Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 592 cluster # 592       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_592#0 length = 791 sequences # 2  

consensusID : consensus_592#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 791
fasta sequence
                              [AGGCCATAATTCGGCACGCAGGNATTTGATCAATTTAAATTAAGAGGAATATATCATAAATGGTTACCTTATATTTATTCTCAAAGACCATGTAGTTTAAGTTGTTATTCATTACAAAGTGGTCAAATTCTTGATGCATCAATGTCAGTTAGAGATTCAACGCCATGTACATATGATAATCCTGATGCACGTTGTATACAATCAGTTTGTATTAATTTCGACTGTTTTGGTCAGGTAAATGGCACTGCTAGAAGAGATCAATGTGGAGTTTGCCAGGGGAATAATTCAACTTGTACTTTTATACAACATAGAATTCAAAGAGTTCTTCCATTGAATGAAGAATATCGTATGCTATACGTGATTCCACGATATGCAAGACATTTAAAAATTTCAAAGAATTACGGTAATCATGTATTAGGCCTATTCGACATGCAACATTTCCAATTCTTTCTAAAAGGTGATGAATTAGAACTGGACACTAAATTAAGACGTGTTTATTTTGCAACAGAGTTTGTATTTGATCCAGGGAATCCAATGAGTAAATCAGCCGACAGTTTCATTCAAATTCAAACAAAAGGAACAATTTATGGGGATGTCGCTATTCAAGCCAGAAATCTAAACATTCATGAAAATCTCGATCCCTTAGATGTGGAAATAAGCTATGTTCTACCATTAAGTAATGACCACTAATTTCTGGAAATTGTTAACAATGCTGCAAATGTACTTAAACATTATTTCAGAAGTATAAAAAATACAACAAAATATATTTTGGTCATTTGTAGA-CCCATGTT]

[+] EMBL CD081155             [AGGCCATAATTCGGCACGCAGGNATTTGATCAATTTAAATTAAGAGGAATATATCATAAATGGTTACCTTATATTTATTCTCAAAGACCATGTAGTTTAAGTTGTTATTCATTACAAAGTGGTCAAATTCTTGATGCATCAATGTCAGTTAGAGATTCAACGCCATGTACATATGATAATCCTGATGCACGTTGTATACAATCAGTTTGTATTAATTTCGACTGTTTTGGTCAGGTAAATGGCACTGCTAGAAGAGATCAATGTGGAGTTTGCCAGGGGAATAATTCAACTTGTACTTTTATACAACATAGAATTCAAAGAGTTCTTCCATTGAATGAAGAATATCGTATGCTATACGTGATTCCACGATATGCAAGACATTTAAAAATTTCAAAGAATTACGGTAATCATGTATTAGGCCTATTCGACATGCAACATTTCCAATTCTTTCTAAAAGGTGATGAATTAGAACTGGACACTAAATTAAGACGTGTTTATTTTGCAACAGAGTTTGTATTTGATCCAGGGAATCCAATGAGTAAATCAGCCGACAGTTTCATTCAAATTCAAACAAAAGGAACAATTTATGGGGATGTCGCTATTCAAGCCAGAAATCTAAACATTCATGAAAATCTCGATCCCTTAGATGTGGAAATAAGCTATGTTCTACCATTAAGTAATGACCACTAATTTCTGGAAATTGTTAACAATGCTGCAAATGTACTTAAACATTATTTCAGAAGTATAAAAAATACAACAAAATATATTTTGGTCATTTGTAGA CCCATGTT]
[-] EMBL CD074971             [                                                                                                                                                              AACGCCATGTACATATGATAATCCTGATGCACGTTGTATACAATCAGTTTGTATTAATTTCGACTGTTTTGGTCAGGTAAATGGCCCTGCTAGAAGAGATCAATGTGGAGTTTGCCAGGGGAATAATTCAACTTGTACTTTTATACAACATAGAATTCAAAGAGTTTTTCCATTGAATGAAGAATATCGTATGCTATACGTGATTCCCCGATATGCAAGCCATTTAAAAATTTCAAAGAATTTCGGTAATCATGTATTAGGCCTATTTGACATGCAACATTTCCAATTTTTTTTAAAAGGGGATGAATTAGAACTGGCCCCTAAATTAAGACGTGTTTATTTTGCAACAGAGTTTGTATTTGATCCAGGGAATCCAATGAGTAAATCAGCCGCCAGTTTCATTCAAATTCAAACAAAAGGAACAATTTATGGGGATGTCGCTATTCAAGCCAGAAATTTAAACATTCATGAAAATTTCGATCCCTTAGATGTGGAAATAAGCTATGTTTTCCCATTAAGTAATGACCCCTAATTTTTGGAAATTGTTAACAATGCTGCAAATGTACTTAAACATTATTTCAGAAGTATAAAAAATCCAACAAAAGAAATTTTGGTCATTTGTAGACCCCATGTT]


>consensus_592#0 AGGCCATAATTCGGCACGCAGGNATTTGATCAATTTAAATTAAGAGGAATATATCATAAA TGGTTACCTTATATTTATTCTCAAAGACCATGTAGTTTAAGTTGTTATTCATTACAAAGT GGTCAAATTCTTGATGCATCAATGTCAGTTAGAGATTCAACGCCATGTACATATGATAAT CCTGATGCACGTTGTATACAATCAGTTTGTATTAATTTCGACTGTTTTGGTCAGGTAAAT GGCACTGCTAGAAGAGATCAATGTGGAGTTTGCCAGGGGAATAATTCAACTTGTACTTTT ATACAACATAGAATTCAAAGAGTTCTTCCATTGAATGAAGAATATCGTATGCTATACGTG ATTCCACGATATGCAAGACATTTAAAAATTTCAAAGAATTACGGTAATCATGTATTAGGC CTATTCGACATGCAACATTTCCAATTCTTTCTAAAAGGTGATGAATTAGAACTGGACACT AAATTAAGACGTGTTTATTTTGCAACAGAGTTTGTATTTGATCCAGGGAATCCAATGAGT AAATCAGCCGACAGTTTCATTCAAATTCAAACAAAAGGAACAATTTATGGGGATGTCGCT ATTCAAGCCAGAAATCTAAACATTCATGAAAATCTCGATCCCTTAGATGTGGAAATAAGC TATGTTCTACCATTAAGTAATGACCACTAATTTCTGGAAATTGTTAACAATGCTGCAAAT GTACTTAAACATTATTTCAGAAGTATAAAAAATACAACAAAATATATTTTGGTCATTTGT AGACCCATGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)