGTTGATAAGTTATTGTGTCCAGAAGTGATTAAGAAAAATTCAGTGGATGCTAGTAAACCAAAACATTCACAAAAATCATTTTATCATTCATTAGCAGAGACATCTATTAGTCGAATTTCAAAGGATTCCATAAATAATAACAATACTGTTAATACTACTACCACTACTACTGTATTCTCTCCTAATTTTTTACATTCAC TCATTTGTTCAGTAAAAAATCCTAATATTCAAAATTCAACGTTCAATTC                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD152248             [                                                                                                                                                                                                                  AATTAACAACTCCTTTACTTGGTATGCGTAATTCAGTTGATAAGTTATTGTGTCCAGAAGTGATTAAGAAAAATTCAGTGGATGCTAGTAAACCTAAACATTCACAAAAATCACTTTATCATTCATTAGCAGAGACATCTATGAGTCGAATTTCAAAGGATTCCATAAATAATAACAATACTGTTAATACTACTACCACTACTACTGTATTCTCTCCTAATTTTTTACATTCACTTCA TTGTTCAGTAAAAAATCCTAATATTCAAAATTCAACGTTAAATTCTTTATTGTTGGTATGTAGTCAACCATGTACAACAATGTCAATTGATTCAGAATTATCGACGTTAACTTCATCGACATGTAGTACTCACAAACAGCAACAATATCCATCAGTTGAAACATCCGTATCGCATCCTTCAAGTCCTTTATTCAAATATCGACATCCAATGGATGATCACAAATTTTC]
[-] EMBL CD152339             [                                                                                                                                                                                                                         AACTCCTTTACTTGGTATGCGTAATTCAGTTGATAAGTTATTGTGTCCAGAAGTGATTAAGAAAAATTCAGTGGATGCTAGTAAACCAAAACATTCACAAAAATCATCTTATCATTCATTAGCAGAGACATCTATGAGTCGAATTTCAAAGGATTCCATAAATAATAACAATACTGTTAATACTACTACCACTACTACTGTATTCTCTCCTAATTTTTTACATTCACTTCA TTGTTCAGTAAAAAATCCTATTATTCAAAATTCAACGTTAAATTCTTTATTGTTGGTATGTAGTCAACCATGTACAACAATGTCAATTGATTCAGAATTATCGACGTTAACTTCATCGACATGTAGTACTCACAAACAGCAACAATATCCATCAGTTGAAACATCCGTATCGCATCCTTCAAGTCCTTTATTCAACTATCGACATCCAATGGATGATCACAAATTTTC]




>consensus_5899#0
TTTCAGCTCCATGTTTTGATCCTAATGTGGGACATGAGTTCTTGAATGAATTACAATCAC
TATTGCGCAATAACTGTTATTCAAACGGTATGAAGGCAAGTGATCATCAACCAACTGCAA
TGCAAATTTTAAGTCATGAGAAGAATAGTTCATTGTATACATGCTTGGGCAGTTCAAAAT
CATCATTATTGAAAATTAATCCAAACAATCAATTAACAACTCCTTTACTTGGTATGCGTA
ATTCAGTTGATAAGTTATTGTGTCCAGAAGTGATTAAGAAAAATTCAGTGGATGCTAGTA
AACCAAAACATTCACAAAAATCATTTTATCATTCATTAGCAGAGACATCTATGAGTCGAA
TTTCAAAGGATTCCATAAATAATAACAATACTGTTAATACTACTACCACTACTACTGTAT
TCTCTCCTAATTTTTTACATTCACTTCATTGTTCAGTAAAAAATCCTAATATTCAAAATT
CAACGTTAAATTCTTTATTGTTGGTATGTAGTCAACCATGTACAACAATGTCAATTGATT
CAGAATTATCGACGTTAACTTCATCGACATGTAGTACTCACAAACAGCAACAATATCCAT
CAGTTGAAACATCCGTATCGCATCCTTCAAGTCCTTTATTCAAATATCGACATCCAATGG
ATGATCACAAATTTTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case